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Schistosoma mansoni
cluster # 5596 cluster # 5596       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5596#0 length = 1267 sequences # 3  
consensusID : consensus_5596#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1267
fasta sequence 
                              [TCATATAAATACATTTATATATTCCTATATTTTATAAATGTAGTTATGTGTATACAAATAACAATAATAACTACAATATAAACAGTGTTAATTGCTGGTTAACTTTGTATTAGCAAATATATCAGCTAGATGAATTACTTCATCTAACGTATCAATACGACTGCCAACAGCTTGAGCTGAATTTTCTTTACCACCTCCTTTACCATCCATTGTTTTACTAATATGTGTAACCCATTCATTAGCTTTTAAACCACGTGAAATAAGTACTTTTGGGACTTGACAAAGAACAGTCAATTTCTTTGAAGTAAGGTCTGAAGAAATTACCATTACAGCTTTGTTCGGGCATATTCGTTCTATTTCTTTTATAGCAGAATTCATAATTTTTGTATTCGATTGAGCATCGAAAACATGAATGATATAATTACTAGGAGAGTTAGTAAGACTTTCACCTAATAATCGAGCCTCTTCTAAAACCTTAGAAGTAATAGCTGTCTTTGATGCTTTATCACGTGCATCTAATAATTTTTTGGGCTTTAAATAATTTTTCACGTAAATTTTCTCGATGATGTTGACTAATAACAGCACGTGAAACATGTTCAGATAAATTGGACATTTGTCGATTTATATTGAAATCATCAGTTATATTATTATTATGGTTTTGATGAAGAGAAATTTATTGATTCACTAATTTAATGAATTCATCAACTTCATTATCAAGTCGTAAAGCTTCTTTTCGTGCACGTTCAGCTTCGTGCCCAGTGAGAGCTATAATACGTCGAACACCTTAAGATATGGCCTCTTCACTAACAATCACTAAAACTCCAATATGTTTAGTATTAAGAACATGAGTTCCACCATCATATTCAACTGAGGTAGTTTTACCATATCCCGTTTCTGGATCAGCCACTAAACTTGTCACAGGGACTCCAATGGAAACAACTCGAACAGGATCAGGATACGCTTCACCGAATACTGCACGCACTCCTTGAATAGTTTTAGCATATGACAGTGAAACATTTGATGAATAGACATTTAAACGTTTGCTTATCATTGTATCACAGATTTCTTCAGCTTTAGCTAATTCATCACGAGTCATACCCCGCTTGGCAGTAAAATCAAATCGTAAACGGTCTGGTGCAACTAAACTACCCTTTTGTTCTGATTCATCTACTAATTCACGAAGAGCAGAATTTAATACATGAGTTCCAGTATGATTACGCATTGAAGCTGTACGTCGTACAGTATCTAATGAAAGAAGTACTCTGTT]

[+] EMBL AI976152             [TCATATAAATACATTTATATATTCCTATATTTTATAAATGTAGTTATGTGTATACAAATAACAATAATAACTACAATATAAACAGTGTTAATTGCTGGTTAACTTTGTATTAGCAAATATATCAGCTAGATGAATTACTTCATCTAACGTATCAATACGACTGCCAACAGCTTGAGCTGAATTTTCTTTACCACCTCCTTTACCATCCATTGTTTTACTAATATGTGTAACCCATTCATTAGCTTTTAAACCACGTGAAATAAGTACTTTTGGGACTTGACAAAGAACAGTCAATTTCTTTGAAGTAAGGTCTGAAGAAATTACCATTACAGCTTTGTTCGGGCATATTCGTTCTATTTCTTTTATAGCAGAATTCATAATTTTTGTATTCGATTGAGCATCGAAAACATGAATGATATAATTACTAGGAGAGTTAGTAAGACTTTCACCTAATAATCGAGCCTCTTCTAAAACCTTAGAAGTAATAGCTGTCTTTGATGCTTTATCACGTGCATCTAATAATTTTTTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD098065             