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Schistosoma mansoni
cluster # 6037 cluster # 6037       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6037#0 length = 786 sequences # 4  

consensusID : consensus_6037#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 786
fasta sequence
                              [TTAAATAAAGATGATCGTCCAATGCTACTACTTGATCAGTTACGTGAAGAATCAGCTAGAATATCACAATTTACTCGATTCGAATTACGTTTTGTTGAAGATCCCCCTATCAGTCCTAGTGTCTCCTTGTTTGTAGGTAATCTTAAAGAAAATCTATCACAACGATTATATGAACGTGTATTATTAGACAAATTAGGTGAGAAATGTCGTTGGGATTCAATTGAAGTAATATATTATGAAAGTGGTTGTCTCGTTTTAAATTATCACTCAAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGANCTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTAAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGNCGATTTAATTGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA-TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTANTAATGATCTATCTCGTG-TCTTCGATGGGGTTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTCTAACTATTTTAAAGGGATGTATTGCCGCTGAAAAATTGAAGTTANNACGGATGACGTTGATTGTT]

[+] EMBL CD130691             [TTAAATAAAGATGATCGTCCAATGCTACTACTTGATCAGTTACGTGAAGAATCAGCTAGAATATCACAATTTACTCGATTCGAATTACGTTTTGTTGAAGATCCCCCTATCAGTCCTAGTGTCTCCTTGTTTGTAGGTAATCTTAAAGAAAATCTATCACAACGATTATATGAACGTGTATTATTAGACAAATTAGGTGAGAAATGTCGTTGGGATTCAATTGAAGTAATATATTATGAAAGTGGTTGTCTCGTTTTAAATTATCACTCAAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGANCTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTAAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGTCGATTTAATTGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGATTTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGGTGGTACTGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGGTGGACAGGATGCANCATGTAACGCTCCTNCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTANTAATGATCTATCTCGTG TCTTCGATGGGGTTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTCTAACTATTTTAAAGGGATGTATTGCCGCTGAAAAATTGAAGTTANNACGGATGACGTTGATTGTT]
[+] EMBL CD195902             [                                                                                                                                                                                                                                    ATATATTATGAAAGTGGTTGTCTTGTTTTAAATTATCACTCGAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTACTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGA CTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCGTCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTANAATCTGGCGGNTGTCAAGGTGNCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD114002             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAAATCTGGCGGTTGTCAAGGTGCCGATTTAATTGTTGCTATTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCGATATAGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTCGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAACTGGTAATGATCTATCTCGTGTTCTTCGATGGGGCTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCTATAACTATTTTAAA GGATGTAgt                                          ]
[-] EMBL CD195714             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGTATTTAACCTTGA TTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTCATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGATATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTC                                                                                                                                               ]


>consensus_6037#0 TTAAATAAAGATGATCGTCCAATGCTACTACTTGATCAGTTACGTGAAGAATCAGCTAGA ATATCACAATTTACTCGATTCGAATTACGTTTTGTTGAAGATCCCCCTATCAGTCCTAGT GTCTCCTTGTTTGTAGGTAATCTTAAAGAAAATCTATCACAACGATTATATGAACGTGTA TTATTAGACAAATTAGGTGAGAAATGTCGTTGGGATTCAATTGAAGTAATATATTATGAA AGTGGTTGTCTCGTTTTAAATTATCACTCAAGTGAAAAAGCTGAACAAGCTTATGAATTA CTAAATGAATCTATATTTATGGATAAACCACTGANCTGCTCTACTTCTTCCAACAATTCG TCCACAAAGTTTGCCTAAAGGAATTCAACCACTTTTAGTATTTGTTAATTTAAAATCTGG CGGTTGTCAAGGTGNCGATTTAATTGTTGCTTTTCGTCGATTACTCAATCCATTTCAAGT ATTTAACCTTGATTATGGTGGTCCTTTACCTGGCCTATATTGCTTTCGTCATTTAGTCTC ATATAAGATTCTTGTTTGTGGTGGAGATGGTACAGTAGGGTGGACATTGTCATGTTTGGA TATTGTTGGACAGGATGCAGCATGTAACGCTCCTCCTATTGCTCCTCTTCCTCTTGGAAC TANTAATGATCTATCTCGTGTCTTCGATGGGGTTCTGGTTATTCGTCAGCTGATGATCCT CTAACTATTTTAAAGGGATGTATTGCCGCTGAAAAATTGAAGTTANNACGGATGACGTTG ATTGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)