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Schistosoma mansoni
cluster # 5263 cluster # 5263       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5263#0 length = 1117 sequences # 3  

consensusID : consensus_5263#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1117
fasta sequence
                              [AATTAACATTTACCATCATAATTCTCATACATAATTAAAGTGATGTTAATCAATAGAACGAAGTATATGTAGTTTAAATGTAAATGTTTATATTTCATAAATGTTCTGCTCTACATCATGTCCAGTCCTTGGTATGATG-CATATTCTGTTCTCTGATATTGATGTTGAGCTCTGATAGTTAAATTTATTGGATGATTTACGCTTCCTGAATCTCTGACTAGCCAACCGCTCCAGAGAAAAGAATGAGACATGTGGAAAGCTGTATTTCAACATTCCGAAGTCAGGGATATTCGGGTGGTGAGCTAAAACGGACGAATAAAACAGTCATTCACTAT-GGGTTTTCTACATTTTCACTTTATACTTACCATCCATATTTATGAGGACACATGATTTATCTGGGACTGGGAGATATAACAGTTCATTATCAACAAACTCACCAACATGTAATTACTGAACTCTGTATCACAGTGGATAGTACACCGGCTTCTTAAAAAGTAGATGGTGGGTTTGAGTTTCAGTGCTAAAAAAAACAGGGTTCCGGGTGTGCACACCTGAAGAAACCCACATAAAATGGAACGAGTGGCCGATATTCCGCTTCTGGCAGTTATTTAAAAATACTTAATCAACTTTTAGCTACAGAAACTGCTCAAGATATTTATATATGAACAGAGACTGACCATTACAGCTTGAAAAGATCATGCGATATTATAGTGAGATGTTATTTCTATTCTTCATCAATAAAAAACATCAATCGGGCAAGCTAGTCTTTTGGTTATGTATAAGTTTAATTTTGTAAGGGGGAAAAATTAAAACCGTAATGGGACGTTGACTCTGAAACTAATAACGATGGACGATAGGAATAGAATTGATTAATTTCACTTAGGCGTACTTCACGTTGATTAGGATTGTCTAAAATACTTTAGACATACTGCCAAAGCACATAAGATGACACTGACAGATGAAAAACAGTTTTACCTATTTTTATACTGATTTGTAAGCAGTCGGTTTCACATTATTAACTGAATTTTATAATATTCAGAAAATGGGACTGTATCTCAAAGTCGGATACTTTACGGCACAATATTTGTTGAAATGCGATCTAATCATAGTTCAACCC]

