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Schistosoma mansoni
cluster # 4892 cluster # 4892       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4892#0 length = 1126 sequences # 3  

consensusID : consensus_4892#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1126
fasta sequence
                              [TTTGTCTAAGTTNTCTGTCTATTTCGATAGTCAACTGCAGCGGTAGTAGTGGCATAGTTTGTCATTTCTTTTGGCAGTATACTATCATCATGATTATCAGTAGATATCAATTTGATTCGTGGATCATCTATTATATTCAAGTGTTTTAAATTTGATCGTCCATTTACAACAATTAATGAATTATCACCAGATATAACTTCACTATTAACTGATATACCATCTAAATATTGTTTCAATAATAATTTTAACTGAATATTTTCTTGTTCTAACATATTGTATTCTTTAATTATTGCTAAACGATCTAATTGAACTTTATTAAATCTTTTCCAAAACATTTCAAGTGGAAGGCATCGTTTTATTATCTTTGCTATTTCTTCATTCTGTTCACTTTCGAACGATTCTTGCACAAAACTTTCTTCTTCCGCTGATAAAGATGATGCATAGAATGGTGTAACTTTTTCCTCTTCTGTCTCATACTTTCTGCACTGTTCACCTAACTTGATAATTTTCTCTGCTTTTTCTAATAAACATTGAAGCTTTTTTATAGCATCCCCACTTTCAACTGACAATTTAATCAATTTTTCATGTTGTAGGTCACGTAATTTATTGATTTGTATCTTCAAGGCTTGGAATCGAACAACTAACTTATCACGTTCTTCTTTTAAGTTATGATTTTTTTCTTCATATTCCTTAGATGTTTTTATCATACGACGTTTAGTAGCCGCTATATTATCATTGATTTTTTGGATTTTGTTTAAGTGTAATTGAATTTCAGCAGCTGAACGTTCATCTTTTGCTTTTAAGTTTTCAAAAAATGTCTTTTTTTCACTGGTAGTTGTTGCGTATTGGGTGGAAGCCTGTTTGAATTCAGACCACAAACTATTGACCTTATTCTCCAAATTTATTCTCAATGTATGTTTTTCTTCCAAACTTTTATTCTTCAAATCATCTTTCAAACTAGTCTGATCAATTATAGCTTCATGTGCTTTGGCAGTATATGTAGAATCCAGTGCAACAAATATATTTTTTAAGTCATTGACTTGTTTATCGTGTTGTTGCTTAGTAAAGTTTTCTTCTTTTAAGAATTCTTCTACCAAAGAGTGTAATTCCTTTTCATAATTAGTTT]

