Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5300 cluster # 5300       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5300#0 length = 1035 sequences # 3  

consensusID : consensus_5300#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1035
fasta sequence
                              [TTTTGTTTAACCGCTAGCAACACAAAACATTTATAACGTTTACAAGGATCTATTGATTAAGGTCAATGGGTTAAATAAACAAGAAATTGTTGCATCAAGGATCAAACCAATAACACTCAGGTCTCGCAGTGTGTACGTTATTATCAGACCACTAATTAAAAATTTAATGGTCCATATATCCAACTTCAGTCAGTTTATGATAGAGCGCGATAGTGATCCAATTTCATCGCTAATACATGTCTTCCTCTGGGCATAGTTAAATCCCATCAGTGGCAGCCTCTACCTAAAGCAGAAGTTGGTCATTTTTAGACACATGATTATTGCTTATTTGGTCCCTTCTTTTTAAGCTAATCCATCATGAAAACTATTACAAACGTTCTTCGGATCTAAAAAAGTAAGAAAATACAAAATCTTTGATCTCTTTTGGTGCGCACATGTGAATTTGTAACCACAATTCCATCCAAGAGCATAGAAAGAGACTAGTTACGGTTGATGACTTATCTGCTGTAGTTAAAATTTCAGAGTTCTCGTAATATCAACACGTTGGTAAGTTGTAGAGCAATAGCGTTTTTCTAAACTGCAAAACAATTTTGGATTTCCTCGTCAACTGGAAAAGGATCTTGCAGATAACAGCCTCTCATTAACTGCTCCTTATTCTTATCTAAACAGTCGTAGAGTTGAAACAAAATCTCACTTGTAGCTTATCACCAGNCAACTATGTAAGGTATCTATTCGATATATATTGTATTTCGTTGAACATCGATACTCAATTATTGGTAGTGATCCTATAAATAATCAACCTCATGAATGATCGCTACGGTTGTCATTCATTTACTGTCTTTAATAAATATACATCTGTTTTTCATCAGTATTTTCCTGTTAACGTGAGAAGTTATGTTTTTTATCGAGCAACAAATTTTCCTTTTGAAGATTTTGTTTTAGTTATCTATTTGACTTCTATTTTTCACATATGAATGTTTTAACAAGTTAGTGTCCATTCACATTTTGAAGTGCATTGATTTAATAAATCATCTG]

[-] EMBL CD142890             [TTTTGTTTAACCGCTAGCAACACAAAACATTTATAACGTTTACAAGGATCTATTGATTAAGGTCAATGGGTTAAATAAACAAGAAATTGTTGCATCAAGGATCAAACCAATAACACTCAGGTCTCGCAGTGTGTACGTTATTATCAGACCACTAATTAAAAATTTAATGGTCCATATATCCAACTTCAGTCAGTTTATGATAGAGCGCGATAGTGATCCAATTTCATCGCTAATACATGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD078772             [                                                                                  GAAATTGTTGCATCAAGGATCAAACCAATAACACTCAGGTCTCGCAGTGTGTACGTTATTATCAGACCACTAATTAAAAATTTAATGGTCCATATATCCAACTTCAGTCAGTTTATGATAGAGCGCGATAGTGATCCAATTTCATCGCTAATACATGTCTTCCTCTGGGCATAGTTAAATCCCATCAGTGGCAGCCTCTACCTAAAGCAGAAGTTGGTCATTTTTAGACACATGATTATTGCTTATTTGGTCCCTTCTTTTTAAGCTAATCCATCATGAAAACTATTACAAACGTTCTTCGGATCTAAAAAAGTAAGAAAATACAAAATCTTTGATCTCTTTTGGTGCGCACATGTGAATTTGTAACCACAATTCCATCCAAGAGCATAGAAAGAGACTAGTTACGGTTGATGACTTATCTGCTGTAGTTAAAATTTCAGAGTTCTCGTAATATCAACACGTTGGTAAGTTGTAGAGCAATAGCGTTTTTCTAAACTGCAAAACAATTTTGGATTTCCTCGTCAACTGGAAAAGGATCTTGCAGATAACAGCCTCTCATTAACTGCTCCTTATTCTTATCTAAACAGTCGTAGAGTTGAAACAAAATCTCACTTGTAGCTTATCACCAGNCAACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD073232             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTACGGTTGATGACTTATCTGCTGTAGTTAAAATTTCAGAGTTCTTGTAATATCAACACGTTGGTAAGTTGTAGAGCAATAGCGTTTTTTTAAACTGCAAAACAATTTTGGATTTCCTCGTCAACTGGAAAAGGATTTTGCAGATAACAGCCTCTCATTAACTGCTCCTTATTTTTATTTAAACAGTCGTAGAGTTGAAACAAAATTTCACTTGTAGCTTATCACCAGCAAACTATGTAAGGTATCTATTCGATATATATTGTATTTCGTTGAACATCGATACTCAATTATTGGTAGTGATCCTATAAATAATCAACCTCATGAATGATCGCTACGGTTGTCATTCATTTACTGTCTTTAATAAATATACATCTGTTTTTCATCAGTATTTTCCTGTTAACGTGAGAAGTTATGTTTTTTATCGAGCAACAAATTTTCCTTTTGAAGATTTTGTTTTAGTTATCTATTTGACTTCTATTTTTCACATATGAATGTTTTAACAAGTTAGTGTCCATTCACATTTTGAAGTGCATTGATTTAATAAATCATCTG]


>consensus_5300#0 TTTTGTTTAACCGCTAGCAACACAAAACATTTATAACGTTTACAAGGATCTATTGATTAA GGTCAATGGGTTAAATAAACAAGAAATTGTTGCATCAAGGATCAAACCAATAACACTCAG GTCTCGCAGTGTGTACGTTATTATCAGACCACTAATTAAAAATTTAATGGTCCATATATC CAACTTCAGTCAGTTTATGATAGAGCGCGATAGTGATCCAATTTCATCGCTAATACATGT CTTCCTCTGGGCATAGTTAAATCCCATCAGTGGCAGCCTCTACCTAAAGCAGAAGTTGGT CATTTTTAGACACATGATTATTGCTTATTTGGTCCCTTCTTTTTAAGCTAATCCATCATG AAAACTATTACAAACGTTCTTCGGATCTAAAAAAGTAAGAAAATACAAAATCTTTGATCT CTTTTGGTGCGCACATGTGAATTTGTAACCACAATTCCATCCAAGAGCATAGAAAGAGAC TAGTTACGGTTGATGACTTATCTGCTGTAGTTAAAATTTCAGAGTTCTCGTAATATCAAC ACGTTGGTAAGTTGTAGAGCAATAGCGTTTTTCTAAACTGCAAAACAATTTTGGATTTCC TCGTCAACTGGAAAAGGATCTTGCAGATAACAGCCTCTCATTAACTGCTCCTTATTCTTA TCTAAACAGTCGTAGAGTTGAAACAAAATCTCACTTGTAGCTTATCACCAGNCAACTATG TAAGGTATCTATTCGATATATATTGTATTTCGTTGAACATCGATACTCAATTATTGGTAG TGATCCTATAAATAATCAACCTCATGAATGATCGCTACGGTTGTCATTCATTTACTGTCT TTAATAAATATACATCTGTTTTTCATCAGTATTTTCCTGTTAACGTGAGAAGTTATGTTT TTTATCGAGCAACAAATTTTCCTTTTGAAGATTTTGTTTTAGTTATCTATTTGACTTCTA TTTTTCACATATGAATGTTTTAACAAGTTAGTGTCCATTCACATTTTGAAGTGCATTGAT TTAATAAATCATCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)