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Schistosoma mansoni
cluster # 5133 cluster # 5133       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5133#0 length = 872 sequences # 3  

consensusID : consensus_5133#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 872
fasta sequence
                              [GATCCATCAAAAATAAATTGATTACAGCTATTTGCGACTGGAATAAAGATATGTACATTTTGCTGACTGAATTTTTCGTGTCTAGTTCCTTATGGACACTACTTATTGGTTGAAAGACTCCAAAGCGTGCCAAATGTGTGAACACACTGCCACAAAGTGAAAGGTATTGTAATGTACTGAAACTAAATGAACCACTTTCTGACATTTGAAGGGAAGTGTACGGGTTTTAAGTCTCTTTGAATGGGTTTACATGTGAAGGCGATTCCACCAAGCTGATGAATCGCAATGTAGACCCCACTGCAAGGTTTTATTTCCTGTGGCTGTGTGAATATCGAAAAGAGTGTAACTATCGGGACCAATTTATGGATTAATACTATTTGTATCTTTATTCGATAGTTAGCAGGTAAGTGAATAATTGTATTTTTATATTCTCCTTATCCTAAACTTCCACTGGACCTATTAACTGTAGTTATACGACTTTATTATTCCCTGATCATCATCAACTAATTATTTACCGTTGGCTTCGTTCTCTTCTACTTACGGTATGTTTGTATATAATTTATGATTTCATAGTTGAGGTGTATTGAGGTCAGACAATTCATGTACATAAACTAATGAGTACTTGAGATAGATTCTTGCTAGTTGAAATACAATCAAATGTGCTTGTATGCTGTCTCTTCGCAATAAACTGAGAACTGGGGATAGGAAGCATACGTAACAGATGACCAATGAGAGTCAAGCTTACGTTAGACTCAGCTCAAAGTTGATCTTGTCGGTCGGAGCGTATCTTTTATTAAGGCTTGGAACATAAGACTACAGACGGAACGGAATATGCAAAGTAGCAAACTTACAGCCGGAATTTCGGTTGGCAA]

[+] EMBL CD115883             [GATCCATCAAAAATAAATTGATTACAGCTATTTGCGACTGGAATAAAGATATGTACATTTTGCTGACTGAATTTTTCGTGTCTAGTTCCTTATGGACACTACTTATTGGTTGAAAGACTCCAAAGCGTGCCAAATGTGTGAACACACTGCCACAAAGTGAAAGGTATTGTAATGTACTGAAACTAAATGAACCACTTTCTGACATTTGAAGGGAAGTGTACGGGTTTTAAGTCTCTTTGAATGGGTTTACATGTGAAGGCGATTCCACCAAGCTGATGAATCGCAATGTAGACCCCACTGCAAGGTTTTATTTCCTGTGGCTGTGTGAATATCGAAAAGAGTGTAACTATCGGGACCAATTTATGGATTAATACTATTTGTATCTTTATTCGATAGTTAGCAGGTAAGTGAATAATTGTATTTTTATATTCTCCTTATCCTAAACTTCCACTGGACCTATTAACTGTAGTTATACGACTTTATTATTCCCTGATCATCATCAACTAATTATTTACCGTTGGCTTCGTTCTCTTCTACTTACGGTATGTTTGTATATAATTTATGATTTCATAGTTGAGGTGTATTGAGGTCAGACAATTCATGTACATAAACTAATGAGTACTTGAGATAGATTCTTGCTAGTTGA                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD115606             [                                                                                                                                                                                                      CTGACATTTGAAGGAAAGTGTACGGGTTTTAAGTCTCTTTGAATGGGTTTACATGTGAAGGCGATTCCACCAAGCTGATGAATCGCAATGTAGACCCCACTGCAAGGTTTTATTTCCTGTGGCTGTGTGAATATCGAAAAGAGTGTAACTATCGGGACCAATTTATGGATTAATACTATTTGTATCTTTATTCGATAGTTAGCAGGTAAGTGAATAATTGTATTTTTATATTCTCCTTATCCTAAACTTCCACTGGACCTATTAACTGTAGTTATACGACTTTATTATTCCCTGATCATCATCAACTAATTATTTACCGTTGGCTTCGTTCTCTTCTACTCCCCGTATGTTTGTATATAATTTATGATTTCATAGTTGAGGTGTATTGAGGTCAGACAATTCATGTACATAAACTAATGAGTACTTGAGATAGATTCTTGCTAGTTGAA                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD196249             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGTATTGAGGTCAGACAATTCATGTACATAAACTAATGAGTACTTGAGATAGATTCTTGCTAGTTGAAATACAATCAAATGTGCTTGTATGCTGTCTCTTCGCAATAAACTGAGAACTGGGGATAGGAAGCATACGTAACAGATGACCAATGAGAGTCAAGCTTACGTTAGACTCAGCTCAAAGTTGATCTTGTCGGTCGGAGCGTATCTTTTATTAAGGCTTGGAACATAAGACTACAGACGGAACGGAATATGCAAAGTAGCAAACTTACAGCCGGAATTTCGGTTGGCAA]


>consensus_5133#0 GATCCATCAAAAATAAATTGATTACAGCTATTTGCGACTGGAATAAAGATATGTACATTT TGCTGACTGAATTTTTCGTGTCTAGTTCCTTATGGACACTACTTATTGGTTGAAAGACTC CAAAGCGTGCCAAATGTGTGAACACACTGCCACAAAGTGAAAGGTATTGTAATGTACTGA AACTAAATGAACCACTTTCTGACATTTGAAGGGAAGTGTACGGGTTTTAAGTCTCTTTGA ATGGGTTTACATGTGAAGGCGATTCCACCAAGCTGATGAATCGCAATGTAGACCCCACTG CAAGGTTTTATTTCCTGTGGCTGTGTGAATATCGAAAAGAGTGTAACTATCGGGACCAAT TTATGGATTAATACTATTTGTATCTTTATTCGATAGTTAGCAGGTAAGTGAATAATTGTA TTTTTATATTCTCCTTATCCTAAACTTCCACTGGACCTATTAACTGTAGTTATACGACTT TATTATTCCCTGATCATCATCAACTAATTATTTACCGTTGGCTTCGTTCTCTTCTACTTA CGGTATGTTTGTATATAATTTATGATTTCATAGTTGAGGTGTATTGAGGTCAGACAATTC ATGTACATAAACTAATGAGTACTTGAGATAGATTCTTGCTAGTTGAAATACAATCAAATG TGCTTGTATGCTGTCTCTTCGCAATAAACTGAGAACTGGGGATAGGAAGCATACGTAACA GATGACCAATGAGAGTCAAGCTTACGTTAGACTCAGCTCAAAGTTGATCTTGTCGGTCGG AGCGTATCTTTTATTAAGGCTTGGAACATAAGACTACAGACGGAACGGAATATGCAAAGT AGCAAACTTACAGCCGGAATTTCGGTTGGCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)