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Schistosoma mansoni
cluster # 6033 cluster # 6033       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6033#0 length = 726 sequences # 4  

consensusID : consensus_6033#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 726
fasta sequence
                              [CAATTCACATGATGTTGCTGATGTTGGTATGATAGATATAAGTATTGATCAAGATGGATTGTATGAAAATAACCAAAAGTTAGAGTTATGTGCTGCTATGGTTCGTTTAGGCGATTGGACAAATGCTCAACGTCTGTTAGAACGCCTACCTGGTTATTGGGCGACTACATATGAACCTTTAACACGAGACATATGCAATTTGTTGCATTGCTTAATTGAACCTTTGTACAATAAAGCTTGCCCTTTACCTGCCTGTTTACAACGTAACCGTTCTCGGCCGAGAATCGAGTCATTCAAAGCACTAAATACATATATTATTCTAGA-TGGTATTGATGAGAAATCGTCTGTTGATTGTGAAATAAATGAAGTCAATCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATTCTCTTATCACCTGTTCATGATTTTGTTGACCTTGCCAAGTATGTAATACCGATAGCAATTTATTTGGGCCCACATATGTCGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGATTGGAATTGTTTATCAAGGATTTTTTAATTTACTAGATGAAGTACTACTTCCGTCGTTGAGTTTGGTTGATGCTAATTGTTGTTTAGCTGAAGAAATTTGGCAAATGTTACGATTTATGCCTTATGAACATCGATATCGGTTCAT]

[+] EMBL CD161376             [CAATTCACATGATGTTGCTGATGTTGGTATGATAGATATAAGTATTGATCAAGATGGATTGTATGAAAATAACCAAAAGTTAGAGTTATGTGCTGCTATGGTTCGTTTAGGCGATTGGACAAATGCTCAACGTCTGTTAGAACGCCTACCTGGTTATTGGGCGACTACATATGAACCTTTAACACGAGACATATGCAATTTGTTGCATTGCTTAATTGAACCTTTGTACAATAAAGCTTGCCCTTTACCTGCCTGTTTACAACGTAACCGTTCTCGGCCGAGAATCGAGTCATTCAAAGCACTAAATACATATATTATTCTAGA TGGTATTGATGAGAAATCGTCTGTTGATTGTGAAATAAATGAAGTCAATCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATTCTCTTATCACCTGTTCATGATTNTGTTGACCTTGCCAAGTATGTAATACCGATAGCAATTTATTTGGGCCCACATATGTCGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCT                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD113834             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTATTCTAGAGTGGAATTGATGAGAAATCGTCTGTTGATTGTGAAATAAATGAAGTCAATCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATTCTCTTATCACCTGTTCATGATTTTGTTGACCTTGCCAAGTATGTAATACCGATAGCAATTTATTTGGGCCCACATATGACGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGATCGGAATTGTTTATCAAGGATTTTTTAATTTACTAGATGAAGTACTACTTCCGTCGTTGAGTTTGGTTGATGCTAATTGTTGTTTAGCTGAAGAAATTTGGCAAATGTTACGATTTATGCCTTATGAACATCGATATCGGTTCAT]
[+] EMBL CD113739             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGATGAGAAACCGTCTGTTGATTGTGAAATAAATGAAGTCACTCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATACTCTTATCACCTGTTCATGATTTTGTTGACCTTGCCAAGTAAGTAATACCGATAGCAATTTATTTGGGCCCACATATGTCGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGATTGGAATTGTT                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD171447             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAATATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGACTGGAATTGT                                                                                                                                       ]


>consensus_6033#0 CAATTCACATGATGTTGCTGATGTTGGTATGATAGATATAAGTATTGATCAAGATGGATT GTATGAAAATAACCAAAAGTTAGAGTTATGTGCTGCTATGGTTCGTTTAGGCGATTGGAC AAATGCTCAACGTCTGTTAGAACGCCTACCTGGTTATTGGGCGACTACATATGAACCTTT AACACGAGACATATGCAATTTGTTGCATTGCTTAATTGAACCTTTGTACAATAAAGCTTG CCCTTTACCTGCCTGTTTACAACGTAACCGTTCTCGGCCGAGAATCGAGTCATTCAAAGC ACTAAATACATATATTATTCTAGATGGTATTGATGAGAAATCGTCTGTTGATTGTGAAAT AAATGAAGTCAATCGGACCATTACAAATAATAATAACAATAATAATAATTGTATTCTCTT ATCACCTGTTCATGATTTTGTTGACCTTGCCAAGTATGTAATACCGATAGCAATTTATTT GGGCCCACATATGTCGTATGACTTAATATTAATAGTGAAGTTTTGTCGTCTTGGTCAAAT ATATCTCTCTGAACAACAACAAAACCTTCGGTCTGACAAGATTGGAATTGTTTATCAAGG ATTTTTTAATTTACTAGATGAAGTACTACTTCCGTCGTTGAGTTTGGTTGATGCTAATTG TTGTTTAGCTGAAGAAATTTGGCAAATGTTACGATTTATGCCTTATGAACATCGATATCG GTTCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)