These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6037#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 786 fasta sequence [TTAAATAAAGATGATCGTCCAATGCTACTACTTGATCAGTTACGTGAAGAATCAGCTAGAATATCACAATTTACTCGATTCGAATTACGTTTTGTTGAAGATCCCCCTATCAGTCCTAGTGTCTCCTTGTTTGTAGGTAATCTTAAAGAAAATCTATCACAACGATTATATGAACGTGTATTATTAGACAAATTAGGTGAGAAATGTCGTTGGGATTCAATTGAAGTAATATATTATGAAAGTGGTTGTCTCGTTTTAAATTATCACTCAAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGANCTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTAAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGNCGATTTAATTGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA-TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTANTAATGATCTATCTCGTG-TCTTCGATGGGGTTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTCTAACTATTTTAAAGGGATGTATTGCCGCTGAAAAATTGAAGTTANNACGGATGACGTTGATTGTT] [+] EMBL CD130691 [TTAAATAAAGATGATCGTCCAATGCTACTACTTGATCAGTTACGTGAAGAATCAGCTAGAATATCACAATTTACTCGATTCGAATTACGTTTTGTTGAAGATCCCCCTATCAGTCCTAGTGTCTCCTTGTTTGTAGGTAATCTTAAAGAAAATCTATCACAACGATTATATGAACGTGTATTATTAGACAAATTAGGTGAGAAATGTCGTTGGGATTCAATTGAAGTAATATATTATGAAAGTGGTTGTCTCGTTTTAAATTATCACTCAAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGANCTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTAAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGTCGATTTAATTGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGATTTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGGTGGTACTGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGGTGGACAGGATGCANCATGTAACGCTCCTNCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTANTAATGATCTATCTCGTG TCTTCGATGGGGTTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTCTAACTATTTTAAAGGGATGTATTGCCGCTGAAAAATTGAAGTTANNACGGATGACGTTGATTGTT] [+] EMBL CD195902 [ ATATATTATGAAAGTGGTTGTCTTGTTTTAAATTATCACTCGAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGA CTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTANAATCTGGCGGNTGTCAAGGTGNCGA ] [-] EMBL CD114002 [ AAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGCCGATTTAATTGTTGCTATTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCGATATAGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTCGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTGGTAATGATCTATCTCGTGTTCTTCGATGGGGCTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTATAACTATTTTAAA GGATGTAgt ] [-] EMBL CD195714 [ TGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||