These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6008#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 954 fasta sequence [TCGTCACGAGACCTTACTGTCACCCGCAAGTCTAGGTTTTGTTCTCAAGATAGACCCAAATTACTTAGCCTGTGAAACTGATCGAGCTGAAATGAGAGCGGCCATTCGTTTGTCACGCGAAATATTTGCTCAGCCTGCATTAGCGAAAGAATTTGCAGGCAAAGAACTAGCTCCAGGTGAGGATAAAATATCAGACTCGCAACTGGATGAATTTGTACGTTCTTTTGGTGATAGCGCATACCATCCTTCTTGCACTTGCCGTATGGGTAAAAATCCTGATGGTCGTAAAGCCGGAAGTGATGATGAGATACATAGTGGTTATTTGGGTAATGGAAGAATAGGAGCAGCAGTTACGCAGTCAGACTGTAAAGTATGGGGTATCGACAATCTTCGTATTGTTGATGCAAGTATAATGCCATCAATTGTTTCAGGTAATTTAAATGCACCTGTCATTATGATGGCTGAAAAAGCTGCAGACATTATTGTCAGTTCTCGAGATGGAGTGTCAGTTGTTTTGCCAGCCGATTTAAATCTCTCTTACTGGAAACCACAACATCCTGATAAACAACGTGATGGTATT-CCACTTGTATCTCATC-ATTTGATTTAACTAAGGTGAAGACAAAAAAAATT-GAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCTAGTTTTGGGCATACTTTATCACACTCCCAAAATAGTTTCTTTCAAATAAATGCCTTACTTGTATTTCTTTCTTTCTATTTTGTCAAAGACTTCTAAAACTCTTGATATCAGTACTTTNTAAAATTACATTGGCATATTGAAAGTGCTTNATTAT-AAATTACAAGAAATTCTATTGAATTAGATTTTTCCAAATCTCCGTGCTTTTTTTAATACTTTTCTTGTCTTGTTTGCTTAAATTAATAACAGTTTTTATGATTATTTCAATTTCATACAGTAAAATGGTAATAAATAAAG] [+] EMBL CD082323 [TCGTCACGAGACCTTACTGTCACCCGCAAGTCTAGGTTTTGTTCTCAAGATAGACCCAAATTACTTAGCCTGTGAAACTGATCGAGCTGAAATGAGAGCGGCCATTCGTTTGTCACGCGAAATATTTGCTCAGCCTGCATTAGCGAAAGAATTTGCAGGCAAAGAACTAGCTCCAGGTGAGGATAAAATATCAGACTCGCAACTGGATGAATTTGTACGTTCTTTTGGTGATAGCGCATACCATCCTTCTTGCACTTGCCGTATGGGTAAAAATCCTGATGGTCGTAAAGCCGGAAGTGATGATGAGATACATAGTGGTTATTTGGGTAATGGAAGAATAGGAGCAGCAGTTACGCAGTCAGACTGTAAAGTATGGGGTATCGACAATCTTCGTATTGTTGATGCAAGTATAATGCCATCAATTGTTTCAGGTAATTTAAATGCACCTGTCATTATGATGGCTGAAAAAGCTGCAGACATTATTGTCAGTTCTCGAGATGGAGTGTCAGTTGTTTTGCCAGCCGATTTAAATCTCTCTTACTGGAAACCACAACATCCTGATAAACAACGTGATGGTATT CCACTTGTATCTCATC ATTTGATTTAACTAAGGTGAAGAC AAAAAAATT GAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCTAGTTNTGGGCATACTTTA ] [+] EMBL AI976140 [ TTCTTGCACTTGCCGTATGGGTAAAAATCCTGATGGTCGTAAAGCCGGAAGTGATGATGAGATACATAGTGGTTATTTGGGTAATGGAAAAATAGGAGCAGCAGTTACGCAGTCAGACTGTAAAGTATGGGGTATCGACAATCTTCGTATTGTTGATGCAAGTATAATGCCATCAATTGTTTCAGGTAATTTAAATGCACCTGTCATTATGATGGCTGAAAAAGCTGCAGACATTATTGTCAGTTCTCGAGATGGAGTGTCAGTTGTTTTGCCAGCCGATTTAAATCTCTCTTACTGGAAACCACAACATCCTGATAAACAACGTGATGGTATT CCACTTGTATCTCATC ATTTGATTTAACTAAGGTGAAGACAAAAAAAATT GAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCTAGTTTTGGGCATACTTTATCACACTCCCAAAATAGTTTCTTTCAAATAAATGCCTTACTTGTATTTCTTTCTTTCTATTTTGTCAAAGACTTCTAAAACTCTTGATATCAGTACTTTNTAAAATTACATTGGCATATTGAAAGTGCTTNATTAT AAATTACAAGAAATTCTA ] [-] EMBL AA999375 [ aacCGTGATGGTATTCCCACTTGTATCTCATCAATTTGATTTAACTAAGGTGAGGACAAAAAAAATTGGAGTAAATCTATTCAGTATATTAACTCCCTAGTTTTGGGCATACTTTATCACACTCCCAAAATAGTTTCTTTCAAATAAATGCCTTACTTGTATTTCTTTCTTTCTATTTTGTCAAAGACTTCTAAAAAACTTGATATCAGTACTTTTTAAAATTACATTGGCATATTGAAAGTGCTT ATTATAAAATTACAAGAAATTCTATTGAATTAGATTTTTCCAAATCTCCGTGCTTTTTTTAATACTTTTCTTGTCTTGTTTGCTTAAATTAATAACAGTTTTTATGATTATTTCAATTTCATACAGTAAAATGGTAATAAATAAAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||