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Schistosoma mansoni
cluster # 5170 cluster # 5170       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5170#0 length = 449 sequences # 3  

consensusID : consensus_5170#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 449
fasta sequence
                              [GATGCTGAAGAATTTTGTACACATGTATTTCGAACATTTGATAAAGATAATTCTGGAAAAATTGATTTTAAAGAATTTCTATTAGCAATTAATATTACATCAGGTGGTAAACCAGAAGAGAAACTTGAATGGGCATTTCAAATGTATGATATTAATGGTAATGGAACTATTGAAAAACATGAAATGGTTGAAATTATCAAAGCAATTTACAGTATGCTGGGTGCTGATGAATCAACTGTTGATTTAAGTCCTGAAGCGCGTACAGATGAAATATTTGAAAAAATGGATAGTAACTCTGATGGAGTTTTAACAAGAGAAGAATTTATGGATGGTTGTATGGCAGATAAACAACTTTATTCTATGTTACTCGCTGATGAACCAGCTGAATAATTTTTTTTTTAAAATACACAAAACGTCAAAATTAATCAATCCAATTTGTATTCCCCTAA]

[+] EMBL CD185425             [GATGCTGAAGAATTTTGTACACATGTATTTCGAACATTTGATAAAGATAATTCTGGAAAAATTGATTTTAAAGAATTTCTATTAGCAATTAATATTACATCAGGTGGTAAACCAGAAGAGAAACTTGAATGGGCATTTCAAATGTATGATATTAATGGTAATGGAACTATTGAAAAACATGAAATGGTTGAAATTATCAAAGCAATTTACAGTATGCTGGGTGCTGATGAATCAACTGTTGATTTAAGTCCTGAAGCGCGTACAGATGAAATATTTGAAAAAATGGATAGTAACTCTGATG                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD139621             [                                                                                                                                                                                                                                          ACTGTTGATTTAAGTCCTGAAGCGCGTACAGATGAAATATTTGAAAAAATGGATAGTAACTCTGATGGAGTTTTAACAAGAGAAGAATTTATGGATGGTTGTATGGCAGATAAACAACTTTATTCTATGTTACTCGCTGATGAACCAGCTGAATAATTTTTTTTTTAAAATACACAAAACGTCAAAATTAATCAATCCAATTTGTATTCCCCTAA]
[-] EMBL CD195719             [                                                                                                                                                                                                                                                                              ATATTTGAAAAAATGGATAGTAACTCTGATGGAGTTTTAACAAGAGAAGAATTTATGGATGGTTGTATGGCAGATAAACAACTTTATTCTATGTTACTCGCTGATGAACCAGCTGAATAATTTTTTTTTTAAAATACACAAAACGTCAAAATTAATCAATCCAATTTGT TTCCCCTAA]


>consensus_5170#0 GATGCTGAAGAATTTTGTACACATGTATTTCGAACATTTGATAAAGATAATTCTGGAAAA ATTGATTTTAAAGAATTTCTATTAGCAATTAATATTACATCAGGTGGTAAACCAGAAGAG AAACTTGAATGGGCATTTCAAATGTATGATATTAATGGTAATGGAACTATTGAAAAACAT GAAATGGTTGAAATTATCAAAGCAATTTACAGTATGCTGGGTGCTGATGAATCAACTGTT GATTTAAGTCCTGAAGCGCGTACAGATGAAATATTTGAAAAAATGGATAGTAACTCTGAT GGAGTTTTAACAAGAGAAGAATTTATGGATGGTTGTATGGCAGATAAACAACTTTATTCT ATGTTACTCGCTGATGAACCAGCTGAATAATTTTTTTTTTAAAATACACAAAACGTCAAA ATTAATCAATCCAATTTGTATTCCCCTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)