cluster # 6163

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Schistosoma mansoni
cluster # 6163 cluster # 6163 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6163#0 length = 794 sequences # 4

consensusID : consensus_6163#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 794
fasta sequence

                              [TCAGTACATCTAATGAAGCCACAGATTCAAGCATTTCTTCTCTAAGAACTGTGTCACTACATAATCCAGATCCTTAGTAAGTTTTCTAAAATATACATACTATGCTTTCATCAATTTTTTTTAAATTAACCATGAAGATGTGCTTCTAGCTTAATAAAAGTTTTGAGAATATAGTCAGCAGGAATATTGTAAATCCAGTTTGCATGTTTATAAACATTCACTAACATACTTGAAACCATTAATGACAAACGAATTCAATTTAAAGGTATTTATTATCAATAACTAACTTCAGCTAGATACCTATGTAAAAAACTATCCGTCACTAGACATTTGTTACTTCTTCGATTGAAGCAAGTACACTGTGTTCAAATATTATGACTCCTTGAGATATTGAGTTCAGGATTTTTAGACTTTACACGATGCTTTTAGACCTATGATTCACACTATAAATACTTGTCAATTAACAATGAAGATGGAGGTTTTGGCTAAACACTCTTGAGGGGTCCATATATCATGAGTATTTACTTGTGATTCATTAGGATTATTAAATTGAACAGAATAACTCATTTTTCCCGCTGTTATTCATATCTACTCAGAAATTTCAGTACACCGGGAAGAAAAACCTATGTCAGTTATATATTATTGCCTGCCAATGAATAAGTTAATCATGATATTGATGATAATTCCCTCTCTATAAAGAGTAAAGCAAAATAAAGTTTCCTTAACTCTATTCATAACTACTAAACTAACAAATGATTAAAATGTGACATGTAAACCATGAGATGTCGACTTAG]

[+] EMBL CD160336             [TCAGTACATCTAATGAAGCCACAGATTCAAGCATTTCTTCTCTAAGAACTGTGTCACTACATAATCCAGATCCTTAGTAAGTTTTCTAAAATATACATACTATGCTTTCATCAATTTTTTTTAAATTAACCATGAAGATGTGCTTCTAGCTTAATAAAAGTTTTGAGAATATAGTCAGCAGGAATATTGTAAATCCAGTTTGCATGTTTATAAACATTCACTAACATACTTGAAACCATTAATGACAAACGAATTCAATTTAAAGGTATTTATTATCAATAACTAACTTCAGCTAGATACCTATGTAAAAAACTATCCGTCACTAGACATTTGTTACTTCTTCGATTGAAGCAAGTACACTGTGTTCAAATATTATGACTCCTTGAGATATTGAGTTCAGGATTTTTAGACTTTACACGATGCTTTTAGACCTATGATTCACACTATAAATACTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD160353             [TCAGTACATCTAATGAAGCCACAGATTCAAGCATTTCTTCTCTAAGAACTGTGTCACTACATAATCCAGATCCTTAGTAAGTTTTCTAAAATATACATACTATGCTTTCATCAATTTTTTTTAAATTAACCATGAAGATGTGCTTCTAGCTTAATAAAAGTTTTGAGAATATAGTCAGCAGGAATATTGTAAATCCAGTTTGCATGTTTATAAACATTCACTAACATACTTGAAACCATTAATGACAAACGAATTCAATTTAAAGGTATTTATTATCAATAACTAACTTCAGCTAGATACCTATGTAAAAAACTATCCGTCACTAGACATTTGTTACTTCTTCGATTGAAGCAAGTACACTGTGTTCAAATATTATGACTCCTTGAGATATTGAGTTCAGGATTTTTAGACTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD160343             [TCAGTACATCTAATGAAGCCACAGATTCAAGCATTTCTTCTCTAAGAACTGTGTCACTACATAATCCAGATCCTTAGTAAGTTTTCTAAAATATACATACTATGCTTTCATCAATTTTTCTTAAATTAACCATGAAGATGTGCTTCTAGCTTAATAAAAGTTTTGAGAATATAGTCAGCAGGAATATTGTAAATCCAGTTTGCATGTTTATAAACATTCACTAACATACTTGAAACCATTAATGACAAACGAATTCAATTTAAAGGTATTTATTATCAATAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD160330             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTATGACTCCTTGAGATATTGAGTTCAGGATTTTTAGACTTTACACGATGCTTTTAGACCTATGATTCACACTATAAATACTTGTCAATTAACAATGAAGATGGAGGTTTTGGCTAAACACTCTTGAGGGGTCCATATATCATGAGTATTTACTTGTGATTCATTAGGATTATTAAATTGAACAGAATAACTCATTTTTCCCGCTGTTATTCATATCTACTCAGAAATTTCAGTACACCGGGAAGAAAAACCTATGTCAGTTATATATTATTGCCTGCCAATGAATAAGTTAATCATGATATTGATGATAATTCCCTCTCTATAAAGAGTAAAGCAAAATAAAGTTTCCTTAACTCTATTCATAACTACTAAACTAACAAATGATTAAAATGTGACATGTAAACCATGAGATGTCGACTTAG]




>consensus_6163#0
TCAGTACATCTAATGAAGCCACAGATTCAAGCATTTCTTCTCTAAGAACTGTGTCACTAC
ATAATCCAGATCCTTAGTAAGTTTTCTAAAATATACATACTATGCTTTCATCAATTTTTT
TTAAATTAACCATGAAGATGTGCTTCTAGCTTAATAAAAGTTTTGAGAATATAGTCAGCA
GGAATATTGTAAATCCAGTTTGCATGTTTATAAACATTCACTAACATACTTGAAACCATT
AATGACAAACGAATTCAATTTAAAGGTATTTATTATCAATAACTAACTTCAGCTAGATAC
CTATGTAAAAAACTATCCGTCACTAGACATTTGTTACTTCTTCGATTGAAGCAAGTACAC
TGTGTTCAAATATTATGACTCCTTGAGATATTGAGTTCAGGATTTTTAGACTTTACACGA
TGCTTTTAGACCTATGATTCACACTATAAATACTTGTCAATTAACAATGAAGATGGAGGT
TTTGGCTAAACACTCTTGAGGGGTCCATATATCATGAGTATTTACTTGTGATTCATTAGG
ATTATTAAATTGAACAGAATAACTCATTTTTCCCGCTGTTATTCATATCTACTCAGAAAT
TTCAGTACACCGGGAAGAAAAACCTATGTCAGTTATATATTATTGCCTGCCAATGAATAA
GTTAATCATGATATTGATGATAATTCCCTCTCTATAAAGAGTAAAGCAAAATAAAGTTTC
CTTAACTCTATTCATAACTACTAAACTAACAAATGATTAAAATGTGACATGTAAACCATG
AGATGTCGACTTAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case