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Schistosoma mansoni
cluster # 6185 cluster # 6185       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6185#0 length = 1240 sequences # 4  

consensusID : consensus_6185#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1240
fasta sequence
                              [ATAGGTGGTTCTACAATTTCAACTAATTTACCAAAGAGTTCAGAAATCACGGATGAAACAACTTTTGCTCAGCATGCCAATGTTGCGAAATGGACACGTCGAGTCGATCTTTTCAGTAAAGATTATATTATTATTCCAATTAATGAATGTGCACATTGGTTTCTTGGTCTTGTCTGCTATCCATGGATGGCAGGAATGGTCAGTTACACGGCCCTTTATCGTGAAGAAGTTTATCATCTCTGCCAGTTGACGGAAAAATTTACTGATGTTGATCGCATCCACTTCTCAGGCGACGATTTAAATTCACTAGATATCGGTGAAGAAGTTATTCAAAGGTTACCTACCGACACTCCAGGTGAAGCATTTGATCGGTGGCGGCGAAGACGTTTAGCCTGGCTTCGTCAACGTGGTGTTAACGCAATGCCATGTGTTTTACTGTTCGATTCGCTTCCTTGTCAAAGCCGAGTTGGCAATTTGCATGTTATTCGAAGTTACTTACAAGCTGAATGGAATACACGCAGATCAGCCCAAGAATGGTGTTCTCCGCTTCGATAAGGATACAATTCGAGGTTNTAGTCCTCGAGTGCCTGTTCAGAGTAACCTGGTTGATTGTGGAATCTACCTACTTCATTACGTGGAAATGCTTTTCAAGAAACCTGTTCAAAGTTATACGAAAGATTATTTCCAACACGAAATGGCTGGTTGGTTCCCAGAAGCTACTGTCAGTAAGAAGCGTGCCCAAATTCATGACCTTTTGGTTAACCTACGAGAGCGTAATCTGAGGGAGAAGGC-TAAAAACTGATTCCAACACGAATCACTGTAACGCTATTCCTGTTTTCATTTACGAAATTCAATTCTTCAAATGAATATAACCACTACATCTTTTTGTATATAAATACACTCCCATCGTTCCTCTTGCATTTCGATTGTATTTTTCGACGGTGTGATTGGTTCGGAAACTAATACTGAACTATTAATGATACACTTTGTATTACAATTCTTCCAGTCGAATATTTCCCTTCTACTTATCTTAAAACAATGGACTATCATCAAATGAATCTTTTAACCAATTTTTTAAAAGTAACTGTGAACGTACTACTGCGTAATTTTCTAGTTTTACTATTTGTAATACATCAATGACACCAACCATAACGGTATTCGTAAAGCTTTTCTTTCTGCACACTATTGTTATTTTCATAAAAGCAAGAAACTAATAATGAGTATTAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD127511             [ATAGGTGGTTCTACAATTTCAACTAATTTACCAAAGAGTTCAGAAATCACGGATGAAACAACTTTTGCTCAGCATGCCAATGTTGCGAAATGGACACGTCGAGTCGATCTTTTCAGTAAAGATTATATTATTATTCCAATTAATGAATGTGCACATTGGTTTCTTGGTCTTGTCTGCTATCCATGGATGGCAGGAATGGTCAGTTACACGGCCCTTTATCGTGAAGAAGTTTATCATCTCTGCCAGTTGACGGAAAAATTTACTGATGTTGATCGCATCCACTTCTCAGGCGACGATTTAAATTCACTAGATATCGGTGAAGAAGTTATTCAAAGGTTACCTACCGACACTCCAGGTGAAGCATTTGATCGGTGGCGGCGAAGACGTTTAGCCTGGCTTCGTCAACGTGGTGTTAACGCAATGCCATGTGTTTTACTGTTCGATTCGCTTCCTTGTCAAAGCCGAGTTGGCAATTTGCATGTTATTCGAAGTTACTTACAAGCTGAATGGAATACACGCAGATCAGCCCAAGAATGGTGTTCTCCGCTTCGATAAGGATACAATTCGAGGTTNTAGTCCTCGAGTGCCTGTTCAGAGTAACCTGGTTGATTGTGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD125814             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCAGATCAGCCCAAG ATGGTGTTCTCCGCTTCGATAAGGATACAATTCGAGGTTTTAGTCCTCGAGTGCCTGTTCAGAGTAACCTGGTTGATTGTGGAATCTACCTACTTCATTACGTGGAAATGCTTTTCAAGAAACCTGTTCAAAGTTATACGAAAGATTATTTCCAACACGAAATGGCTGGTTGGTTCCCAGAAGCTACTGTCAGTAAGAAGCGTGCCCAAATTCATGACCTTTTGGTTAACCTACGAGAGCGTAATCTGAGGGAGAAGGC