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Schistosoma mansoni
cluster # 5425 cluster # 5425       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5425#0 length = 751 sequences # 3  

consensusID : consensus_5425#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 751
fasta sequence
                              [GTTCAGAAAAGGTTGATGATCTACCTACTAATTTTTTCTTACTTTGTTGTTAATCTAAGATCCTTTTCACTGTTTCGTCTGTATTCCTGCAACCTACCATCCTTATTATGTTATCTTTAATTTTTAAAGCTCATTCCTCATTCGTTCAATTTAATTTAATTATTAAGCAAATTTTATTATTAATAATCGATAGCATAGACACATGATTTTCATGTTAATTGGTAGAGTTTACAACCCTGTGAAACTCTGATTCATAAAATGTTAATTGATCATAAGTGTTTTGGGTTATAATCACCGACATGATTGCATGTACACTGGTACATAACCTTACCTACTATTGAAATAAAGCAAGATTGATTGTCAACAAAATTCCATAATGATTTTGGTTAAAGTTAACATATAGTCTGTCTTACAATATCTAAGACATTTTCTGGACACCTCATTAAAGGAAACAACTTCTCTTGGAGCACTTCTAGAGTTACTACTGGTCCCAAGTTTGGGTAGAGGAGGAGGTTTGGGATGGGGTCATCAACCTTATCTCGTAGAAGGAAACCTTGCTAAAAGAATACGCTAAACAGAAATAATCACTCGGATAAGCAAGTAATAAAAGGATATATATATGTTAAGTTGTTGGAGGTGCCTGATAAGAAACCGTAGTTCTGCATTTCTTGCAAGTTGTTGACACTCGTCAGCAAGGTCTCTTTACAATCTTGAGAGACCTGATGCTCTCAGTGGTATCCTACTACTCGTC]

[+] EMBL CD112459             [GTTCAGAAAAGGTTGATGATCTACCTACTAATTTTTTCTTACTTTGTTGTTAATCTAAGATCCTTTTCACTGTTTCGTCTGTATTCCTGCAACCTACCATCCTTATTATGTTATCTTTAATTTTTAAAGCTCATTCCTCATTCGTTCAATTTAATTTAATTATTAAGCAAATTTTATTATTAATAATCGATAGCATAGACACATGATTTTCATGTTAATTGGTAGAGTTTACAACCCTGTGAAACTCTGATTCATAAAATGTTAATTGATCATAAGTGTTTTGGGTTATAATCACCGACATGATTGCATGTACACTGGTACATAACCTTACCTACTATTGAAATAAAGCAAGATTGATTGTCAACAAAATTCCATAATGATTTTGGTTAAAGTTAACATATAGTCTGTCTTACAATATCTAAGACATTTTCTGGACACCTCATTAAAGGAAACCACTTCTCTTGGAGCACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD112222             [                                                                                                                                                                                                          ATGA TTTCATGTTAATTGGTAGAGTTTACAACCCTGTGAAACTCTGATTCATAAAATGTTAATTGATCATAAGTGTTTTGGGTTATAATCACCGACATGATTGCATGTACACTGGTACATAACCTTACCTACTATTGAAATAAAGCAAGATTGATTGTCAACAAAATTCCATAATGATTTTGGTTAAAGTTAACATATAGTCTGTCTTACAATATCTAAGACATTTTCTGGACACCTCATTAAAGGAAACAACTTCTCTTGGAGCACTTCTAGAGTTACTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD112165             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CGACATGATGGCATGTACACTGGTACATAACCTTACCTACTATTGAAATAAAGCAAGATTGATTGTCAACAAAATTCCATAATGATTTTGGTTAAAGTTAACATATAGTCTGTCTTACAATATCTAAGACATTTTCTGGACACCTCATTAAAGGAAACAACTTCTCTTGGAGCACTTCTAGAGTTACTACTGGTCCCAAGTTTGGGTAGAGGAGGAGGTTTGGGATGGGGTCATCAACCTTATCTCGTAGAAGGAAACCTTGCTAAAAGAATACGCTAAACAGAAATAATCACTCGGATAAGCAAGTAATAAAAGGATATATATATGTTAAGTTGTTGGAGGTGCCTGATAAGAAACCGTAGTTCTGCATTTCTTGCAAGTTGTTGACACTCGTCAGCAAGGTCTCTTTACAATCTTGAGAGACCTGATGCTCTCAGTGGTATCCTACTACTCGTC]


>consensus_5425#0 GTTCAGAAAAGGTTGATGATCTACCTACTAATTTTTTCTTACTTTGTTGTTAATCTAAGA TCCTTTTCACTGTTTCGTCTGTATTCCTGCAACCTACCATCCTTATTATGTTATCTTTAA TTTTTAAAGCTCATTCCTCATTCGTTCAATTTAATTTAATTATTAAGCAAATTTTATTAT TAATAATCGATAGCATAGACACATGATTTTCATGTTAATTGGTAGAGTTTACAACCCTGT GAAACTCTGATTCATAAAATGTTAATTGATCATAAGTGTTTTGGGTTATAATCACCGACA TGATTGCATGTACACTGGTACATAACCTTACCTACTATTGAAATAAAGCAAGATTGATTG TCAACAAAATTCCATAATGATTTTGGTTAAAGTTAACATATAGTCTGTCTTACAATATCT AAGACATTTTCTGGACACCTCATTAAAGGAAACAACTTCTCTTGGAGCACTTCTAGAGTT ACTACTGGTCCCAAGTTTGGGTAGAGGAGGAGGTTTGGGATGGGGTCATCAACCTTATCT CGTAGAAGGAAACCTTGCTAAAAGAATACGCTAAACAGAAATAATCACTCGGATAAGCAA GTAATAAAAGGATATATATATGTTAAGTTGTTGGAGGTGCCTGATAAGAAACCGTAGTTC TGCATTTCTTGCAAGTTGTTGACACTCGTCAGCAAGGTCTCTTTACAATCTTGAGAGACC TGATGCTCTCAGTGGTATCCTACTACTCGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)