These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5549#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1065 fasta sequence [CTACTGTGTCCAGATATCCCTGAATAGGGCAGAACTCACATCCTGGATTACACTTCGAGCCACCCTCAATTTGTGCTTTAAAAATTATTAACAGTTGTTTGAATATCATATGGACATTATGATGATAAGTTTTGTACGCGGATTTAAGAACGTTTGTTGTAACTATAGTCAATCAATCACTCGATGCTCACATTGTTTACTGTCTACAATGTTAGTTTTAGTTACTGTATGTCATTCTGCTTTTCTTAAATCATGAAGTCCGTCTCATGCAAATCTTCCAAGGTTTTCTCTTTCTGGGGATTCTTTATAAATTTTCATTTAGCAACCAATACTTGTGAATGACTAACTACTTTTCGTATGTCAAAACCGGACAATTATGAAAATGGAAAACATTGTTTTAAAAGAGATTTGTTGATATTGTTTGACTACATTGGCGCTATATCCCTGCATAATAAGCTTAATATTTTTAGTTACTCAGATTATTTACAGCGGTTATTTTACTTTTCATAACCTTTAAAGAATGATATTTCACCGTCTGTGGTATGAGCTACTTTCCTATTGATCTATTC-AAATTCCATACTGAATTANATCAAGTTCTTTTTTGAAAGGATTCATTTTNTGCTACGTAATATTTAAATACCATATTCAAATAAAAAAATAAGCTGTTTTACTTCGTTGAAAAGTACCAATATGCATAAATTATTAGTTAATTACCATAAAAATGAGAAGATATCTCTGACATGTGTCTAATTGTTTTGTACAAAAATATCTAACAAGCATAACGCCACATAGAACAGATGGGATGTAGTTAGCGATAGAATCTAGGACACACATATCGTCCTATTTATCTAAATTACTTACCAGACAAATGAAATCATTTTGTCTACTTCTCATCAATAAACTAATTTCAAGTTATTTAAGCATGGTCTATGATTTGAAAAAGAAGTAGTTCAAAGTTTATGGCGATCATGATATTTCTGAGTTTTTCGTAGTCCTTCATTTGTTTATATGTCTGTTTGTTTATTTACTGATTTATTCGTCGCTTTAACTACCGTATAACGGACT] [+] EMBL CD085097 [CTACTGTGTCCAGATATCCCTGAATAGGGCAGAACTCACATCCTGGATTACACTTCGAGCCACCCTCAATTTGTGCTTTAAAAATTATTAACAGTTGTTTGAATATCATATGGACATTATGATGATAAGTTTTGTACGCGGATTTAAGAACGTTTGTTGTAACTATAGTCAATCAATCACTCGATGCTCACATTGTTTACTGTCTACAATGTTAGTTTTAGTTACTGTATGTCATTCTGCTTTTCTTAAATCATGAAGTCCGTCTCATGCAAATCTTCCAAGGTTTTCTCTTTCTGGGGATTCTTTATAAATTTTCATTTAGCAACCAATACTTGTGAATGACTAACTACTTTTCGTATGTCAAAACCGGACAATTATGAAAATGGAAAACATTGTTTTAAAAGAGATTTGTTGATATTGTTTGACTACATTGGCGCTATATCCCTGCATAATAAGCTTAATATTTTTAGTTACTCAGATTATTTACAGCGGTTATTTTACTTTTCATAACCTTTAAAGAATGATATTTCACCGTCTGTGGTATGAGCTACTTTCCTATTGATCTATTC AAATTCCATACTGAATTANATCAAG ] [+] EMBL CD085323 [CTACTGTGTCCAGATATCCCTGAATAGGGCAGAACTCACATCCTGGATTACACTTCGAGCCACCCTCAATTTGTGCTTTAAAAATTATTAACAGTTGTTTGAATATCATATGGACATTATGATGATAAGTTTTGTACGCGGATTTAAGAACGTTTGTTGTAACTATAGTCAATCAATCACTCGATGCTCACATTGTTTACTGTCTACAATGTTAGTTTTAGTTACTGTATGTCATTCTGCTTTTCTTAAATCATGAAGCCCGTCTCATGCAAATCTTCCAAGGTTTTCTCTTTCTGGGGATTCTTTATAAATTTTCATTTAGCAACCAATACTTGTGAATGACTAACTACTTTTCGTATGTCAAAACCGGACAATTATGAAAATGGAAAACATTGTTTTAAAAGAGATTTGTTGATATTGTTTGACTACATTGGCGCTATATCCCTGCATAATAAGCTTAATATTTTTAGTTACTCAGATTATTTACAGCGGTTATTTTCCTCTTCATAACCTATAAAGAATGAT ] [-] EMBL CD085113 [ TCATANCCTTTAAAGAATGATATTTCACCGTCTGTGGTATGAGCTACTTTCCTATTGATCTATTCAAAATTCCATACTGAATTAAATCAAGTTCTTTTTTGAAAGGATTCATTTTNTGCTACGTAATATTTAAATACCATATTCAAATAAAAAAATAAGCTGTTTTACTTCGTTGAAAAGTACCAATATGCATAAATTATTAGTTAATTACCATAAAAATGAGAAGATATCTCTGACATGTGTCTAATTGTTTTGTACAAAAATATCTAACAAGCATAACGCCACATAGAACAGATGGGATGTAGTTAGCGATAGAATCTAGGACACACATATCGTCCTATTTATCTAAATTACTTACCAGACAAATGAAATCATTTTGTCTACTTCTCATCAATAAACTAATTTCAAGTTATTTAAGCATGGTCTATGATTTGAAAAAGAAGTAGTTCAAAGTTTATGGCGATCATGATATTTCTGAGTTTTTCGTAGTCCTTCATTTGTTTATATGTCTGTTTGTTTATTTACTGATTTATTCGTCGCTTTAACTACCGTATAACGGACT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||