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Schistosoma mansoni
cluster # 6167 cluster # 6167       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6167#0 length = 695 sequences # 4  

consensusID : consensus_6167#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 695
fasta sequence
                              [TTTGAACATGAAACGATTGATCGTAAGTTTTTCAGTTTGTCTTTTTTTAGCTATTCGAGATATGCGTAGTTAAGACAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGCAGCCAGTGCTCCTC]

[+] EMBL CD079364             [TTTGAACATGAAACGATTGATCGTAAGTTTTTCAGTTTGTCTTTTTTTAGCTATTCGAGATATGCGTAGTTAAGACAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGANATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGCAGCCAGTGCTCCTC]
[+] EMBL CD094745             [                                                                           CAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCAAAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGGACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCT                                        ]
[+] EMBL CD095892             [                                                                                                                                                                                              GGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCTCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTATTAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACCTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCGTCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGCTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATG               ]
[-] EMBL CD095614             [                                                                                                                                                                                               GATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAGTCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATCTACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCTCCCTGTAAATGAAAGGAATACGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGTCTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTCTCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCTACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCATATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGGACGTATTTTTCTAGAACATGC              ]


>consensus_6167#0 TTTGAACATGAAACGATTGATCGTAAGTTTTTCAGTTTGTCTTTTTTTAGCTATTCGAGA TATGCGTAGTTAAGACAGTTACACTATTTTGGGTTATTACTGTAATGCATGCAATCATCA AAGCAAAGCTTTTATTACCATTAAATGTTGTAATTTTCCAAACAAATACGTACAAAGAGG ACAAAGTTAGGGATTGACAAAAGTAACGAAGATGTACCGTGTCCCTCCTGTCGTTGGTAG TCCTTCGTGTAGATGAGTCACTCTTCCTGGACTAACCAATGCCCACCCAACACGCGTATC TACTATTGAGCAGTTGTATCGATTGTAGCGTATTCCACCCCCCTGTAAATGAAAGGAATA CGTTTAATTCTCTGCTCTAATAAGTGTTTTACTCTTGTCAAGAATTACTCACTTTGTAGT CTTTTCCAGGCTGGTTTAGTCCAATATTAATTGTGTAAGAGGATGCATCGTGGTGAGGTC TCAAGGAAGGTTGTTCGTCTGGTTTGTATCTGACGACAAAATTCATGCGAGCCCATGGCT ACAATAATGTACAGATGAAATCACAGTTATTATGAAATATTAAATGGGTGCATCATTTCA TATTGGAGAGTACATACCTTATCATCATACCCTTGAAAGAGTTTCTTTTGGATCTTATGG ACGTATTTTTCTAGAACATGCAGCCAGTGCTCCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)