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Schistosoma mansoni
cluster # 5599 cluster # 5599       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5599#0 length = 506 sequences # 3  

consensusID : consensus_5599#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 506
fasta sequence
                              [ACTACAGACTTAACGACCTTTCTGCCATTCGTTCGGCGTCATCTTTTGATTAAACTGGGAGTGGAAACAAAATAAACCAATTATATACCGAGTGTCCTCAAGAAATACTTTTACACTCAAATAGGAAAAACCTACTAAATGGGATCTCCAGCAGATTTAATCACATACAGTCCCGCTGCGGCACAGCATAACCTTGCTTTGATTAACTACTGCCGCATATCTATCGCGGCCCTTTCTGGATGTACAGCCGGGATATTAGGTTTAACAGGAATCATGGGATTTATGTTTTATTTTCTGGCACATGGTTTCCTATCATTGTTACT-GTTACAAAAGGCAGGAAAATCATGGAACAAATACCTAATT-AGCGTTCGTGTNTAACGTATGGAGGGGTTTTCGGAGAACTAACTACTTATATTTTATTTTGGACATTTATCTATGGCATGGTTCATGTATATTGAACATAATCTAAATGTATTTACCTAATTTGATTAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD179846             [ACTACAGACTTAACGACCTTTCTGCCATTCGTTCGGCGTCATCTTTTGATTAAACTGGGAGTGGAAACAAAATAAACCAATTATATACCGAGTGTCCTCAAGAAATACTTTTACACTCAAATAGGAAAAACCTACTAAATGGGATCTCCAGCAGATTTAATCACATACAGTCCCGCTGCGGCACAGCATAACCTTGCTTTGATTAACTACTGCCGCATATCTATCGCGGCCCTTTCTGGATGTACAGCCGGGATATTAGGTTTAACAGGAATCATGGGATTTATGTTTTATTTTCTGGCACATGGTTTCCTATCATTGTTACT GTTACAAAAGGCAGGAAAATCATGGAACAAATACCTAATT AGCGTTCGTGTNTAACGTATGGAGGGGTTTTCGGAGAACTAACTACTTATAT                                                                                           ]
[+] EMBL CD179970             [ACTACAGACTTAACGACCTTTCTGCCATTCGTTCGGCGTCATCTTTTGATTAAACTGGGAGTGGAAACAAAATAAACCAATTATATACCGAGTGTCCTCAAGAAATACTTTTACACTCAAATAGGAAAAACCTACTAAATGGGATCTCCAGCAGATTTAATCACATACAGTCCCGCTGCGGCACAGCATAACCTTGCTTTGATTAACTACTGCCGCATATCTATCGCGGCCCTTTCTGGATGTACAGCCGGGATATTAGGTTTAACAGGAATCATGGGATTTATGTTTTATTTTCTGGCACATGGTTTCCTATCATTGTTACTGGGTACAAAGGGCAGGAAA                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL AI394885             [                                                                                                                                                                                              ACCCTGCTTTGATTAGCTACTGCCGCATATCTATCGCGGCCCTTTCTGGATGTACAGCCGGGATATTAGGTTTAACAGGAATCATGGGATTTATGTTTTATTTTCTGGCACATGGTTTCCTATCATTGTTACT GTTACAAAAGGCAGGAAAATCATGGAACAAATACTTTATTCAGCGTTCGTGTTTAACGTATGGAGGGGTTTTCGGAGAACTAACTACTTATATTTTATTTTGGACATTTATCTATGGCATGGTTCATGTATATTGAACATAATCTAAATGTATTTACCTAATTTGATTAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_5599#0 ACTACAGACTTAACGACCTTTCTGCCATTCGTTCGGCGTCATCTTTTGATTAAACTGGGA GTGGAAACAAAATAAACCAATTATATACCGAGTGTCCTCAAGAAATACTTTTACACTCAA ATAGGAAAAACCTACTAAATGGGATCTCCAGCAGATTTAATCACATACAGTCCCGCTGCG GCACAGCATAACCTTGCTTTGATTAACTACTGCCGCATATCTATCGCGGCCCTTTCTGGA TGTACAGCCGGGATATTAGGTTTAACAGGAATCATGGGATTTATGTTTTATTTTCTGGCA CATGGTTTCCTATCATTGTTACTGTTACAAAAGGCAGGAAAATCATGGAACAAATACCTA ATTAGCGTTCGTGTNTAACGTATGGAGGGGTTTTCGGAGAACTAACTACTTATATTTTAT TTTGGACATTTATCTATGGCATGGTTCATGTATATTGAACATAATCTAAATGTATTTACC TAATTTGATTAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)