These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_5912#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 798 fasta sequence [CTCGCAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAGTTTCTTCCCTCATGTTGAAATTTTACTTATTAGATGGCCACTGTGATTAACATCACAGATAAAAACCATCTTGAACAAATTATACAACAAGCAAATAATGTAACAAATGGTCCAAGCATTGTAGTTATGGATTTTTATGCTTCATGGTGTCGTCCTTGTTCAGATATAGCTCCTGTCTTTCAAGAATTAAGCATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAAACATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC-TACG-TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAGAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAGATTGGTGAAGCTATACAAACATTAGAATTAACAGAAGATGATATCAAAGATGGCGGGATAACTCAGT] [+] EMBL CD080112 [CTCGCAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAGTTTCTTCCCTCATGTTGAAATTTTACTTATTAGATGGCCACTGTGATTAACATCACAGATAAAAACCATCTTGAACAAATTATACAACAAGCAAATAATGTAACAAATGGTCCAAGCATTGTAGTTATGGATTTTTATGCTTCATGGTGTCGTCCTTGTTCAGATATAGCTCCTGTCTTTCAAGAATTAAGCATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAAACATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC TACG TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAGAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAGATTGGTGAAGC ] [+] EMBL CD065051 [ ATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAACCATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC TACG TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGGCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACCGATGAACATCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGc ] [+] EMBL CD128193 [ TTA CTACG TTATAGTTCGTACGTTGGAGCTGAAC AAGTGATCGGATCACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAAAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAAATTGGTGAAGCTATACAAACATTAGAATTAACAGAAGATGATATCAAAGATGGCGGGATAACTCAGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||