cluster # 5252

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Schistosoma mansoni
cluster # 5252 cluster # 5252 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5252#0 length = 656 sequences # 3

consensusID : consensus_5252#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 656
fasta sequence

                              [AATGAACTTGTTTTTTGTACCTCTGTGATTTTGATAGAAAACTATATTTTGGACAGGATAATGCTATTTTTTGATAAATATAAGCACAGAAGTTAGATTATATTTGATTGGTTAATTAATTTGTTCATTTGTCATGTGTGTGGGCGTAAATGATAACGATTGGTTGTTTGCTTAGTCAGATGTTTAGATAGTTTGACAGGAGTTAGTTGAATGATATATTCTCCTGTCCTTCTTATTATTATTATTGATTGTTGTTGGATTGTGTGGAGTTTTGGTGTGGAAATGTGCTTACGTTCTAATCAGGCTAATCATATGTTCTTGATCTGAGTTGTGTCGATGTCCTGTAGAATAGACATTAAAAAAGAATCTAGTGTAGATATTCTTCTAAAGTAAATTAACGCCCCGATCGTACAGACGAAGAAAAACCGACCGTTATAACAATCTGATACATTGATTGAAAACGATTGACCAATAAATTGTGGCTAAAATCAATTATATGGAAGCAACTTTCAAGTTTTCACACATTCTAATTAGTGGAGTCTTCGAACACCAGCTTGTTAGACAGGCTATAGTTATAGCTCATAATAATTCACCTGTGTTTCATATTTGTATATCCACGCTCGTAGAAGAGATTCGCANTATCAAAGCATTATTTC]

[+] EMBL CD129956             [AATGAACTTGTTTTTTGTACCTCTGTGATTTTGATAGAAAACTATATTTTGGACAGGATAATGCTATTTTTTGATAAATATAAGCACAGAAGTTAGATTATATTTGATTGGTTAATTAATTTGTTCATTTGTCATGTGTGTGGGCGTAAATGATAACGATTGGTTGTTTGCTTAGTCAGATGTTTAGATAGTTTGACAGGAGTTAGTTGAATGATATATTCTCCTGTCCTTCTTATTATTATTGTTGATTGTTGTTGGATTGTGTGGAGTTTTGGTGTGGAAATGTGCTTACGTTCTAATCAGGCTAATCATATGTTCTTGATCTGAGTTGTGTCGATGTCCTGTAGAATAGACATTAAAAAAGAATCTAGTGTAGATATTCTTCTAAAGTAAATTAACGCCCCGATCGTACAGACGAAGAAAAACCGACCGTTATAACAATCTGATACATTGATTGAAAACGATTGACCAATAAATTGTGGCTAAAATCAATTATATGGAAGCAACTTTCAAGTTTTCACACATTCTAATTAGTGGAGTCTTCGAACACCAGCTTGTTAGACAGGCTATAGTTATAGCTCATAATAATTCACCTGTGTTTCATATTTGTATATCCACGCTCGTAGAAGAGATTCGCANTATCAAAGCATTATTTC]
[+] EMBL CD169353             [AATGAACTTGTTTTTTGTACCTCTGTGATTTTGATAGAAAACTATATTTTGGACAAGATAATGCTATTTTTTGATAAATATAAGCACAGAAGTTAGATTATATTTGATTGGTTAATTAATTTGTTCATTTGTCATGTGTGTGGGCGTAAATGATAACGATTGGTTGTTTGCTTAGTCAGATGTTTAGATAGTTTGACAGGAGTTAGTTGAATGATATATTCTCCTGTCCTTCTTATTATTATTATTGATTGTTGTTGGATTGTGTGGAGTTTTGGTGTGGAAATGTGCTTACGTTCTAATCAGGCTAATCATATGTTCTTGATCTGAGTTGTGTCGATGTCCTGTAGAATAGACATTAAAAAAGAATCTAGTGTAGATATTCTTCTAAAGTAAATTAACGCCCCGATCGTACAGACGAAGAAAAACCGACCGTTATAACAATCTGATACATTGATTGAAAACGATTGACCAATAAATTGTGGCTAAAATCAATTATATGGAAGCAACTTTCAAGTTTTCACACATTCTAATTAGTGGAGTCTTCGAACACCAGCTTGTTAGACAGGCTATAGTT                                                                                  ]
[+] EMBL CD169624             [AATGAACTTGTTTTTTGTACCTCTGTGATTTTGATAGAAAACTATATTTTGGACAGGATAATGCTATTTTTTGATAAATATAAGCACAGAAGTTAGATTATATTTGATTGGTTAATTAATTTGTTCATTTGTCATGTGTGTGGGCGTAAATGATAACGATTGGTTGTTTGCTTAGTCAGATGTTTAGATAGTTTGACAGGAGTTAGTTGAATGATATATTCTCCTGTCCTTCTTATTATTATTATTGATTGTTGTTGGATTGTGTGGAGTTTTGGTGTGGAAATGTGCTTACGTTCTAATCAGGCTAATCATATGTTCTTGATCTGAGTTGTGTCGATGTCCTGTAGAATAGACATTAAAAAAGAATCTAGTGTAGATATTCTTCTAAAGTAAATTAACGCCCCGATCGTACAGACGAAGAAAAACCGACCGTTATAACAATCTGATACATTGATTGAAAACGATTGACCAATAAATTGTGGCTAAAATCAATTATATGGAAGCAACTTTCAAGTTTTCACACATTC                                                                                                                                 ]




>consensus_5252#0
AATGAACTTGTTTTTTGTACCTCTGTGATTTTGATAGAAAACTATATTTTGGACAGGATA
ATGCTATTTTTTGATAAATATAAGCACAGAAGTTAGATTATATTTGATTGGTTAATTAAT
TTGTTCATTTGTCATGTGTGTGGGCGTAAATGATAACGATTGGTTGTTTGCTTAGTCAGA
TGTTTAGATAGTTTGACAGGAGTTAGTTGAATGATATATTCTCCTGTCCTTCTTATTATT
ATTATTGATTGTTGTTGGATTGTGTGGAGTTTTGGTGTGGAAATGTGCTTACGTTCTAAT
CAGGCTAATCATATGTTCTTGATCTGAGTTGTGTCGATGTCCTGTAGAATAGACATTAAA
AAAGAATCTAGTGTAGATATTCTTCTAAAGTAAATTAACGCCCCGATCGTACAGACGAAG
AAAAACCGACCGTTATAACAATCTGATACATTGATTGAAAACGATTGACCAATAAATTGT
GGCTAAAATCAATTATATGGAAGCAACTTTCAAGTTTTCACACATTCTAATTAGTGGAGT
CTTCGAACACCAGCTTGTTAGACAGGCTATAGTTATAGCTCATAATAATTCACCTGTGTT
TCATATTTGTATATCCACGCTCGTAGAAGAGATTCGCANTATCAAAGCATTATTTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case