[+] EMBL AI975204             [AATTAACATTTACCATCATAATTCTCATACATAATTAAAGTGATGTTAATCAATAGAACGAAGTATATGTAGTTTAAATGTAAATGTTTATATTTCATAAATGTTCTGCTCTACATCATGTCCAGTCCTTGGTATGATG CATATTCTGTTCTCTGATATTGATGTTGAGCTCTGATAGTTAAATTTATTGGATGATTTACGCTTCCTGAATCTCTGACTAGCCAACCGCTCCAGAGAAAAGAATGAGACATGTGGAAAGCTGTATTTCAACATTCCGAAGTCAGGGATATTCGGGTGGTGAGCTAAAACGGACGAATAAAACAGTCATTCACTAT GGGTTTTCTACATTTTCACTTTATACTTACCATCCATATTTATGAGGACACATGATTTATCTGGGACTGGGAGATATAACAGTTCATTATCAACAAACTCACCAACATGTAATTACTGAACTCTGTATCACAGTGGATAGTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BF936651             [                                                                                                                 CATCATGTCCAGTCCTTGGTATGATGCCATATTCTGTTCTCTGATATTGATGTTGAGCTCTGATAGTTAAATTTATTGGATGATTTACCCTTCCTGAATCTCTGACTAGCCAACCGCTCCAGAGAAAAGAATGAGACATGTGGAAAGCTGTATTTCAACATTCCGAAGTCAGGGATATTCGGGTGGTGAGCTAAAACGGACGAATAAAACAGTCATTCACTATGGGGTTTTCTACATTTTCACTTTATACTTACCATCCATATTTATGAGGACACATGATTTATCTGGGACTGGGAGATATAACAGTTCATTATCAACAAACTCACCAACATGTAATTACTGAACTCTGTATCACAGTGGATAGTACACCGGCTTCTTAAAAAGTAGATGGTGGGTTTGAGTTTCAGTGCTAAAAAAAACAGGGTTCCGGGTGTGCACACCTGAAGAAACCCACATAAAATGGAACGAGTGGCCGATATTCCGCTTCTGGCAGTTATTTAAAAATACTTAATCAACTTTTAGCTACAGAAACTGCTCAAGATATTTATATATGAACAGAGACTGACCATTACAGCTTGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD129934             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTATATATGAACAGAGACTGACCATTACAGCTTGAAAAGATCATGCGATATTATAGTGAGATGTTATTTCTATTCTTCATCAATAAAAAACATCAATCGGGCAAGCTAGTCTTTTGGTTATGTATAAGTTTAATTTTGTAAGGGGGAAAAATTAAAACCGTAATGGGACGTTGACTCTGAAACTAATAACGATGGACGATAGGAATAGAATTGATTAATTTCACTTAGGCGTACTTCACGTTGATTAGGATTGTCTAAAATACTTTAGACATACTGCCAAAGCACATAAGATGACACTGACAGATGAAAAACAGTTTTACCTATTTTTATACTGATTTGTAAGCAGTCGGTTTCACATTATTAACTGAATTTTATAATATTCAGAAAATGGGACTGTATCTCAAAGTCGGATACTTTACGGCACAATATTTGTTGAAATGCGATCTAATCATAGTTCAACCC]


>consensus_5263#0 AATTAACATTTACCATCATAATTCTCATACATAATTAAAGTGATGTTAATCAATAGAACG AAGTATATGTAGTTTAAATGTAAATGTTTATATTTCATAAATGTTCTGCTCTACATCATG TCCAGTCCTTGGTATGATGCATATTCTGTTCTCTGATATTGATGTTGAGCTCTGATAGTT AAATTTATTGGATGATTTACGCTTCCTGAATCTCTGACTAGCCAACCGCTCCAGAGAAAA GAATGAGACATGTGGAAAGCTGTATTTCAACATTCCGAAGTCAGGGATATTCGGGTGGTG AGCTAAAACGGACGAATAAAACAGTCATTCACTATGGGTTTTCTACATTTTCACTTTATA CTTACCATCCATATTTATGAGGACACATGATTTATCTGGGACTGGGAGATATAACAGTTC ATTATCAACAAACTCACCAACATGTAATTACTGAACTCTGTATCACAGTGGATAGTACAC CGGCTTCTTAAAAAGTAGATGGTGGGTTTGAGTTTCAGTGCTAAAAAAAACAGGGTTCCG GGTGTGCACACCTGAAGAAACCCACATAAAATGGAACGAGTGGCCGATATTCCGCTTCTG GCAGTTATTTAAAAATACTTAATCAACTTTTAGCTACAGAAACTGCTCAAGATATTTATA TATGAACAGAGACTGACCATTACAGCTTGAAAAGATCATGCGATATTATAGTGAGATGTT ATTTCTATTCTTCATCAATAAAAAACATCAATCGGGCAAGCTAGTCTTTTGGTTATGTAT AAGTTTAATTTTGTAAGGGGGAAAAATTAAAACCGTAATGGGACGTTGACTCTGAAACTA ATAACGATGGACGATAGGAATAGAATTGATTAATTTCACTTAGGCGTACTTCACGTTGAT TAGGATTGTCTAAAATACTTTAGACATACTGCCAAAGCACATAAGATGACACTGACAGAT GAAAAACAGTTTTACCTATTTTTATACTGATTTGTAAGCAGTCGGTTTCACATTATTAAC TGAATTTTATAATATTCAGAAAATGGGACTGTATCTCAAAGTCGGATACTTTACGGCACA ATATTTGTTGAAATGCGATCTAATCATAGTTCAACCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)