Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5942 cluster # 5942       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5942#0 length = 949 sequences # 3  
consensusID : consensus_5942#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 949
fasta sequence 
                              [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGATCGNTATGGATTACGATAAACTCTCTATTCAAACAAAATGTCTTCTTCATACAGTCTCAGAAAGTATTGGTCAATTAGAAAGTATGATACATAGTTTAAAGTCAAGTTTGGAACTGGATGAAATAAATAAATTGTATCATAGATTAAATCAAGATAYMCAAATATTAATTCGAATTGTGATCGTCTATCAACTTTACTTTCAACTGTTGAACCATATTCGCGTCGTTCTCAATTACGTTTAAGTTTGGATCMAACACGTTTTGAATGTAAACAGTATGAAACTAATTTAAAAGTTATCGATCGAAAAAAAAATGAAAAATGGCGGCACATAATAGAACGTGAAGAGTTATTATCTCATGATTTTTCTACTAATGCATCTGTACGTAATAATAATTGTTTGTCTGGCTCAACTATCATCAAATTGGACCCTGATTTAGAACATTATTCAAGATTATCTAATGTTGGAAAGCAAATTGATGATATGTTGTTATCAGGATCATTTAGTTTAAGTGCTTTACAAGAACAAGGAATGACTTTAAAGAAGGCGCAACGTCGTATCATGGATATTCTGAATACTCTTGGATTATCAAATACTGTTATGCGTCTTATTGAACGGCGAAGTCATCAGGATAAAATATTATTCTGGGTTTTAGTGGCTGTTACACTGATCTTATTTTGGGGTATTTGGAGGCTNTTCCATTAGTCATCCATGTAAACTTTTCTCTCCATCTATTTTTTCTAAGTGTTTATTCGTGTACGTTTGTATTTTGAGTTCTCTACGTCTTTCAGTTAATTTGTTAATTCAATGATTATATTTGTACAACTTTATCTCCCATTACTTTTGGATGTCTTGAGATGTCTATTGGCTTGTAAATAGCGGCTGTTGTACTTTTTCTATGTATTCAAACATGAGATAAAAT]

[+] EMBL SM30258              [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGATCGNTATGGATTACGATAAACTCTCTATTCAAACAAAATGTCTTCTTCATACAGTCTCAGAAAGTATTGGTCAATTAGAAAGTATGATACATAGTTTAAAGTCAAGTTTGGAACTGGATGAAATAAATAAATTGTATCATAGATTAAATCAAGATAYMCAAATATTAATTCGAATTGTGATCGTCTATCAACTTTACTTTCAACTGTTGAACCATATTCGCGTCGTTCTCAATTACGTTTAAGTTTGGATCMAACACGTTTTGAATGTAAACAGTATGAAACTAATTTAAAAGTTATCGATCGAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD083044             [                                                                                                                                                                                                        GAATTGTGATCGTCTATCAACTTTACTTTCAACTGTTGAACCATATTCGCGTCGTTCTCAATTACGTTTAAGTTTGGATCAAACACGTTTTGAATGTAAACAGTATGAAACTAATTTAAAAGTTATCGATCGAAAAAAAAATGAAAAATGGCGGCACATAATAGAACGTGAAGAGTTATTATCTCATGATTTTTCTACTAATGCATCTGTACGTAATAATAATTGTTTGTCTGGCTCAACTATCATCAAATTGGACCCTGATTTAGAACATTATTCAAGATTATCTAATGTTGGAAAGCAAATTGATGATATGTTGTTATCAGGATCATTTAGTTTAAGTGCTTTACAAGAACAAGGAATGACTTTAAAGAAGGCGCAACGTCGTATCATGGATATTCTGAATACTCTTGGATTATCAAATACTGTTATGCGTCTTATTGAACGGCGAAGTCATCAGGATAAAATATTATTCTGGGTTTTAGTGGCTGTTACACTGATCTTATTTTGGGGTATTTGGAGGCTNTTCCATTAGTCATCCATGTAAACTTTTCTCTCCATCTATTTTTT                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD076620             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTCATGATTTTTCTACTAATGCATCTGTACGTAATAATAATTGTTTGTCTGGCTCAACTATCATCAAATTGGACCCTGATTTAGAACATTATTCAAGATTATCTAATGTTGGAAAGCAAATTGATGATATGTTGTTATCAGGATCATTTAGTTTAAGTGCTTTACAAGAACAAGGAATGACTTTAAAGAAGGCGCAACGTCGTATCATGGATATTCTGAATACTCTTGGATTATCAAATACTGTTATGCGTCTTATTGAACGGCGAAGTCATCAGGATAAAATATTATTCTGGGTTTTAGTGGCTGTTACACTGATCTTATTTTGGGGTATTTGGAGGCTTTTCCATTAGTCATCCATGTAAACTTTTCTCTCCATCTATTTTTTCTAAGTGTTTATTCGTGTACGTTTGTATTTTGAGTTCTCTACGTCTTTCAGTTAATTTGTTAATTCAATGATTATATTTGTACAACTTTATCTCCCATTACTTTTGGATGTCTTGAGATGTCTATTGGCTTGTAAATAGCGGCTGTTGTACTTTTTCTATGTATTCAAACATGAGATAAAAT]




>consensus_5942#0
GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGGATCGNTATGGATTACGATAAACTCTCTATTCA
AACAAAATGTCTTCTTCATACAGTCTCAGAAAGTATTGGTCAATTAGAAAGTATGATACA
TAGTTTAAAGTCAAGTTTGGAACTGGATGAAATAAATAAATTGTATCATAGATTAAATCA
AGATAYMCAAATATTAATTCGAATTGTGATCGTCTATCAACTTTACTTTCAACTGTTGAA
CCATATTCGCGTCGTTCTCAATTACGTTTAAGTTTGGATCMAACACGTTTTGAATGTAAA
CAGTATGAAACTAATTTAAAAGTTATCGATCGAAAAAAAAATGAAAAATGGCGGCACATA
ATAGAACGTGAAGAGTTATTATCTCATGATTTTTCTACTAATGCATCTGTACGTAATAAT
AATTGTTTGTCTGGCTCAACTATCATCAAATTGGACCCTGATTTAGAACATTATTCAAGA
TTATCTAATGTTGGAAAGCAAATTGATGATATGTTGTTATCAGGATCATTTAGTTTAAGT
GCTTTACAAGAACAAGGAATGACTTTAAAGAAGGCGCAACGTCGTATCATGGATATTCTG
AATACTCTTGGATTATCAAATACTGTTATGCGTCTTATTGAACGGCGAAGTCATCAGGAT
AAAATATTATTCTGGGTTTTAGTGGCTGTTACACTGATCTTATTTTGGGGTATTTGGAGG
CTNTTCCATTAGTCATCCATGTAAACTTTTCTCTCCATCTATTTTTTCTAAGTGTTTATT
CGTGTACGTTTGTATTTTGAGTTCTCTACGTCTTTCAGTTAATTTGTTAATTCAATGATT
ATATTTGTACAACTTTATCTCCCATTACTTTTGGATGTCTTGAGATGTCTATTGGCTTGT
AAATAGCGGCTGTTGTACTTTTTCTATGTATTCAAACATGAGATAAAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)