Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5401 cluster # 5401       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5401#0 length = 425 sequences # 3  
consensusID : consensus_5401#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 425
fasta sequence 
                              [TTCAAACAAACAACACAAAATGAATTTGATTAGAAGTTTGTATATTTAGTCACTGAATTTGATTGACTGATGGATTGAGTGAGTAATTATAGTCAAAGAGCACAATATCAGTAAAATAATCTTCCTGGGCTATAATAATTTGTCACCATCATAAGAAAAAATATTTATAACACTAAACAATTAATACAATAACTCACTCTTCTGGATAAGACACAGTTAAACCAGCGATTGAGGGATTTCCACAGCCCAAAAAGAAAAATGAACACATACAAGCTAAAATAATCAAATTAATCACGAGAACAAATCGGATAGCACCTATTAAATAAAATGTAAATAAACAAATAGATAAAAACATTCCAATGTTATTAAAAGAATAACAGTGTAAGTGTGACAGAGACTAATTGTTTACACTAAAAGAACATACA]

[+] EMBL CD156701             [TTCAAACAAACAACACAAAATGAATTTGATTAGAAGTTTGTATATTTAGTCACTGAATTTGATTGACTGATGGATTGAGTGAGTAATTATAGTCAAAGAGCACAATATCAGTAAAATAATCTTCCTGGGCTATAATAATTTGTCACCATCATAAGAAAAAATATTTATAACACTAAACAATTAATACAATAACTCACTCTTCTGGATAAGACACAGTTAAACCAGCGATTGAGGGATTTCCACAGCCCAAAAAGAAAAATGAACACATACAAGCTAAAATAATCAAATTAATCACGAGAACAAATCGGATAGCACCTATTAAATAAAATGTAAATAAACAAATAGATAAAAACATTCCAATGTTATTAAAAGAATAACAGTGTAAGTGTGACAGAGACTAATTGTTTACACTAAAAGAACATAC ]
[-] EMBL CD156735             [ TCAAACAAACAACACAAAATGAATTTGATTAGAAGTTTGTATATTTAGTCACTGAATTTGATTGACTGATGGATTGAGTGAGTAATTATAGTCAAAGAGCACAATATCAGTAAAATAATCTTCCTGGGCTATAATAATTTGTCACCATCATAAGAAAAAATATTTATAACACTAAACAATTAATACAATAACTCACTCTTCTGGATAAGACACAGTTAAACCAGCGATTGAGGGATTTCCACAGCCCAAAAAGAAAAATGAACACATACAAGCTAAAATAATCAAATTAATCACGAGAACAAATCGGATAGCACCTATTAAATAAAATGTAAATAAACAAATAGATAAAAACATTCCAATGTTATTAAAAGAATAACAGTGTAAGTGTGACAGAGACTAATTGTTTACACTAAAAGAACATACA]
[+] EMBL CD156657             [cTCAAACAAACAACACAAAATGAATTTGATTAGAAGTTTGTATATTTAGTCACTGAATTTGATTGACTGATGGATTGAGTGAGTAATTATAGTCAAAGAGCACAATATCAGTAAAATAATCTTCCTGGGCTATAATAATTTGTCACCATCATAAGAAAAAATATTTATAACACTAAA                                                                                                                                                                                                                                                        ]




>consensus_5401#0
TTCAAACAAACAACACAAAATGAATTTGATTAGAAGTTTGTATATTTAGTCACTGAATTT
GATTGACTGATGGATTGAGTGAGTAATTATAGTCAAAGAGCACAATATCAGTAAAATAAT
CTTCCTGGGCTATAATAATTTGTCACCATCATAAGAAAAAATATTTATAACACTAAACAA
TTAATACAATAACTCACTCTTCTGGATAAGACACAGTTAAACCAGCGATTGAGGGATTTC
CACAGCCCAAAAAGAAAAATGAACACATACAAGCTAAAATAATCAAATTAATCACGAGAA
CAAATCGGATAGCACCTATTAAATAAAATGTAAATAAACAAATAGATAAAAACATTCCAA
TGTTATTAAAAGAATAACAGTGTAAGTGTGACAGAGACTAATTGTTTACACTAAAAGAAC
ATACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)