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Schistosoma mansoni
cluster # 5245 cluster # 5245       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5245#0 length = 835 sequences # 3  

consensusID : consensus_5245#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 835
fasta sequence
                              [ATTATTAAAAAGAAGATCATATTTAATTGAAAAAGCTAAAGATGCACAATATATTGGAATACTTGTTTGTACATTATCGATCAAACATTATCAACATATTATTGATCGTTTAAAATCATTATTACACTATGCAAAACGTTCATGTATCACATTAATTGTTGGTCGATTAAATCCAGAAAAATTAGCTAATTTACCTGAATTACAATTATTAATATTAATAGCATGTCCTGAGACAAGTTTATTAGATTCAAATGATTTTCATATACCAGTAATAACACCATTTGAAATGGAATGTGCTATACGTTCATGTTATATGAATGAATACTTATCAATTGATGAACGTACATGGACAGCAGAGAAACTTTGGGTAGATTTTCATGATTTATTACCAGGTGGTCGAGCTTATATACCTCTGGAGAATGTTATTCCACAAGTAACTGAATCATTCGCTATTGTTTCATTAATTAATGGACATAGCCATTTGATTCCAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGCAAAGATAATTCTCAATCTTTAATAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAAACTCTCGTCGAACATGGTATGGTTTAGATCCGAAAATTGGTCAAACACCTATAGCACAAATAAAAGATGGTCGTACTGGTTTACCAATACAGTATACAGATGAAAAGAACGTACTATCATCCGATTAATGATTATTATTATACGCTTT-GATCCTCTGATCCGTGGACAG-TTTGACTTTGTACATAAATTTTCGTGATATTGGAATGTTTGCCATGTTGAGATGATTTACTAAAATATTTATT]

[+] EMBL CD078658             [ATTATTAAAAAGAAGATCATATTTAATTGAAAAAGCTAAAGATGCACAATATATTGGAATACTTGTTTGTACATTATCGATCAAACATTATCAACATATTATTGATCGTTTAAAATCATTATTACACTATGCAAAACGTTCATGTATCACATTAATTGTTGGTCGATTAAATCCAGAAAAATTAGCTAATTTACCTGAATTACAATTATTAATATTAATAGCATGTCCTGAGACAAGTTTATTAGATTCAAATGATTTTCATATACCAGTAATAACACCATTTGAAATGGAATGTGCTATACGTTCATGTTATATGAATGAATACTTATCAATTGATGAACGTACATGGACAGCAGAGAAACTTTGGGTAGATTTTCATGATTTATTACCAGGTGGTCGAGCTTATATACCTCTGGAGAATGTTATTCCACAAGTAACTGAATCATTCGCTATTGTTTCATTAATTAATGGACATAGCCATTTGATTCCAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGCANAGATAATTCTCAATCTTTAATAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAA                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD073121             [                                                                                                                                                                                                                                                   AGATTCAAATGATTTTCATATACCAGTAATAACACCATTTGAAATGGAATGTGCTATACGTTCATGTTATATGAATGAATACTTATCAATTGATGAACGTACATGGACAGCAGAGAAACTTTGGGTAGATTTTCATGATTTATTACCAGGTGGTCGAGCTTATATACCTCTGGAGAATGTTATTCCACAAGTAACTGAATCATTCGCTATTGTTTCATTAATTAATGGACATAGCCATTTGATTCCAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGCAAAGATAATTCTCAATCTTTAATAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAAACTCTCGTCGAACATGGTATGGTTTAGATCCGAAAATTGGTCAAACACCTATAGCACAAATAAAAGATGGTCGTACTGGTTTACCAATACAGTATACAGATGAAAAGAACGTACTATCATCCGATTAATGATTATTATTATACGCTTT GATCCTCTGATCCGTGGACAG TTTGACTTTGTACATAAATTTTCGTGATATTGGAATGTTTGCCATGTTGAGATGATTTACTAAAATATTTATT]
[+] EMBL SM694                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGGACATAGGCATTTGATTCNAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGNAAAGATAATTCTCAATCTTTANTAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAANCTCTCGTCGAACATGGTATGGTTTAGATCCGAAAATTGGTCAAACACCTATAGCACAAATAAAAGATGGTCGTACTGGTTTACCAATACAGTATACAGATGAAAAGAACGTACTATCATCCGANTAATGATTATTATTATACGCTTTGGATCCTCTGATCCGTGGACAGNTTGGACTTNGTACATAAATTTTCGTGATATTGGNATGTTTGCCATGTTGAGATGATTTACTA           ]


>consensus_5245#0 ATTATTAAAAAGAAGATCATATTTAATTGAAAAAGCTAAAGATGCACAATATATTGGAAT ACTTGTTTGTACATTATCGATCAAACATTATCAACATATTATTGATCGTTTAAAATCATT ATTACACTATGCAAAACGTTCATGTATCACATTAATTGTTGGTCGATTAAATCCAGAAAA ATTAGCTAATTTACCTGAATTACAATTATTAATATTAATAGCATGTCCTGAGACAAGTTT ATTAGATTCAAATGATTTTCATATACCAGTAATAACACCATTTGAAATGGAATGTGCTAT ACGTTCATGTTATATGAATGAATACTTATCAATTGATGAACGTACATGGACAGCAGAGAA ACTTTGGGTAGATTTTCATGATTTATTACCAGGTGGTCGAGCTTATATACCTCTGGAGAA TGTTATTCCACAAGTAACTGAATCATTCGCTATTGTTTCATTAATTAATGGACATAGCCA TTTGATTCCAGAAAATAAGCCTCATTCTGATTCAGATCATGGCAAAGATAATTCTCAATC TTTAATAGTTCGATCATCAGGTGAATTAATTGATTTCAGCCAATGGAATTTAAACTCTCG TCGAACATGGTATGGTTTAGATCCGAAAATTGGTCAAACACCTATAGCACAAATAAAAGA TGGTCGTACTGGTTTACCAATACAGTATACAGATGAAAAGAACGTACTATCATCCGATTA ATGATTATTATTATACGCTTTGATCCTCTGATCCGTGGACAGTTTGACTTTGTACATAAA TTTTCGTGATATTGGAATGTTTGCCATGTTGAGATGATTTACTAAAATATTTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)