cluster # 4950

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4950 cluster # 4950 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4950#0 length = 664 sequences # 3

consensusID : consensus_4950#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 664
fasta sequence

                              [TAGCCAGACATTTCTTCGCATTTAGCAAGAGGTTTTCGCTTGTTGATGATAAACATTTGGATGCTTTGGCGTGTTTCAGTCATACAGCATTTAGTTCAAATACTTGAGTGGTGTCGTTACGGGCATCATAAAAGTGCATTTCAAATAGAATCCCCAC-ATGTGCA-GTTGGTCGTCTTTCGTGTGGCGTCGATATCACTGTCGTTATAAATAAATTTCGAATAACAAACTGCACTATGCAGAGCGATTCTGGACCCTTTTATGTGCTACATCTTTATAGAGAACTCCGTCCCACTATTTATTGTATTGCATTGTCTTGTAATAATACTGTCCTGGTCCTCAAGGCATGTTCGTTGTTTTTTTCATTCCACTAAAAGAAAGTCTATTTTAGTTCATGGCACTAATTCCTAGTTGTGTGTTCATTCTTTTTAAGTTGTAAATGAATCATTGATTTTGTGTAATGAATGTAAAATAATAGTTGGATTTCTAATTACCCGTCACCAAACACCTACATTGATGTGTAATGTCATTGGATAACTTGTACATTTCTCGTTGCTTTTTAAAGGCTTCGTTTCATTTTAATTCGGTTACATTTGCTTTGGCTTGGATTTTTAGCAATATTGGACTGGTTATGAAATGTAATTCTACTCAATTGTACTGTTTTGTA]

[-] EMBL CD194313             [TAGCCAGACATTTCTTCGCATTTAGCAAGAGGTTTTCGCTTGTTGATGATAAACATTTGGATGCTTTGGCGTGTTTCAGTCATACAGCATTTAGTTCAAATACTTGAGTGGTGTCGTTACGGGCATCATAAAAGTGCATTTCAAATAGAATCCCCAC ATGTGCA GTTGGTCGTCTTTCGTGTGGCGTCGATATCACTGTCGTTATAAATAAATTTCGAATAACAAACTGCACTATGCAGAGCGATTCTGGACCCTTTTATGTGCTACATCTTTATAGAGAACTCCGTCCCACTATTTATTGTATTGCATTGTCTTGTAATAATACTGTCCTGGTCCTCAAGGCATGTTCGTTGTTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD140870             [                                                                                                                                                    AATCCCCACTATGTGCATGTTGGTCGTCTTTCGTGTGGCGTCGATATCACTGTCGTGATTGATAAATCCCGAGTGACAAACTGCACTATGCAGAGCGATTCTGGACCCTTTTATGTGCTACATCTTTATAGAGAACTCCGTCCCACTATTTATTGTATTGCATTGTCTTGTAATAATACTGTCCTGGTCCTCAAGGCATGTTCGTTGTTTTTTTCATTCCACTAAAAGAAAGTCTATTTTAGTTCATGGCACTAATTCCTAGTTGTGTGTTCATTCTTTTTAAGTTGTAAATGAATCATTGATTTTGTGTAATGAATGTAAAATAATAGTTGGATTTCTAATTACCCGTCACCAAACACCTACATTGATGTGTAATGTCATTGGATAACTTGTACATTTCTCGTTGCTTTTTAAAGGCTTCGTTTCATTTTAATTCGGTTACATTTGCTTTGGCTTGGATTTTTAGCAATATTGGACTGGTTA                                   ]
[-] EMBL CD140786             [                                                                                                                                                                                                                                                       TCTGGACCCTTTTATGTGCTACATCTTTATAGAGAACTCCGTCCCACTATTTATTGTATTGCATTGTCTTGTAATAATACTGTCCTGGTCCTCAAGGCATGTTCGTTGTTTTTTTCATTCCACTAAAAGAAAGTCTATTTTAGTTCATGGCACTAATTCCTAGTTGTGTGTTCATTCTTTTTAAGTTGTAAATGAATCATTGATTTTGTGTATTGAATGTAAAATAATAGTTGGATTTCTAATTACCCGTCACCAAACACCTACATTGATGTGTAATGTCATTGGATAACTTGTACATTTCTCGTTGCTTTTTAAAGGCTTCGTTTCATTTTAATTCGGTTATATTTGCTTTGGCTTGGATTTTTAGCAATATTGGACTGGTTATGAAATGTAATTCTACTCAATTGTACTGTTTTGTA]




>consensus_4950#0
TAGCCAGACATTTCTTCGCATTTAGCAAGAGGTTTTCGCTTGTTGATGATAAACATTTGG
ATGCTTTGGCGTGTTTCAGTCATACAGCATTTAGTTCAAATACTTGAGTGGTGTCGTTAC
GGGCATCATAAAAGTGCATTTCAAATAGAATCCCCACATGTGCAGTTGGTCGTCTTTCGT
GTGGCGTCGATATCACTGTCGTTATAAATAAATTTCGAATAACAAACTGCACTATGCAGA
GCGATTCTGGACCCTTTTATGTGCTACATCTTTATAGAGAACTCCGTCCCACTATTTATT
GTATTGCATTGTCTTGTAATAATACTGTCCTGGTCCTCAAGGCATGTTCGTTGTTTTTTT
CATTCCACTAAAAGAAAGTCTATTTTAGTTCATGGCACTAATTCCTAGTTGTGTGTTCAT
TCTTTTTAAGTTGTAAATGAATCATTGATTTTGTGTAATGAATGTAAAATAATAGTTGGA
TTTCTAATTACCCGTCACCAAACACCTACATTGATGTGTAATGTCATTGGATAACTTGTA
CATTTCTCGTTGCTTTTTAAAGGCTTCGTTTCATTTTAATTCGGTTACATTTGCTTTGGC
TTGGATTTTTAGCAATATTGGACTGGTTATGAAATGTAATTCTACTCAATTGTACTGTTT
TGTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case