These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6167#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 695 fasta sequence [TTTGAACATGAAACGATTGATCGTAAGTTTTTCAGTTTGTCTTTTTTTAGCTATTCGAGATATGCGTAGTTAAGACAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGCAGCCAGTGCTCCTC] [+] EMBL CD079364 [TTTGAACATGAAACGATTGATCGTAAGTTTTTCAGTTTGTCTTTTTTTAGCTATTCGAGATATGCGTAGTTAAGACAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGANATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGCAGCCAGTGCTCCTC] [+] EMBL CD094745 [ CAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCT ] [+] EMBL CD095892 [ GGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCTCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTATTAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACCTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCGTCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGCTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATG ] [-] EMBL CD095614 [ GATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCTCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||