cluster # 565

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Schistosoma mansoni
cluster # 565 cluster # 565 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_565#0 length = 921 sequences # 2

consensusID : consensus_565#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 921
fasta sequence

                              [CCAGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTTTTAGACTTTGATTCTCGTTTTTATCGACCTATGCGATCTGCTCTTCTTGGTTTCTGGCGTCGTTAATAATATCTCCCTAATATACTTAGCTTATTTGTTTAAGTAGCATATTTGTCTAATCTTGCTTTGTGTCTGTTCCTTCGTTTGTTTGTTGTTGTTTCTTTTTTACTGAGGTAGTGTTTTTTTGTATAGATTTTTTTTTCATTTTCCAGCTTAAATGTAAAATGTTTCAGTTTACAGTTCAGGTCTACATAATCCACACGTTACATGATATTTGTTGTGCTTTTATCTTTCTTTTCAGTTACTTATTTCTGTTGATGTCCTTTTTGTTTTTCTTCCTTAATTGTAATTTTTGACTTAAGCTTTTTCTTTTAATCATCATATTTATTTATTTATTCATTCTGTGTTGTTAGTATCATTATTCATATTGCTACCACTCATTGTAATGAAATTTATCATTTTCTGTGTTCATGCATAATATATCACTGATGTTTTCATCTACTCCGATAATATCTACGTATATATATGGATAACTTGTTTTGAATTTTCGCTTTCGAAGTTTTCGATTTAAGTATTGATTCTATGATGATCCGCGTTTGTGGTGATTTCACCCTTTCTAATTTTTAATATAAAATCAATAAAATTGTATACTGTAAACAAACAATATTTTAAACAATGCATTTACAGTAGATAATGTGTAGACAATGAATATTCATCAGTAGNATATTGGTTCTATTTTTCTCTCTGTCATTGNCAAATGGGCTTATTATTTATCACTGACCTTNNTCTANNTCTC-TATCATTNCATGATATATNCATTNCTTATTTGCTANTAACCC-TTATAG-NTTTATGATAAG-TATACTATA-TTCA-TAC-ATTNGAA-TACT-TNAAAGTATA]

[+] EMBL CD081100             [CCAGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTTTTAGACTTTGATTCTCGTTTTTATCGACCTATGCGATCTGCTCTTCTTGGTTTCTGGCGTCGTTAATAATATCTCCCTAATATACTTAGCTTATTTGTTTAAGTAGCATATTTGTCTAATCTTGCTTTGTGTCTGTTCCTTCGTTTGTTTGTTGTTGTTTCTTTTTTACTGAGGTAGTGTTTTTTTGTATAGATTTTTTTTTCATTTTCCAGCTTAAATGTAAAATGTTTCAGTTTACAGTTCAGGTCTACATAATCCACACGTTACATGATATTTGTTGTGCTTTTATCTTTCTTTTCAGTTACTTATTTCTGTTGATGTCCTTTTTGTTTTTCTTCCTTAATTGTAATTTTTGACTTAAGCTTTTTCTTTTAATCATCATATTTATTTATTTATTCATTCTGTGTTGTTAGTATCATTATTCATATTGCTACCACTCATTGTAATGAAATTTATCATTTTCTGTGTTCATGCATAATATATCACTGATGTTTTCATCTACTCCGATAATATCTACGTATATATATGGATAACTTGTTTTGAATTTTCGCTTTCGAAGTTTTCGATTTAAGTATTGATTCTATGATGATCCGCGTTTGTGGTGATTTCACCCTTTCTAATTTTTAATATAAAATCAATAAAATTGTATACTGTAAACAAACAATATTTTAAACAATGCATTTACAGTAGATAATGTGTAGACAATGAATATTCATCAGTAGNATATTGGTTCTATTTTTCTCTCTGTCATTGNCAAATGGGCTTATTATTTATCACTGACCTTNNTCTANNTCTC TATCATTNCATGATATATNCATTNCTTATTTGCTANTAACCC TTATAG NTTTATGATAAG TATACTATA TTCA TAC ATTNGAA TACT TNAAAG    ]
[-] EMBL CD074923             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACGTTACATGATATTTGTTGTGCTTTTATCTTTCTTTTCAGTTACTTATTTCTGTTGATGTCCTTTTTGTTTTTCTTCCTTAATTGTAATTTTTGACTTAAGCTTTTTCTTTTAATCATCATATTTATTTATTTATTCATTCTGTGTTGTTAGTATCATTATTCATATTGCTACCACTCATTGTAATGAAATTTATCATTTTCTGTGTTCATGCATAATATATCACTGATGTTTTCATCTACTCCGATAATATCTACGTATATATATGGATAACTTGTTTTGAATTTTCGCTTTCGAAGTTTTCGATTTAAGTATTGATTCTATGATGATCCGCGTTTGTGGTGATTTCACCCTTTCTAATTTTTAATATAAAATCAATAAAATTGTATACTGTAAACAAACAATATTTTAAACAATGTATTTACAGTAGATAATGTGTAGACAATGAATATTCATCAGTAGTATATTGTTTCTATTTTTCTCTCTGTCATTGTCAAATGGCTTTATTATTTATCACTGACCTTTTTCTA TTCTCTTATCATTTCATGATATATTCATTCTTTATTTGCTATAAACCCTTTATAGTTTTTATGATAAGTTATACTATATTTCATTACAATTTGAATTACTATAAAAGTATA]




>consensus_565#0
CCAGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTTTTAGACTTTGATTCTCGTTTTTATCGACCTAT
GCGATCTGCTCTTCTTGGTTTCTGGCGTCGTTAATAATATCTCCCTAATATACTTAGCTT
ATTTGTTTAAGTAGCATATTTGTCTAATCTTGCTTTGTGTCTGTTCCTTCGTTTGTTTGT
TGTTGTTTCTTTTTTACTGAGGTAGTGTTTTTTTGTATAGATTTTTTTTTCATTTTCCAG
CTTAAATGTAAAATGTTTCAGTTTACAGTTCAGGTCTACATAATCCACACGTTACATGAT
ATTTGTTGTGCTTTTATCTTTCTTTTCAGTTACTTATTTCTGTTGATGTCCTTTTTGTTT
TTCTTCCTTAATTGTAATTTTTGACTTAAGCTTTTTCTTTTAATCATCATATTTATTTAT
TTATTCATTCTGTGTTGTTAGTATCATTATTCATATTGCTACCACTCATTGTAATGAAAT
TTATCATTTTCTGTGTTCATGCATAATATATCACTGATGTTTTCATCTACTCCGATAATA
TCTACGTATATATATGGATAACTTGTTTTGAATTTTCGCTTTCGAAGTTTTCGATTTAAG
TATTGATTCTATGATGATCCGCGTTTGTGGTGATTTCACCCTTTCTAATTTTTAATATAA
AATCAATAAAATTGTATACTGTAAACAAACAATATTTTAAACAATGCATTTACAGTAGAT
AATGTGTAGACAATGAATATTCATCAGTAGNATATTGGTTCTATTTTTCTCTCTGTCATT
GNCAAATGGGCTTATTATTTATCACTGACCTTNNTCTANNTCTCTATCATTNCATGATAT
ATNCATTNCTTATTTGCTANTAACCCTTATAGNTTTATGATAAGTATACTATATTCATAC
ATTNGAATACTTNAAAGTATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case