These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5467#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 563 fasta sequence [AACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGG-AAAAAAAAACTATTAATAAGAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAAAATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACCAAGTTAAACTGTTTACAGATCTTTAAAGATTTCTTTTAAGCAATTTCTTATGTAAATGAATTTTGGACGTTCTGTACGATCAGCTGACCAACATTTAAGCATTAATTGATAAACAGATTCTGGACATTGAAATGGACGTGTTAAACGATCACCTTGTTCCAAAAGCTTAATAATTTCTGTATGACTTAAATCAGTAAATGGTTCAACAGCGTAACTAAAAACTTCCCATAATAAAACTCCAAAAGACCAAACATCAGTATCTATATGAAATTTTCCGTCTAAAATTGATTCAAGAGGTAACCATTTTATCGGCAAACATTCATTGGAAGTAGAGATAAAATCAACACCAGATTGAATTGGTCTACACATTGAAAAATCTGATA] [+] EMBL CD073576 [AACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGG AAAAAAAAACTATTAATAAAAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAAAATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACCAAGTTAAACTGTTTACAGATCTTTAAAGATTTCTTTTAAGCAATTTCTTATGTAAATGAATTTTGGACGTTCTGTACGATCAGCTGACCAACATTTAAGCATTAATTGATAAACAGATTCTGGACATTGAAATGGACGTGTTAAACGATCACCTTGTTCCAAAAGCTTAATAATTTCTGTATGACTTAAATCAGTAAATGGTTCAACAGCGTAACTAAAAACTTCCCATAATAAAACTCCAAAAGACCAAACATCAGTATCTATATGAAATTTTCCGTCTAAAATTGATTCAAGAGGTAACCATTTTATCGGCAAACATTCATTGGAAGTAGAGATAAAATCAACACCAGATTGAATTGGTCTACACATTGAAAAATCTGATA] [+] EMBL CD077147 [AACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGG AAAAAAAAACTATTAATAAGAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAAAATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACCAAGTTAAACTGTTTACAGATCTTTAAAGATTTCTTTTAAGCAATTTTTTATGTAAATGAATTTTGGACGTTCTGTACGATCAGCTGACCAACATTTAAGCATTAATTGATAAACAGATTCTGGACATTGAGATGGACGTGTTAAACGATCACCTTGTTCCAAAAGCTTAATAATTTCTGTATGACTTAGATCAGTAAATGGTTCAACAGCGTAACTAAAAACTTCCCATAATAAAACTCCAAA ] [-] EMBL AI447068 [ ACAATATTTAACTTAAAATACTGTACAGTAAAAATTATAGCAGGAATTAAGTTATGGAAAAAAAAAACTATTAATAAGAAAACCGTAAACAACAAATATTTCGTTGGAAAAAGTTTTAAAAATAAATAATCAATAATCATGTCTGATTCTCTGTTAATAAAATTGAAATAGTTCATTACCAAGTTAAACTG TTACAGATCTTTAAAGA TTCTTTTAAGCAATTTCTTATGTAAATGAATTTTGGACGTTCTGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||