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CATTACAGCTTTATTCGGGCATATTCCTTCTATTTCTTTTATAGCAGAATTCATAATTTTTGTATTCGATTGAGCATCGAAAACATGAATGATATAATTACTAGGAGAGTTAGCAAGACCTTTACCTAATAATCGAGCCTCTTCTAAAACCTTAGAAGTAATAGCTGTCTTTGATGCTTTATCACGTGCATCTAATAATTTTTTTGGCTTTAAATAATTTTTCACGTAAATTTTCTCGATGATGTTGACTAATAACAGCACGTGAAACATGTTCAGATAAATTGGACATTTGTCGATTTATATTGAAATCATCAGTTATATTATTATTATGGTTTTGATGAAGAGAAATTTATTGATTCACTAATTTAATGAATTCATCAACTTCATTATCAAGTCGTAAAGCTTCTTTTCGTGCACGTTCAGCTTCGTGCCCAGTGAGAGCTATAATACGTCGAACACCTTAAGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD115694             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tctgGCACGTTCAGCTTCGTGGCCAGTGAGAGCTATAATACGTCGAACACCTTTAGATATGGCCTCTTCACTAACAATCACTAAAACTCCAATATGTTTAGTATTAAGAACATGAGTTCCACCATCATATTCAACTGAGGTAGTTTTACCATATCCCGTTTCTGGATCAGCCACTAAACTTGTCACAGGGACTCCAATGGAAACAACTCGAACAGGATCAGGATACGCTTCACCGAATACTGCACGCACTCCTTGAATAGTTTTAGCATATGACAGTGAAACATTTGATGAATAGACATTTAAACGTTTGCTTATCATTGTATCACAGATTTCTTCAGCTTTAGCTAATTCATCACGAGTCATACCCCGCTTGGCAGTAAAATCAAATCGTAAACGGTCTGGTGCAACTAAACTACCCTTTTGTTCTGATTCATCTACTAATTCACGAAGAGCAGAATTTAATACATGAGTTCCAGTATGATTACGCATTGAAGCTGTACGTCGTACAGTATCTAATGAAAGAAGTACTCTGTT]




>consensus_5596#0
TCATATAAATACATTTATATATTCCTATATTTTATAAATGTAGTTATGTGTATACAAATA
ACAATAATAACTACAATATAAACAGTGTTAATTGCTGGTTAACTTTGTATTAGCAAATAT
ATCAGCTAGATGAATTACTTCATCTAACGTATCAATACGACTGCCAACAGCTTGAGCTGA
ATTTTCTTTACCACCTCCTTTACCATCCATTGTTTTACTAATATGTGTAACCCATTCATT
AGCTTTTAAACCACGTGAAATAAGTACTTTTGGGACTTGACAAAGAACAGTCAATTTCTT
TGAAGTAAGGTCTGAAGAAATTACCATTACAGCTTTGTTCGGGCATATTCGTTCTATTTC
TTTTATAGCAGAATTCATAATTTTTGTATTCGATTGAGCATCGAAAACATGAATGATATA
ATTACTAGGAGAGTTAGTAAGACTTTCACCTAATAATCGAGCCTCTTCTAAAACCTTAGA
AGTAATAGCTGTCTTTGATGCTTTATCACGTGCATCTAATAATTTTTTGGGCTTTAAATA
ATTTTTCACGTAAATTTTCTCGATGATGTTGACTAATAACAGCACGTGAAACATGTTCAG
ATAAATTGGACATTTGTCGATTTATATTGAAATCATCAGTTATATTATTATTATGGTTTT
GATGAAGAGAAATTTATTGATTCACTAATTTAATGAATTCATCAACTTCATTATCAAGTC
GTAAAGCTTCTTTTCGTGCACGTTCAGCTTCGTGCCCAGTGAGAGCTATAATACGTCGAA
CACCTTAAGATATGGCCTCTTCACTAACAATCACTAAAACTCCAATATGTTTAGTATTAA
GAACATGAGTTCCACCATCATATTCAACTGAGGTAGTTTTACCATATCCCGTTTCTGGAT
CAGCCACTAAACTTGTCACAGGGACTCCAATGGAAACAACTCGAACAGGATCAGGATACG
CTTCACCGAATACTGCACGCACTCCTTGAATAGTTTTAGCATATGACAGTGAAACATTTG
ATGAATAGACATTTAAACGTTTGCTTATCATTGTATCACAGATTTCTTCAGCTTTAGCTA
ATTCATCACGAGTCATACCCCGCTTGGCAGTAAAATCAAATCGTAAACGGTCTGGTGCAA
CTAAACTACCCTTTTGTTCTGATTCATCTACTAATTCACGAAGAGCAGAATTTAATACAT
GAGTTCCAGTATGATTACGCATTGAAGCTGTACGTCGTACAGTATCTAATGAAAGAAGTA
CTCTGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)