Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6087 cluster # 6087       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6087#0 length = 589 sequences # 4  

consensusID : consensus_6087#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 589
fasta sequence
                              [ACTTCAAAGTTTCTTTGTTGATATTAGTTCCATGAGAAAAAACAATACACACTTTATTCGTATCTATGTTAAGTAACTTTTTAGAACTTTATAATAATCTTCTAACAAGAACCGATTTAATAAAAACAGGTTTGATATTGAGTTGTCCGGAATAGTATTAAACATGTTTGATTACTGAATGAAAGTGAATTTTCAAGAACTGGATAAAAATGATATTTATAATTTCACTCTGGCTCAATTACTGGATAACTTTCAAACTGTGACAAACAACACAGTGTAAATGATAATTCACTGTATAGTGACTAGCAACATCTTGTTAAAGTTCTGTTAATCTAGTTGCGACGATGTTATTAGTACAAGTGATTTAAAGCTGTTCGTAAAATCATTAGATATTAGATGATTAAAAATAACTGACTGTAAACTTTGGATCTAGGTTTCGTCCCCATCTACTATCTTAATGGAGCTGATTCTACCTAGTGACTTTGAACCTGAGTCATCCAGTTTCAAAGTCTCAAAATTTATCACCGATCTGCTTGCGCTACCGAGGATATCCTATATGATAGGAATATCAACAACTGATGAGCCACTA]

[+] EMBL CD117380             [ACTTCAAAGTTTCTTTGTTGATATTAGTTCCATGAGAAAAAACAATACACACTTTATTCGTATCTATGTTAAGTAACTTTTTAGAACTTTATAATAATCTTCTAACAAGAACCGATTTAATAAAAACAGGTTTGATATTGAGTTGTCCGGAATAGTATTAAACATGTTTGATTACTGAATGAAAGTGAATTTTCAAGAACTGGATAAAAATGATATTTATAATTTCACTCTGGCTCAATTACTGGATAACTTTCAAACTGTGACAAACAACACAGTGTAAATGATAATTCACTGTATAGTGACTAGCAACATCTTGTTAAAGTTCTGTTAATCTAGTTGCGACGATGTTATTAGTACAAGTGATTTAAAGCTGTTCGTAAAATCATTAGATATTAGATGATTAAAAATAACTGACTGTAAACTTTGGATCTAGGTTTCGTCCCCATCTACTATCTTAATGGAGCTGATTCTACCTAGTGACTTTGAACCTGAGTCATCCAGTTTCAAAGTCTCAAAATTTATCACCGATCTGCTTGCGCTACCGAGGATATCCTATATGATAGGAATATCAACAACTGATGAGCCACTA]
[+] EMBL CD117599             [ACTTCAAAGTTTCTTTGTTGATATTAGTTCCATGAGAAAAAACAATACACACTTTATTCGTATCTATGTTAAGTAACTTTTTAGAACTTTATAATAATCTTCTAACAAGAACCGATTTAATAAAAACAGGTTTGATATTGAGTTGTCCGGAATAGTATTAAACATGTTTGATTACTGAGTGAAAGTGAATTTTCAAGAACTGGATAAAAATGATATTTATAATTTCACTCTGGCTCAATTACTGGATAACTTTCAAACTGTGACAAACAACACAGTGTAAATGATAATTCACTGTATAGTGACTAGCAACATCTTGTTAAAGTTCTGTTAATCTAGTTGCGACGATGTTATTAGTACAAGTGATTTAAAGCTGTTCGTAAAATCATTAGATATTAGATGATTAAAAATAACTGACTGTAAACTTTGGATCTAGGTTTCGTCCCCATCTACTATCTTAATGGAGCTGATTCTACCTAGTGACTNTGAACCTGAGTCATCCAGTTTCAAAGTCTCAAAATTTATCACCGATCTGCTTGCGCTACCGAGGATATCCTATATGATAGGAATATCNACA               ]
[+] EMBL CD117447             [ACTTCAAAGTTTCTTTGTTGATATTAGTTCCATGAGAAAAAACAATACACACTTTATTCGTATCTATGTTAAGTAACTTTTTAGAACTTTATAATAATCTTCTAACAAGAACCGATTTAATAAAAACAGGTTTGATATTGAGTTGTCCGGAATAGTATTAAACATGTTTGATTACTGAATGAAAGTGAATTTTCAAGAACTGGATAAAAATGATATTTATAATTTCACTCTGGCTCAATTACTGGATAACTTTCAAACTGTGACAAACAACACAGTGTAAATGATAATTCACTGTATAGTGACTAGCAACATCTTGTTAAAGTTCTGTTAATCTAGTTGCGACGATGTTATTAGTACAAGTGATTTAAAGCTGTTCGTAAAATCATTAGATATTAGATGATTAAAAATAACTGACTGTAAACTTTGGATCTAGGTTTCGTCCCCATCTACTATCTTAATGGAGCTGATTCTACCTAGTGACTTTGAACCTGAGTCATCCAGTTTCAAAGTCTCAAAATTTATCACCGATCTGCTTGCGCTACCGAGGATATCCTATATGATAGGAATATCAAC                ]
[+] EMBL CD117795             [ACTTCAAAGTTTCTTTGTTGATATTAGTTCCATGAGAAAAAACAATACACACTTTATTCGTATCTATGTTAAGTAACTTTTTAGAACTTTATAATAATCTTCTAACAAGAACCGATTTAATAAAAACAGGTTTGATATTGAGTTGTCCGGAATAGTATTAAACATGTTTGATTACTGAATGAAAGTGAATTTTCAAGAACTGGATAAAAATGATATTTATAATTTCACTCTGGCTCAATTACTGGATAACTTTCAAACTGTGACAAACAACACAGTGTAAATGATAATTCACTGTATAGTGACTAGCAACATCTTGTTAAAGTTCTGTTAATCTAGTTGCGACGATGTTATTAGTACAAGTGATTTAAAGCTGTTCGTAAAATCATTAGATATTAGATGATTAAAAATAACTGACTGTAAACTTTGGATCTAGGTTTCGTCCCCATCTACTATCTTAATGGAGCTGATTCTACCTAGTGACTTTGAACCTGAGTCATCCAGTTTCAAAGTCTCAAAATTTATCACCGATCTGCTTGCGCTACCGAGGATATCCTATATGATAGGAAT                      ]


>consensus_6087#0 ACTTCAAAGTTTCTTTGTTGATATTAGTTCCATGAGAAAAAACAATACACACTTTATTCG TATCTATGTTAAGTAACTTTTTAGAACTTTATAATAATCTTCTAACAAGAACCGATTTAA TAAAAACAGGTTTGATATTGAGTTGTCCGGAATAGTATTAAACATGTTTGATTACTGAAT GAAAGTGAATTTTCAAGAACTGGATAAAAATGATATTTATAATTTCACTCTGGCTCAATT ACTGGATAACTTTCAAACTGTGACAAACAACACAGTGTAAATGATAATTCACTGTATAGT GACTAGCAACATCTTGTTAAAGTTCTGTTAATCTAGTTGCGACGATGTTATTAGTACAAG TGATTTAAAGCTGTTCGTAAAATCATTAGATATTAGATGATTAAAAATAACTGACTGTAA ACTTTGGATCTAGGTTTCGTCCCCATCTACTATCTTAATGGAGCTGATTCTACCTAGTGA CTTTGAACCTGAGTCATCCAGTTTCAAAGTCTCAAAATTTATCACCGATCTGCTTGCGCT ACCGAGGATATCCTATATGATAGGAATATCAACAACTGATGAGCCACTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)