Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4951 cluster # 4951       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4951#0 length = 451 sequences # 3  

consensusID : consensus_4951#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 451
fasta sequence
                              [AATACCAGCAACACCATCGTTGGCATTGTTCATTTGATCACTAGGATAAATGATTGCCGAATTGTCGTTTATTCTATAACTTTTGTTAATATTATTATTCGTATGATGATGATGATGAACTGAATCATTAGTATTCCAAACAGAATATGATGGATTAAAATGTGATAAAGTAGTATGATGTGATGGATTCGATTGAATATAATTCGATGGACTATTATTGATAAACGCAACAGTATAAGGATTAAACATACTACTCAAGTGAGTATTATTATTATTATTGACATTACTAATATTAGTAGCAGTGGTAGTAATAGCATTCGTTGTTGTTGTCGTCATAGTAACATTAACGGCATTATTATTATTATTATTATTCATTTGTGAATTTGTAAAATGCATCATTTCACTGTCTTCATCTAAACTTAGTTTATCATCTTCATCTAATGTTGTTGTT]

[+] EMBL CD118103             [AATACCAGCAACACCATCGTTGGCATTGTTCATTTGATCACTAGGATAAATGATTGCCGAATTGTCGTTTATTCTATAACTTTTGTTAATATTATTATTCGTATGATGATGATGATGAACTGAATCATTAGTATTCCAAACAGAATATGATGGATTAAAATGTGATAAAGTAGTATGATGTGATGGATTCGATTGAATATAATTCGATGGACTATTATTGATAAACGCAACAGTATAAGGATTAAACATACTACTCAAGTGAGTATTATTATTATTATTGACATTACTAATATTAGTAGCAGTGGTAGTAATAGCATTCGTTGTTGTTGTCGTCATAGTAACATTAACGGCATTATTATTATTATTATTATTCATTTGTGAATTTGTAAAATGCATCATTTCACTGTCTTCATCTAAACTTAGTTTATCATCTTCATCTAATGTTGTTGTT]
[+] EMBL CD118170             [AATACCAGCAACACCATCGTTGGCATTGTTCATTTGATCACTAGGATAAATGATTGCCGAATTGTCGTTTATTCTATAACTTTTGTTAATATTATTATTCGTATGATGATGATGATGAACTGAATCATTAGTATTCCAAACAGAATATGATGGATTAAAATGTGATAAAGTAGTATGATGTGATGGATTCGATTGAATATAATTCGATGGACTATTATTGATAAACGCAACAGTATAAGGATTAAACATACTACTCAAGTGAGTATTATTATTATTATTGACATTACTAATATTAGTAGCAGTGGTAGTAATAGCATTCGTTGTTGTTGTCGTCATAGTAACATTAACGGCATTATTATTATTATTATTATTCATTTGTGAATTTGTAAAATGCATCATTTCACTGTCTTCATCTAAACTTAGTTTATCATCTTCATCTAATGgt      ]
[+] EMBL CD118178             [AATACCAGCAACACCATCGCTGGCATTGTTCATTTGATCACTAGGATAAATGATTGCCGAATTGTCGCTTATTCTATAACTTTTGTTAATATTATTATTCGTATGATGATGATGATGAACTGAATCATTATTATTCCAAACAGAATATGATGGATTAAAATGTGATAAAGTAGTATGATGTGATGGATTCGATTGAATATAATTCGATGGACTATTATTGATAAACGCAACAGTATAAGGATTAAACATACTACTCAAGCGAGTATTATTATTATTATTGACATTACTAATATTAGT                                                                                                                                                          ]


>consensus_4951#0 AATACCAGCAACACCATCGTTGGCATTGTTCATTTGATCACTAGGATAAATGATTGCCGA ATTGTCGTTTATTCTATAACTTTTGTTAATATTATTATTCGTATGATGATGATGATGAAC TGAATCATTAGTATTCCAAACAGAATATGATGGATTAAAATGTGATAAAGTAGTATGATG TGATGGATTCGATTGAATATAATTCGATGGACTATTATTGATAAACGCAACAGTATAAGG ATTAAACATACTACTCAAGTGAGTATTATTATTATTATTGACATTACTAATATTAGTAGC AGTGGTAGTAATAGCATTCGTTGTTGTTGTCGTCATAGTAACATTAACGGCATTATTATT ATTATTATTATTCATTTGTGAATTTGTAAAATGCATCATTTCACTGTCTTCATCTAAACT TAGTTTATCATCTTCATCTAATGTTGTTGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)