[-] EMBL CD078622             [TTTGTCTAAGTTNTCTGTCTATTTCGATAGTCAACTGCAGCGGTAGTAGTGGCATAGTTTGTCATTTCTTTTGGCAGTATACTATCATCATGATTATCAGTAGATATCAATTTGATTCGTGGATCATCTATTATATTCAAGTGTTTTAAATTTGATCGTCCATTTACAACAATTAATGAATTATCACCAGATATAACTTCACTATTAACTGATATACCATCTAAATATTGTTTCAATAATAATTTTAACTGAATATTTTCTTGTTCTAACATATTGTATTCTTTAATTATTGCTAAACGATCTAATTGAACTTTATTAAATCTTTTCCAAAACATTTCAAGTGGAAGGCATCGTTTTATTATCTTTGCTATTTCTTCATTCTGTTCACTTTCGAACGATTCTTGCACAAAACTTTCTTCTTCCGCTGATAAAGATGATGCATAGAATGGTGTAACTTTTTCCTCTTCTGTCTCATACTTTCTGCACTGTTCACCTAACTTGATAATTTTCTCTGCTTTTTCTAATAAACATTGAAGCTTTTTTATAGCATCCCCACTTTCAACTGACAATTTAATCAATTTTTCATGTTGTAGGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD128720             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AATTTTTTCTGCTTTTTCTAATAAACATTGCCGCTTTTTTATAGCATCCCCACTTTCAACTGACAATTTAATCAATTTTTCATGTTGTAGGTCACGTAATTTATTGATTTGTATCTTCAAGGCTTGGAATCGAACAACTAACTTATCACGTTCTTCTTTTAAGTTATGATTTTTTTCTTCATATTCCTTAGATGTTTTTATCATACGACGTTTAGTAGCCGCTATATTATCATTGATTTTTTGGATTTTGTTTAAGTGTAATTGAATTTCAGCAGCTGAACGTTCATCTTTTGCTTTTAAGTTTTCAAAAAATGTCTTTTTTTCACTGGTAGTTGTTGCGTATTGGGTGGAAGCCTGTTTGAATTCAGACCACAAACTATTGACCTTATTCTCCAAATTTATTCTCAATGTATGTTTTTCTTCCAAACTTTTATTCTTCAAATCATCTTTCAAACTAGTCTGATCAATTATAGCTTCATGTGCTTTGGCAGTATATGTAGAATCCAGTGCAACAAATATATTTTTTAAGTCATTGACTTGTTTATCGTGTTGTTGCTTAGTAAAGTTTTCTTCTTTTAAGAATTCTTCTACCAAAGAGTGTAATTCCTTTTCATAATTAGTTT]
[-] EMBL CD185187             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAGTGTAATTGAATTTCAGCAGCTGAACGTTCATCTTTTGCTTTTAAGTTTTCAAAAAATGTCTTTTTTTCACTGGTAGTTGTTGCGTATTGGGTGGAAGCCTGTTTGAATTCAGACCACAAACTATTGACCTTATTCTCCAAATTTATTCTCAATGTATGTTTTTCTTCCAAACTTTTATTCTTCAAATCATCTTTCAAACTAGTCTGATCAATTATAGCTTCATGTGCTTTGGCAGTATATGTAG                                                                                                                           ]


>consensus_4892#0 TTTGTCTAAGTTNTCTGTCTATTTCGATAGTCAACTGCAGCGGTAGTAGTGGCATAGTTT GTCATTTCTTTTGGCAGTATACTATCATCATGATTATCAGTAGATATCAATTTGATTCGT GGATCATCTATTATATTCAAGTGTTTTAAATTTGATCGTCCATTTACAACAATTAATGAA TTATCACCAGATATAACTTCACTATTAACTGATATACCATCTAAATATTGTTTCAATAAT AATTTTAACTGAATATTTTCTTGTTCTAACATATTGTATTCTTTAATTATTGCTAAACGA TCTAATTGAACTTTATTAAATCTTTTCCAAAACATTTCAAGTGGAAGGCATCGTTTTATT ATCTTTGCTATTTCTTCATTCTGTTCACTTTCGAACGATTCTTGCACAAAACTTTCTTCT TCCGCTGATAAAGATGATGCATAGAATGGTGTAACTTTTTCCTCTTCTGTCTCATACTTT CTGCACTGTTCACCTAACTTGATAATTTTCTCTGCTTTTTCTAATAAACATTGAAGCTTT TTTATAGCATCCCCACTTTCAACTGACAATTTAATCAATTTTTCATGTTGTAGGTCACGT AATTTATTGATTTGTATCTTCAAGGCTTGGAATCGAACAACTAACTTATCACGTTCTTCT TTTAAGTTATGATTTTTTTCTTCATATTCCTTAGATGTTTTTATCATACGACGTTTAGTA GCCGCTATATTATCATTGATTTTTTGGATTTTGTTTAAGTGTAATTGAATTTCAGCAGCT GAACGTTCATCTTTTGCTTTTAAGTTTTCAAAAAATGTCTTTTTTTCACTGGTAGTTGTT GCGTATTGGGTGGAAGCCTGTTTGAATTCAGACCACAAACTATTGACCTTATTCTCCAAA TTTATTCTCAATGTATGTTTTTCTTCCAAACTTTTATTCTTCAAATCATCTTTCAAACTA GTCTGATCAATTATAGCTTCATGTGCTTTGGCAGTATATGTAGAATCCAGTGCAACAAAT ATATTTTTTAAGTCATTGACTTGTTTATCGTGTTGTTGCTTAGTAAAGTTTTCTTCTTTT AAGAATTCTTCTACCAAAGAGTGTAATTCCTTTTCATAATTAGTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)