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Schistosoma mansoni
cluster # 5758 cluster # 5758       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5758#0 length = 886 sequences # 3  

consensusID : consensus_5758#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 886
fasta sequence
                              [TATGGAAATGTCTATTAATTCTTATGGTAAACGTAATTGGACTGATCAAGATTATTTATTATCTAATTATACTCAACATTATAATGATAAACAAAATCATTTATCCTATTGTATAACAGATACATTTAATCAATGTTCAACATTACATGATAGTAACAGTACTAATAATATGGATCATGTACCGACAACGACAACATCCTCATCGTCGTCATCGTCAATGTCGTCATCGTTGTCATGTCAATATCAACCACCAATCAAACGTGTAGCTAATGAACGTGAACGTACACGTACAGCTAGTGTTAATGATGCATTTCTTATGTTACGTAATTTAATACCAACTCAACCAATTAATCGTAAATTATCCAAAATTGAAACATTACGCTTAGCATCATCCTATATATCCCATTTACATGCTATATTAGTAACTGGTTCAGGCCCCGCAGATCAACCATGTTTAAAACATCAACAAATTTATCATTTAAATGCTACTACTAATACTACTAATAATGATCATAATAGTAGTAGTAATGATAATCTTGATAAGAATCAACTCATTTTTAATTATAATAAACCATATAGATCAGTGTGTACATTNTGTGTAACAGAAATGAAACAANCATCACCGTATTTTAAATAAAGAAACAATTTTATTATCGAATGGCCAATAAAATGATGTCCAGTTTATTTTAATGGTGGGGGTTATTGTTGTTGTTGCTGTGGTGGTGTTGTTGTTGTTATGGTGGTGGTGTTGTTGCTATAGTGGTGTTGTTGTTGTTTTTTTGTTTTTCTTTTCTTTCTTTTTTTCCTTCAAAATTTGAATCCATATATACACATATATATATATATTGTAATGTTTAAATGAACAAATAAATAAACATTGAAGATA]

[+] EMBL CD082502             [TATGGAAATGTCTATTAATTCTTATGGTAAACGTAATTGGACTGATCAAGATTATTTATTATCTAATTATACTCAACATTATAATGATAAACAAAATCATTTATCCTATTGTATAACAGATACATTTAATCAATGTTCAACATTACATGATAGTAACAGTACTAATAATATGGATCATGTACCGACAACGACAACATCCTCATCGTCGTCATCGTCAATGTCGTCATCGTTGTCATGTCAATATCAACCACCAATCAAACGTGTAGCTAATGAACGTGAACGTACACGTACAGCTAGTGTTAATGATGCATTTCTTATGTTACGTAATTTAATACCAACTCAACCAATTAATCGTAAATTATCCAAAATTGAAACATTACGCTTAGCATCATCCTATATATCCCATTTACATGCTATATTAGTAACTGGTTCAGGCCCCGCAGATCAACCATGTTTAAAACATCAACAAATTTATCATTTAAATGCTACTACTAATACTACTAATAATGATCATAATAGTAGTAGTAATGATAATCTTGATAAGAATCAACTCATTTTTAATTATAATAAACCATATAGATCAGTGTGTACATTNTGTGTAACAGAAATGAAACAANCATCAC                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD197650             [                                                                                                                                                                                            CGACAACATCCTCATCGTCGTCATCGTCAATGTCGTCATCGTTGTCATGTCAATATCAACCACCAATCAAACGTGTAGCTAATGAACGTGAACGTACACGTACAGCTAGTGTTAATGATGCATTTCTTATGTTACGTAATTTAATACCAACTCAACCAATTAATCGTAAATTATCCAAAATTGAAACATTACGCTTAGCATCATCCTATATATCCCATTTACATGCTATATTAGTAACTGGTTCAGGCCCCGCAGATCAACCATGTTTAAAACATCAACAAATTTATCATTTAAATGCTACTACTAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076097             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAATCGTAAATTATCCAAAATTGAAACATTACGCTTAGCATCATCCTATATATCCCATTTACATGCTATATTAGTAACTGGTTCAGGCCCCGCAGATCAACCATGTTTAAAACATCAACAAATTTATCATTTAAATGCTACTACTAATACTACTAATAATGATCATAATAGTAGTAGTAATGATAATCTTGATAAGAATCAACTCATTTTTAATTATAATAAACCATATAGATCAGTGTGTACATTTTGTGTAACAGAAATGAAACAA CATCAACGTATTTTAAATAAAGAAACAATTTTATTATCGAATGGCCAATAAAATGATGTCCAGTTTATTTTAATGGTGGGGGTTATTGTTGTTGTTGCTGTGGTGGTGTTGTTGTTGTTATGGTGGTGGTGTTGTTGCTATAGTGGTGTTGTTGTTGTTTTTTTGTTTTTCTTTTCTTTCTTTTTTTCCTTCAAAATTTGAATCCATATATACACATATATATATATATTGTAATGTTTAAATGAACAAATAAATAAACATTGAAGATA]


>consensus_5758#0 TATGGAAATGTCTATTAATTCTTATGGTAAACGTAATTGGACTGATCAAGATTATTTATT ATCTAATTATACTCAACATTATAATGATAAACAAAATCATTTATCCTATTGTATAACAGA TACATTTAATCAATGTTCAACATTACATGATAGTAACAGTACTAATAATATGGATCATGT ACCGACAACGACAACATCCTCATCGTCGTCATCGTCAATGTCGTCATCGTTGTCATGTCA ATATCAACCACCAATCAAACGTGTAGCTAATGAACGTGAACGTACACGTACAGCTAGTGT TAATGATGCATTTCTTATGTTACGTAATTTAATACCAACTCAACCAATTAATCGTAAATT ATCCAAAATTGAAACATTACGCTTAGCATCATCCTATATATCCCATTTACATGCTATATT AGTAACTGGTTCAGGCCCCGCAGATCAACCATGTTTAAAACATCAACAAATTTATCATTT AAATGCTACTACTAATACTACTAATAATGATCATAATAGTAGTAGTAATGATAATCTTGA TAAGAATCAACTCATTTTTAATTATAATAAACCATATAGATCAGTGTGTACATTNTGTGT AACAGAAATGAAACAANCATCACCGTATTTTAAATAAAGAAACAATTTTATTATCGAATG GCCAATAAAATGATGTCCAGTTTATTTTAATGGTGGGGGTTATTGTTGTTGTTGCTGTGG TGGTGTTGTTGTTGTTATGGTGGTGGTGTTGTTGCTATAGTGGTGTTGTTGTTGTTTTTT TGTTTTTCTTTTCTTTCTTTTTTTCCTTCAAAATTTGAATCCATATATACACATATATAT ATATATTGTAATGTTTAAATGAACAAATAAATAAACATTGAAGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)