Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 5969 cluster # 5969       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5969#0 length = 598 sequences # 3  

consensusID : consensus_5969#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 598
fasta sequence
                              [AGACGTTATATGCTATCAGAACAATTGAAAGTAATTAAAAAAAGAATTAGGTTTAGAGAAAGATGATAAAGATACAATTGTGGAAAAGTTTCGTATGCGTTTAAAGGATTTAACAGTTCCATCTAGTGTTATGGAAGTGATCGATGAAGAATTGAATAAATTAAGCGTTTTAGATAATCACTCTTCAGAATTCAATGTAACACGTAATTATTTGGATTGGTTAACTGCACTACCCTGGGGTGTAACAAGTGAAGAACATTTAGATATTGGACAAGCAAAGAAAATTTTAGATGAAGATCATTATGGAATGGATGATGTG-AAAAAACGTATTCTGGAATTTATTGCAGTTAGTCAATTGAAAGGTTCAACACAAGGCAAAATTTTATGTTTTTGTGGTCCACCTGGAGTTGGTAAAACCAGTATAGCTAATTCAATAGCTCGTGCATTAAATAGAAAATATTTTCGTTTTTCTGTCGGTGGAATGTCTGATGTATCTGANATTAAAGGTCATCGACGTACTTATGTTGGTGCTATGCCTGNGAAAATTATTCAATGTCTTAAAAAAACTAAAACTGAAAATCCACTTATTCTAATTGAT]

[+] EMBL CD150745             [AGACGTTATATGCTATCAGAACAATTGAAAGTAATTAAAAAAAGAATTAGGTTTAGAGAAAGATGATAAAGATACAATTGTGGAAAAGTTTCGTATGCGTTTAAAGGATTTAACAGTTCCATCTAGTGTTATGGAAGTGATCGATGAAGAATTGAATAAATTAAGCGTTTTAGATAATCACTCTTCAGAATTCAATGTAACACGTAATTATTTGGATTGGTTAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD153783             [                                                               TGATAAAGATACAATTGTGGAAAAGTTTCGTATGCGTTTAAAGGATTTAACAGTTCCATCTAGTGTTATGGAAGTGATCGATGAAGAATTGAATAAATTAAGCGTTTTAGATAATCACTCTTCAGAATTCAATGTAACACGTAATTATTTGGATTGGTTAACTGCACTACCCTGGGGTGTAACAAGTGAAGAACATTTAGATATTGGACAAGCAAAGAAAATTTTAGATGAAGATCATTATGGAATGGATGATGTG AAAAAACGTATTCTGGAATTTATTGCAGTTAGTCAATTGAAAGGTTCAACACAAGGCAAAATTTTATGTTTTTGTGGTCCACCTGGAGTTGGTAAAACCAGTATAGCTAATTCAATAGCTCGTGCATTAAATAGAAAATATTTTCGTTTTTCTGTCGGTGGAATGTCTGATGTATCTGANATTAAAGGTCATCGACGTACTTATGTTGGTGCTATGCCTGNGAAAATTATTCAATGTCTTAAAAAAACTAAAACTGAAAATCCACTTATTCTAATTGAT]
[+] EMBL CD171405             [                                                                                                                                      AAGTGATCGATGAAGAATTGAATAAATTAAGCGTTTTAGATAATCACTCTTCAGAATTCAATGTAACACGTAATTATTTGGATTGGTTAACTGCACTACCCTGGGGTGTAACAAGTGAAGAACATTTAGATATTGGACAAGCAAAGAAAATTTTAGATGAAGATCATTATGGAATGGATGATGTGAAAAAAACGTATTCTGGAATTTATTGCAGTTAGTCAATTGAAAGGTTCAACACAAGGCAAAATTTTATGTTTTTGTGGTCCACCTGGAGTTGGTAAAACCAGTATAGCTAATTCAATAGCTCGTGCATTAAATAGAAAATATTTTCGTTTTTCTGTCGGTGGAATGTCTGATGTATCTGAAATT AAGGTCATCGACGTA                                                                                ]


>consensus_5969#0 AGACGTTATATGCTATCAGAACAATTGAAAGTAATTAAAAAAAGAATTAGGTTTAGAGAA AGATGATAAAGATACAATTGTGGAAAAGTTTCGTATGCGTTTAAAGGATTTAACAGTTCC ATCTAGTGTTATGGAAGTGATCGATGAAGAATTGAATAAATTAAGCGTTTTAGATAATCA CTCTTCAGAATTCAATGTAACACGTAATTATTTGGATTGGTTAACTGCACTACCCTGGGG TGTAACAAGTGAAGAACATTTAGATATTGGACAAGCAAAGAAAATTTTAGATGAAGATCA TTATGGAATGGATGATGTGAAAAAACGTATTCTGGAATTTATTGCAGTTAGTCAATTGAA AGGTTCAACACAAGGCAAAATTTTATGTTTTTGTGGTCCACCTGGAGTTGGTAAAACCAG TATAGCTAATTCAATAGCTCGTGCATTAAATAGAAAATATTTTCGTTTTTCTGTCGGTGG AATGTCTGATGTATCTGANATTAAAGGTCATCGACGTACTTATGTTGGTGCTATGCCTGN GAAAATTATTCAATGTCTTAAAAAAACTAAAACTGAAAATCCACTTATTCTAATTGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)