TAAAAACTGATTCCAACACGAATCACTGTAACGCTATTCCTGTTTTCATTTACGAAATTCAATTCTTCAAATGAATATAACCACTACATCTTTTTGTATATAAATACACTCCCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD131725             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAAATTCATGACCTTTTGGTTAACCTACGAGAGCGTAATCTGAGGGAGAAGGC TAAAAACTGATTCCAACACGAATCACTGTAACGCTATTCCTGTTTTCATTTACGAAATTCAATTCTTCAAATGAATATAACCACTACATCTTTTTGTATATAAATACACTCCCATCGTTCCTCTTGCATTTCGATTGTATTTTTCGACGGTGTGATTGGTTCGGAAACTAATACTGAACTATTAATGATACACTTTGTATTACAATTCTTCCAGTCGAATATTTCCCTTCTACTTATCTTAAAACAATGGACTATCATCAAATGAATCTTTTAACCAATTTTTTAAAAGTAACTGTGAACGTACTACTGCGTAATTTTCTAGTTTTACTATTTGTAATACATCAATGACACCAACCATAACGGTATTCGTAAAGCTTTTCTTTCTGCACACTATTGTTATTTTCATAAAAGCAAGAAACTAATAATGAGTATT               ]
[-] EMBL AI395682             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCTGAGGGAG AGGCTTAAAAACTGATTCCAACCGGAATCACTGTAACGCTATTCCTGTTTTCATTTACGAAATTCAATTCTTCAAATGAATATACCCACTACATCTTTGTGTATATAAATACACTCCCATCGTTCCTCTTGCATTTCGATTGTATTTTTCGACGGTGTGATTGGTTCGGAAACTAATACTGAACTATTAATGATACACTTTGTATTACAATTCTTCCAGTCGAATATTTCCCTTCTACTTATCTTAAAACAATGGACTATCATCAAATGAATCTTTTAACCAATTTTTTAAAAGTAACTGTGAACGTACTACTGCGTAATTTTCTAGTTTTACTATTTGTAATACATCAATGACACCAACCATAACGGTATTTGTAAAGCTTTTCTTTCTGCACACTATTGTTATTTTCATAAAAGCAAGAAACTAATAATGAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_6185#0 ATAGGTGGTTCTACAATTTCAACTAATTTACCAAAGAGTTCAGAAATCACGGATGAAACA ACTTTTGCTCAGCATGCCAATGTTGCGAAATGGACACGTCGAGTCGATCTTTTCAGTAAA GATTATATTATTATTCCAATTAATGAATGTGCACATTGGTTTCTTGGTCTTGTCTGCTAT CCATGGATGGCAGGAATGGTCAGTTACACGGCCCTTTATCGTGAAGAAGTTTATCATCTC TGCCAGTTGACGGAAAAATTTACTGATGTTGATCGCATCCACTTCTCAGGCGACGATTTA AATTCACTAGATATCGGTGAAGAAGTTATTCAAAGGTTACCTACCGACACTCCAGGTGAA GCATTTGATCGGTGGCGGCGAAGACGTTTAGCCTGGCTTCGTCAACGTGGTGTTAACGCA ATGCCATGTGTTTTACTGTTCGATTCGCTTCCTTGTCAAAGCCGAGTTGGCAATTTGCAT GTTATTCGAAGTTACTTACAAGCTGAATGGAATACACGCAGATCAGCCCAAGAATGGTGT TCTCCGCTTCGATAAGGATACAATTCGAGGTTNTAGTCCTCGAGTGCCTGTTCAGAGTAA CCTGGTTGATTGTGGAATCTACCTACTTCATTACGTGGAAATGCTTTTCAAGAAACCTGT TCAAAGTTATACGAAAGATTATTTCCAACACGAAATGGCTGGTTGGTTCCCAGAAGCTAC TGTCAGTAAGAAGCGTGCCCAAATTCATGACCTTTTGGTTAACCTACGAGAGCGTAATCT GAGGGAGAAGGCTAAAAACTGATTCCAACACGAATCACTGTAACGCTATTCCTGTTTTCA TTTACGAAATTCAATTCTTCAAATGAATATAACCACTACATCTTTTTGTATATAAATACA CTCCCATCGTTCCTCTTGCATTTCGATTGTATTTTTCGACGGTGTGATTGGTTCGGAAAC TAATACTGAACTATTAATGATACACTTTGTATTACAATTCTTCCAGTCGAATATTTCCCT TCTACTTATCTTAAAACAATGGACTATCATCAAATGAATCTTTTAACCAATTTTTTAAAA GTAACTGTGAACGTACTACTGCGTAATTTTCTAGTTTTACTATTTGTAATACATCAATGA CACCAACCATAACGGTATTCGTAAAGCTTTTCTTTCTGCACACTATTGTTATTTTCATAA AAGCAAGAAACTAATAATGAGTATTAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)