These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5277#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 867 fasta sequence [GCTGGAGTTGTCATACCATGGACATTTGTTTACGATCATGTTCTAACCACTCTGTATTATTTGAATGATCAAAATTCAATTGGAGATATAAACAATCAAGATATCTCTTGGCTTCCATCTTTAATTGGATTCGGTTTGCTATTTGGTCAGTTGTTTTATGGTCTGATAACTTCTCAGTTTGGTGACATCGGTACCTGTTTTAAAAATAACAATCAAGATTCCAAAGTTGAAAATGGTAGCACTTGTTGTCAACGAAATTGCTTTCAATCCATCAATAAAAAATGTCCATCGTCAAAGTATCAATTTCATTTAGCAATCTTCCTGATAACACTTCTTTTAAATAGCGCATGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTGTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACATTCTAGAAGTCTCTTTTTTTTTACTGCATATTGTATTGTTCACTAGTAAACTATTTAAAGATGGCCT] [+] EMBL CD078711 [GCTGGAGTTGTCATACCATGGACATTTGTTTACGATCATGTTCTAACCACTCTGTATTATTTGAATGATCAAAATTCAATTGGAGATATAAACAATCAAGATATCTCTTGGCTTCCATCTTTAATTGGATTCGGTTTGCTATTTGGTCAGTTGTTTTATGGTCTGATAACTTCTCAGTTTGGTGACATCGGTACCTGTTTTAAAAATAACAATCAAGATTCCAAAGTTGAAAATGGTAGCACTTGTTGTCAACGAAATTGCTTTCAATCCATCAATAAAAAATGTCCATCGTCAAAGTATCAATTTCATTTAGCAATCTTCCTGATAACACTTCTTTTAAATAGCGCATGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTNTTAACGGTCTTATG ] [-] EMBL CD073174 [ TGTACACTAACTTTAGCTTTAGTCCCATTATGGTCTGTTCAAAGTGAATCAAAGCACTTCGAATTATTCTCGCATCAAGAAGGAAAATTATTAGCGTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCGTGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTGTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACATTCTAGAAGTCTCTTTTTTTTTACTGCATATTGTATTGTTCACTAGTAAACTATTTAAAGATGGCCT] [-] EMBL AW016998 [ GTTGGCTTGCTTCTTTGTCGGCATATCGAATGGTGGATTGTACGTCATGTTTCCGCAGTTAATCATTGATATTGTTGGTACTGAATTATGGTCTTCTGGACTTGGCTTATTTTTAACTTTTAACGGTCTTATGAATTTGTTTGGAACTAATATTGGAGGCAAAATATATGACACTAGAGGTTCATATCAAATGGCACTTTTAATCGCCGCATTTCTGTCGCTATTTGCTTTTCTTTTGGTCGTCATGAAGGAGATATTCACGTGGTTAATGAAGAGATCTACGTTATCTGCCAATTCTGATTAAATGCAAAGACAAATTTAAATATGATTTTATTTATACTAAGGATTTAAGTGACA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||