cluster # 5060

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5060 cluster # 5060 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5060#0 length = 2738 sequences # 3
consensusID : consensus_5060#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2738
fasta sequence
                              [GTGTAAGTGGATCTTATTACAGAATAAATCATGGTAAAGGATATGCGTAGATAAGGTCCTCAGTTTATTTATTGAATCTGATAGCCGATTCTAGAAGTCACTGTAACTGATTATGGATGTATCGATACATGTTAATAAATCAATCGAATTGTGGATATAAATACAGAATAATCTAACAAATTCAAATCTTTCCTTAAAACTTATGTAAATAATATTTTTGGTTAAATTACCTGTAATTTTAATTAAAAACATTTTACTAAAACAAAAAAATTTTGTTAAATAATGAGATAATTACCTTGGTCATGTAAACACATAAAATGAGCACAATTAAACTTTTCACATGTCCACCTTATCAGGAACAGCATCCACTCTTCTGTTACCTCATGGAACATTGGCCTATTGTAATAGAAAAATAAATCAAAACCTGGAAGAGGAAACAGGAATCGATCAACTCACTTCAGATGAAATATTTCGTCCGGAAATTGAAAGTGAAAGATTAGTAATCAATGTAAGCGGTTTACGTTTTGAAACTCAAGCACAAACTGTCAATCAATTTCCTGATACCTTACTAGGTAATCCCAATAAACGTAATCATTATTATGATCCGTTAAGAAATGAATATTTTTTCGACAGAAATCGATCAAGCTTTGACGGTATACTTTATTTTTATCAAAGCGGTGGAAGACTTCGACGACCTGTTAATGTACCAATAGATGTATTCAATGAAGAAATTAAATTCTATGAATTAGGTGAAGAGGCATTGGCTAAATATCGTGAAGAAGAAGGATTTATTAAGGAGGAACCAAAAATTCTACCAAGAAATCGTTTTCAACGTAAAGTTTGGCTTTTATTTGAATACCCAGAAAGTTCATTAGCTGCACGTATACTAGCTATTGGTTCAGTATTTGTTATTCTCTTATCAATTATAATTTTTTGTTTGGAAACTCTACCACATTTTCGTCGATATAAAATAATAAATAACCTTAATTCTACTTTATGTTATGAAGAATTAACTTTTGAAGAAGATGATTTACCAACAATTGATCAACCATTTTTTATCATTGAAACATTTTGTATAGTATGGTTTAGTTGTGAACTACTAGTACGTTTTGCTTCATCTCCGAAAAAGTTTGAGTTTTTCAAGGTGCTAATGAATGTTATTGATGTGGTTTCAATTATACCATATTTCATAACACTTGGTGCTGTAATTATCGATGATCCGAAACAAATTAATCAGACAACATCACTAGCTGTACTAAGAGTTATTCGTCTTGTTCGCGTTTTTCGTATATTCAAATTATCAAGACATTCAAAAGGACTACAAATTTTAGGACAAACACTAAGAGCAAGTGTTCGAGAATTAGGATTATTAGTATTCTTTTTACTGATTTGTGTTATTCTCTTTTCATCAGCTGTATATTTTGCTGAAGCTGATGCTGACACTTCATTATTTCGTAGTATACCTGATGGATTTTGGTGGGCTGTTGTAACAATGACCACAGTTGGTTATGGAGATATGCGACCGGTTACTGTATGGGGTAAATTAATTGGTTCATTATGTGCTATCGCTGGTGTACTAACTATTGCACTTCCTGTTCCTGTGATTGTATCAAACTTTAATTATTTCTATCATCGTGAAACAGAATCAGATGATATTTCACATTCTATTTCTTCATCTTTAGAAACAGATGATGATGATATTACCAATAAAGAACAACATATAAATACAAAAGTTCGTAGTATTACTTACAATATCAATAGTAGTGGTAGTAGTAAATCCATAAAAACAATGTCACATAACGAGAGTATTGTTAATAGTCAATATGATACAACTATAACCAGTGCCTTGAAACAAAATTCCATTACAATAAAAAAGTAATCATATACTCTCGGTTTTCTTCTTATAACATTGTGTTTTTTTCCATCAATTCATGAATCCTTCTAAAAATCAATTTCGTTTAATCAATATTATGCTCAAAATTAAACCAACTACAAATATAGAGAACAGTCAAATATCTTATTCACCATACAGAATACACATTTACATATTTTATCAACATAATGAACTATAAATTAATTAAACTTAGTTCTACGATAGATATTTTTGTACATAAAGTTCATGTTAACCGCAGATACCAATTTTAGTTAGTGTGTTTTCCTTTCTAACTGCATTTTATCATTTTCACTTACTGTTTATCCTTGATGTTTATTTAATTTTCAAATGACCTTTAGGAAAATATATATATATATATATACTACTAATCGATCAAGTTATATAATAATCATTGTATAAACATTGGTTGATAATGCTAAGAGCATATTCATATTTTCATCAAGAACCTGTAGAAGGCTTCAATGGAATCAACTATTTTCATAGAATATTTATTCATGTAGATTCTTCTTTTTTGTTTCTTCGGTTTCTTTTCTCACTATTATATGCCATTGATGAACAATGAAAGAAGAATAGAGATTTCTTCAGAAGCAGGTAAATCATACATATTTTTTTGGCAAAATTGAGTAACTTCATTATTAAATCATTCAGTTGTAGAGCTAATAAACTAATATACTTTATATATGATACTTTATATGATGACAAAAATGTCATGTTGTATTGGGCTTTGAGATAATTATATTAATCATTATCTACTATTTGTTTATTTGATTCATTCTATGTAAATGTGTCAAACATTTTGGAGATTTCGGATCTTTCATGTAAAACAATAAAAAAATAAATAATT]

[+] EMBL SMSKV1PCP            [GTGTAAGTGGATCTTATTACAGAATAAATCATGGTAAAGGATATGCGTAGATAAGGTCCTCAGTTTATTTATTGAATCTGATAGCCGATTCTAGAAGTCACTGTAACTGATTATGGATGTATCGATACATGTTAATAAATCAATCGAATTGTGGATATAAATACAGAATAATCTAACAAATTCAAATCTTTCCTTAAAACTTATGTAAATAATATTTTTGGTTAAATTACCTGTAATTTTAATTAAAAACATTTTACTAAAACAAAAAAATTTTGTTAAATAATGAGATAATTACCTTGGTCATGTAAACACATAAAATGAGCACAATTAAACTTTTCACATGTCCACCTTATCAGGAACAGCATCCACTCTTCTGTTACCTCATGGAACATTGGCCTATTGTAATAGAAAAATAAATCAAAACCTGGAAGAGGAAACAGGAATCGATCAACTCACTTCAGATGAAATATTTCGTCCGGAAATTGAAAGTGAAAGATTAGTAATCAATGTAAGCGGTTTACGTTTTGAAACTCAAGCACAAACTGTCAATCAATTTCCTGATACCTTACTAGGTAATCCCAATAAACGTAATCATTATTATGATCCGTTAAGAAATGAATATTTTTTCGACAGAAATCGATCAAGCTTTGACGGTATACTTTATTTTTATCAAAGCGGTGGAAGACTTCGACGACCTGTTAATGTACCAATAGATGTATTCAATGAAGAAATTAAATTCTATGAATTAGGTGAAGAGGCATTGGCTAAATATCGTGAAGAAGAAGGATTTATTAAGGAGGAACCAAAAATTCTACCAAGAAATCGTTTTCAACGTAAAGTTTGGCTTTTATTTGAATACCCAGAAAGTTCATTAGCTGCACGTATACTAGCTATTGGTTCAGTATTTGTTATTCTCTTATCAATTATAATTTTTTGTTTGGAAACTCTACCACATTTTCGTCGATATAAAATAATAAATAACCTTAATTCTACTTTATGTTATGAAGAATTAACTTTTGAAGAAGATGATTTACCAACAATTGATCAACCATTTTTTATCATTGAAACATTTTGTATAGTATGGTTTAGTTGTGAACTACTAGTACGTTTTGCTTCATCTCCGAAAAAGTTTGAGTTTTTCAAGGTGCTAATGAATGTTATTGATGTGGTTTCAATTATACCATATTTCATAACACTTGGTGCTGTAATTATCGATGATCCGAAACAAATTAATCAGACAACATCACTAGCTGTACTAAGAGTTATTCGTCTTGTTCGCGTTTTTCGTATATTCAAATTATCAAGACATTCAAAAGGACTACAAATTTTAGGACAAACACTAAGAGCAAGTGTTCGAGAATTAGGATTATTAGTATTCTTTTTACTGATTTGTGTTATTCTCTTTTCATCAGCTGTATATTTTGCTGAAGCTGATGCTGACACTTCATTATTTCGTAGTATACCTGATGGATTTTGGTGGGCTGTTGTAACAATGACCACAGTTGGTTATGGAGATATGCGACCGGTTACTGTATGGGGTAAATTAATTGGTTCATTATGTGCTATCGCTGGTGTACTAACTATTGCACTTCCTGTTCCTGTGATTGTATCAAACTTTAATTATTTCTATCATCGTGAAACAGAATCAGATGATATTTCACATTCTATTTCTTCATCTTTAGAAACAGATGATGATGATATTACCAATAAAGAACAACATATAAATACAAAAGTTCGTAGTATTACTTACAATATCAATAGTAGTGGTAGTAGTAAATCCATAAAAACAATGTCACATAACGAGAGTATTGTTAATAGTCAATATGATACAACTATAACCAGTGCCTTGAAACAAAATTCCATTACAATAAAAAAGTAATCATATACTCTCGGTTTTCTTCTTATAACATTGTGTTTTTTTCCATCAATTCATGAATCCTTCTAAAAATCAATTTCGTTTAATCAATATTATGCTCAAAATTAAACCAACTACAAATATAGAGAACAGTCAAATATCTTATTCACCATACAGAATACACATTTACATATTTTATCAACATAATGAACTATAAATTAATTAAACTTAGTTCTACGATAGATATTTTTGTACATAAAGTTCATGTTAACCGCAGATACCAATTTTAGTTAGTGTGTTTTCCTTTCTAACTGCATTTTATCATTTTCACTTACTGTTTATCCTTGATGTTTATTTAATTTTCAAATGACCTTTAGGAAAATATATATATATATATATACTACTAATCGATCAAGTTATATAATAATCATTGTATAAACATTGGTTGATAATGCTAAGAGCATATTCATATTTTCATCAAGAACCTGTAGAAGGCTTCAATGGAATCAACTATTTTCATAGAATATTTATTCATGTAGATTCTTCTTTTTTGTTTCTTCGGTTTCTTTTCTCACTATTATATGCCATTGATGAACAATGAAAGAAGAATAGAGATTTCTTCAGAAGCAGGTAAATCATACATATTTTTTTGGCAAAATTGAGTAACTTCATTATTAAATCATTCAGTTGTAGAGCTAATAAACTAATATACTTTATATATGATACTTTATATGATGACAAAAATGTCATGTTGTATTGGGCTTTGAGATAATTATATTAATCATTATCTACTATTTGTTTATTTGATTCATTCTATGTAAATGTGTCAAACATTTTGGAGATTTCGGATCTTTCATGTAAAACAATAAAAAAATAAATAATT]
[+] EMBL CD201298             [                                                       GTCCTCAGTTTATTTATTGAATCTGATAGCCGATTCTGGAAGTCACTGTAACTGATTATGGATGTATCGATACATGTTAATAAATCAATCGAATTGTGGATATAAATACAGAATAATCTAACAAATTCAAATCTTTCCTTAAAACTTATGTAAATAATATCTTTGGTTAAATTACCTGTAATTTTAATTAAAAACATTTTACTAAAACAAAAAAATTTTGTTAAATAATGAGATAATTACCTTGGTCATGTAAACACATAAAATGAGCACAATTAAACTTTTCACATGTCCACCTTATCAGGAACAGCATCCACTCTTCTGTTACCTCATGGAACATTGGCCTATTGTAATAGAAAAATAAATCAAAACCTGGAAGAGGAAACAGGAATCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD078012             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAGGATTATTAGTATTCTTTTTACTGATTTGTGTTATTCTCTTTTCATCAGCTGTATATTTTGCTGAAGCTGATGCTGACACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]




>consensus_5060#0
GTGTAAGTGGATCTTATTACAGAATAAATCATGGTAAAGGATATGCGTAGATAAGGTCCT
CAGTTTATTTATTGAATCTGATAGCCGATTCTAGAAGTCACTGTAACTGATTATGGATGT
ATCGATACATGTTAATAAATCAATCGAATTGTGGATATAAATACAGAATAATCTAACAAA
TTCAAATCTTTCCTTAAAACTTATGTAAATAATATTTTTGGTTAAATTACCTGTAATTTT
AATTAAAAACATTTTACTAAAACAAAAAAATTTTGTTAAATAATGAGATAATTACCTTGG
TCATGTAAACACATAAAATGAGCACAATTAAACTTTTCACATGTCCACCTTATCAGGAAC
AGCATCCACTCTTCTGTTACCTCATGGAACATTGGCCTATTGTAATAGAAAAATAAATCA
AAACCTGGAAGAGGAAACAGGAATCGATCAACTCACTTCAGATGAAATATTTCGTCCGGA
