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Schistosoma mansoni
cluster # 5912 cluster # 5912       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5912#0 length = 798 sequences # 3  

consensusID : consensus_5912#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 798
fasta sequence
                              [CTCGCAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAGTTTCTTCCCTCATGTTGAAATTTTACTTATTAGATGGCCACTGTGATTAACATCACAGATAAAAACCATCTTGAACAAATTATACAACAAGCAAATAATGTAACAAATGGTCCAAGCATTGTAGTTATGGATTTTTATGCTTCATGGTGTCGTCCTTGTTCAGATATAGCTCCTGTCTTTCAAGAATTAAGCATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAAACATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC-TACG-TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAGAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAGATTGGTGAAGCTATACAAACATTAGAATTAACAGAAGATGATATCAAAGATGGCGGGATAACTCAGT]

[+] EMBL CD080112             [CTCGCAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAGTTTCTTCCCTCATGTTGAAATTTTACTTATTAGATGGCCACTGTGATTAACATCACAGATAAAAACCATCTTGAACAAATTATACAACAAGCAAATAATGTAACAAATGGTCCAAGCATTGTAGTTATGGATTTTTATGCTTCATGGTGTCGTCCTTGTTCAGATATAGCTCCTGTCTTTCAAGAATTAAGCATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAAACATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC TACG TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAGAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAGATTGGTGAAGC                                                        ]
[+] EMBL CD065051             [                                                                                                                                                                                                                             ATCAAGTATACAAATATGAAATTTGTTAAAATTGATGTTGATAACCATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGATCATTACCTACGTTTATATTTC TACG TGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGGCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACCGATGAACATCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGc                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD128193             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTA CTACG TTATAGTTCGTACGTTGGAGCTGAAC AAGTGATCGGATCACTGGTGGAGTTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATGAAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGTCAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTACATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTATTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTAAAGAGAATGCACCAAAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTGATAGTTGTGAAATTGGTGAAGCTATACAAACATTAGAATTAACAGAAGATGATATCAAAGATGGCGGGATAACTCAGT]


>consensus_5912#0 CTCGCAGCCAANAATTCGGCACGAGGGAGTTTCTTCCCTCATGTTGAAATTTTACTTATT AGATGGCCACTGTGATTAACATCACAGATAAAAACCATCTTGAACAAATTATACAACAAG CAAATAATGTAACAAATGGTCCAAGCATTGTAGTTATGGATTTTTATGCTTCATGGTGTC GTCCTTGTTCAGATATAGCTCCTGTCTTTCAAGAATTAAGCATCAAGTATACAAATATGA AATTTGTTAAAATTGATGTTGATAAACATGAGGACGTTGCACAACGTTACAATGTCAGAT CATTACCTACGTTTATATTTCTACGTGGAGCTGAACAAATTGATCGGATTACTGGTGGAG TTCCACAAAAGTTAAGAGATAAAGTACAGGAACTTGCTCTCTCTGGATCAGACTCTCATG AAAGTGGTTCACATAAAAGCCCGCAGTCTTCTAAACAATATGATATGGATGTATTATTGT CAAAAAATCAATGTGAATGTTTAAATGAAGATGATACTCATTCACTTGCTCAATTATTAC ATTCCTCTGAAAATAATAATTCCAAGGTATATTTATTATCAGATACAGATGAACAGCTTA TTATATACATTACCTTTTCACAATTTGTTCGTATTCAATCTGTACAGATTAATGGACCTA AAGAGAATGCACCAGAAACGGTTAAACTATTTATAAATCAAACATCAACACCTGATTTTG ATAGTTGTGAGATTGGTGAAGCTATACAAACATTAGAATTAACAGAAGATGATATCAAAG ATGGCGGGATAACTCAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)