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Schistosoma mansoni
cluster # 587 cluster # 587       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_587#0 length = 666 sequences # 2  

consensusID : consensus_587#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 666
fasta sequence
                              [TTAGGCGTAATGAAATAGTTTTGTTGACGCTATTTTCTTTTTTAAATCTCACTTCACCTGTTCACGAATGTAACATTGTTATAATAGACATTTCAGTAGCACTCACTTTTTTTTAAAAACAACACTTTTTTTCAGAATCCAGCTCATTCAAGATCTATTATTTTAAATCGTAGTTAAAGTAAACTTCAGATTAATTTCACTCAGTTAACATTTTGTTCCACTATTATATCCTTTTTTTCACTCTAACATCCAGCTATCTTTTTTTCCTCTGTTTGTTTTTTCTGTTTCCCTGATCAGTTTAACTTTGATTTTCTAATAAAGTAAAACCTGAACAGATTACTTATTCATTCATGATAAATTGTAGTCATTCCTTTTTATTGGTATAAAATGATCAGAATTTGTATTACCATTTACTGCTGTATTATTCACTATGCTCTGTTTGTATTGTATTGTATTCGATTTTACTTTTTTTTTCATTTTTGTCAAATATAATGTATAACTATGTCATCAATTAATAGGTTTTTTTGCTCCATTCACTTGTAATCTGGGACTTGTGTATAATTTTACTGTAAATTAATGAAATCTAATTATCATAAGTCTACAAGTAAGGCAATTTTTTTTGTTGACAGTTCTTTAATCGTTACACGCTTTTCTGTTAGTATGTGC]

[+] EMBL CD201861             [TTAGGCGTAATGAAATAGTTTTGTTGACGCTATTTTCTTTTTTAAATCTCACTTCACCTGTTCACGAATGTAACATTGTTATAATAGACATTTCAGTAGCACTCACTTTTTTTTAAAAACAACACTTTTTTTCAGAATCCAGCTCATTCAAGATCTATTATTTTAAATCGTAGTTAAAGTAAACTTCAGATTAATTTCACTCAGTTAACATTTTGTTCCACTATTATATCCTTTTTTTCACTCTAACATCCAGCTATCTTTTTTTCCTCTGTTTGTTTTTTCTGTTTCCCTGATCAGTTTAACTTTGATTTTCTAATAAAGTAAAACCTGAACAGATTACTTATTCATTCATGATAAATTGTAGTCATTCCTTTTTATTGGTATAAAATGATCAGAATTTGTATTACCATTTACTGCTGTATT                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD117815             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTCATGATAAATTGTAGTCATTCCTTTTTATTGGTATAAAATGATCAGAATTTGTATCACCATTTACTGCTGTATTATTCACTATGCTCTGTTTGTATTGTATTGTATTCGATTTTACTTTTTTTTTCATTTTTGTCAAATATAATGTATAACTATGTCATCAATTAATAGGTTTTTTTGCTCCATTCACTTGTAATCTGGGACTTGTGTATAATTTTACTGTAAATTAATGAAATCTAATTATCATAAGTCTACAAGTAAGGCAATTTTTTTTGTTGACAGTTCTTTAATCGTTACACGCTTTTCTGTTAGTATGTGC]


>consensus_587#0 TTAGGCGTAATGAAATAGTTTTGTTGACGCTATTTTCTTTTTTAAATCTCACTTCACCTG TTCACGAATGTAACATTGTTATAATAGACATTTCAGTAGCACTCACTTTTTTTTAAAAAC AACACTTTTTTTCAGAATCCAGCTCATTCAAGATCTATTATTTTAAATCGTAGTTAAAGT AAACTTCAGATTAATTTCACTCAGTTAACATTTTGTTCCACTATTATATCCTTTTTTTCA CTCTAACATCCAGCTATCTTTTTTTCCTCTGTTTGTTTTTTCTGTTTCCCTGATCAGTTT AACTTTGATTTTCTAATAAAGTAAAACCTGAACAGATTACTTATTCATTCATGATAAATT GTAGTCATTCCTTTTTATTGGTATAAAATGATCAGAATTTGTATTACCATTTACTGCTGT ATTATTCACTATGCTCTGTTTGTATTGTATTGTATTCGATTTTACTTTTTTTTTCATTTT TGTCAAATATAATGTATAACTATGTCATCAATTAATAGGTTTTTTTGCTCCATTCACTTG TAATCTGGGACTTGTGTATAATTTTACTGTAAATTAATGAAATCTAATTATCATAAGTCT ACAAGTAAGGCAATTTTTTTTGTTGACAGTTCTTTAATCGTTACACGCTTTTCTGTTAGT ATGTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)