AATTGAAAGTGAAAGATTAGTAATCAATGTAAGCGGTTTACGTTTTGAAACTCAAGCACA
AACTGTCAATCAATTTCCTGATACCTTACTAGGTAATCCCAATAAACGTAATCATTATTA
TGATCCGTTAAGAAATGAATATTTTTTCGACAGAAATCGATCAAGCTTTGACGGTATACT
TTATTTTTATCAAAGCGGTGGAAGACTTCGACGACCTGTTAATGTACCAATAGATGTATT
CAATGAAGAAATTAAATTCTATGAATTAGGTGAAGAGGCATTGGCTAAATATCGTGAAGA
AGAAGGATTTATTAAGGAGGAACCAAAAATTCTACCAAGAAATCGTTTTCAACGTAAAGT
TTGGCTTTTATTTGAATACCCAGAAAGTTCATTAGCTGCACGTATACTAGCTATTGGTTC
AGTATTTGTTATTCTCTTATCAATTATAATTTTTTGTTTGGAAACTCTACCACATTTTCG
TCGATATAAAATAATAAATAACCTTAATTCTACTTTATGTTATGAAGAATTAACTTTTGA
AGAAGATGATTTACCAACAATTGATCAACCATTTTTTATCATTGAAACATTTTGTATAGT
ATGGTTTAGTTGTGAACTACTAGTACGTTTTGCTTCATCTCCGAAAAAGTTTGAGTTTTT
CAAGGTGCTAATGAATGTTATTGATGTGGTTTCAATTATACCATATTTCATAACACTTGG
TGCTGTAATTATCGATGATCCGAAACAAATTAATCAGACAACATCACTAGCTGTACTAAG
AGTTATTCGTCTTGTTCGCGTTTTTCGTATATTCAAATTATCAAGACATTCAAAAGGACT
ACAAATTTTAGGACAAACACTAAGAGCAAGTGTTCGAGAATTAGGATTATTAGTATTCTT
TTTACTGATTTGTGTTATTCTCTTTTCATCAGCTGTATATTTTGCTGAAGCTGATGCTGA
CACTTCATTATTTCGTAGTATACCTGATGGATTTTGGTGGGCTGTTGTAACAATGACCAC
AGTTGGTTATGGAGATATGCGACCGGTTACTGTATGGGGTAAATTAATTGGTTCATTATG
TGCTATCGCTGGTGTACTAACTATTGCACTTCCTGTTCCTGTGATTGTATCAAACTTTAA
TTATTTCTATCATCGTGAAACAGAATCAGATGATATTTCACATTCTATTTCTTCATCTTT
AGAAACAGATGATGATGATATTACCAATAAAGAACAACATATAAATACAAAAGTTCGTAG
TATTACTTACAATATCAATAGTAGTGGTAGTAGTAAATCCATAAAAACAATGTCACATAA
CGAGAGTATTGTTAATAGTCAATATGATACAACTATAACCAGTGCCTTGAAACAAAATTC
CATTACAATAAAAAAGTAATCATATACTCTCGGTTTTCTTCTTATAACATTGTGTTTTTT
TCCATCAATTCATGAATCCTTCTAAAAATCAATTTCGTTTAATCAATATTATGCTCAAAA
TTAAACCAACTACAAATATAGAGAACAGTCAAATATCTTATTCACCATACAGAATACACA
TTTACATATTTTATCAACATAATGAACTATAAATTAATTAAACTTAGTTCTACGATAGAT
ATTTTTGTACATAAAGTTCATGTTAACCGCAGATACCAATTTTAGTTAGTGTGTTTTCCT
TTCTAACTGCATTTTATCATTTTCACTTACTGTTTATCCTTGATGTTTATTTAATTTTCA
AATGACCTTTAGGAAAATATATATATATATATATACTACTAATCGATCAAGTTATATAAT
AATCATTGTATAAACATTGGTTGATAATGCTAAGAGCATATTCATATTTTCATCAAGAAC
CTGTAGAAGGCTTCAATGGAATCAACTATTTTCATAGAATATTTATTCATGTAGATTCTT
CTTTTTTGTTTCTTCGGTTTCTTTTCTCACTATTATATGCCATTGATGAACAATGAAAGA
AGAATAGAGATTTCTTCAGAAGCAGGTAAATCATACATATTTTTTTGGCAAAATTGAGTA
ACTTCATTATTAAATCATTCAGTTGTAGAGCTAATAAACTAATATACTTTATATATGATA
CTTTATATGATGACAAAAATGTCATGTTGTATTGGGCTTTGAGATAATTATATTAATCAT
TATCTACTATTTGTTTATTTGATTCATTCTATGTAAATGTGTCAAACATTTTGGAGATTT
CGGATCTTTCATGTAAAACAATAAAAAAATAAATAATT
clustalw multiple alignements is not computed in this case