cluster # 623

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 623 cluster # 623 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_623#0 length = 830 sequences # 2

consensusID : consensus_623#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 830
fasta sequence

                              [CACCAGAGTT-AACCGTTGTTTATTATAGCAATGTTTGTCAGTTATTTATTACAATATTATGTACCAGCGCAAATATTCAGTCGATTAATGGAGAAATTAACATGTCATCGTGATGCATCGGATCGTCGACGATATATTAATTTGAAATTAATGCGAATTGGTATGGTTATATTCTCATACGCAGCTGCTGTTTTAATCCCTCGACTAGATCTATTATTATCATTGATTGGATCATTGGCTGGATCAACACTTGCTTTCATATTACCTGCAACTTTAGAAATAATTTTCTTATGGTCTGATCGTCAACAAATCTCATGGTTTTGGTTAACAGTATTTACTAAACATATAATCTTTATATCAATTGGTCTGTTGAGTTGTTTCGGTGGTTTGATTGCTACAATTATACAAATTATTAAAGCATTCCACTCTAAATAATCCTAATTAAAGTTGATTATATATATATATATATATGTATTATTACCTCAATTGAAATGTTCATATTGTATTGTAAATCACCAATATCTTACACAACAATCGTTGCTTCTGTCGCTGTCAAACCAGTTAGGACAAAGCATAATAGTATTCATTCTTCAATGCTCAATGAATATAAATGAGATTATTTTTATGCCTCTACAATATCAGCTGATTATATCAGTCAATCAATCATCCAAATTACTTTCTTAATTTCTAATTCATCAAACTATTGATCATTTCAATCATATTTTGTATTTACTCTTTTTTTTTGCATAATGTAAATTTGCTTAGTTNTCTTTTCTTTCTTTTTTTTAATGGAACAATCCTAAACCCATTCACAATCAATATACCTTTGA]

[+] EMBL CD081202             [CACCAGAGTT AACCGTTGTTTATTATAGCAATGTTTGTCAGTTATTTATTACAATATTATGTACCAGCGCAAATATTCAGTCGATTAATGGAGAAATTAACATGTCATCGTGATGCATCGGATCGTCGACGATATATTAATTTGAAATTAATGCGAATTGGTATGGTTATATTCTCATACGCAGCTGCTGTTTTAATCCCTCGACTAGATCTATTATTATCATTGATTGGATCATTGGCTGGATCAACACTTGCTTTCATATTACCTGCAACTTTAGAAATAATTTTCTTATGGTCTGATCGTCAACAAATCTCATGGTTTTGGTTAACAGTATTTACTAAACATATAATCTTTATATCAATTGGTCTGTTGAGTTGTTTCGGTGGTTTGATTGCTACAATTATACAAATTATTAAAGCATTCCACTCTAAATAATCCTAATTAAAGTTGATTATATATATATATATATATGTATTATTACCTCAATTGAAATGTTCATATTGTATTGTAAATCACCAATATCTTACACAACAATCGTTGCTTCTGTCGCTGTCAAACCAGTTAGGACAAAGCATAATAGTATTCATTCTTCAATGCTCAATGAATATAAATGAGATTATTTTTATGCCTCTACAATATCAGCTGATTATATCAGTCAATCAATCATCCAAATTACTTTCTTAATTTCTAATTCATCAAACTATTGATCATTTCAATCATATTTTGTATTTACTCTTTTTTTTTGCATAATGTAAATTTGCTTAGTTNTCTTTTCTTTCTTTTTTTTAATGGAACAATCCTAAACCCATTCACAATCAATATACCTTTG ]
[-] EMBL CD075032             [      AGTTAAACCGTTGTTTATCATAGCAATGTTTGTCAGTTATTTATTACAATATTATGTACCAGCGCAAATATTCAGTCGATTAATGGAGAAATTAACATGTCATCGTGATGCATCGGATCGTCGACGATATATTAATTTGAAATTAATGCGAATTGGTATGGTTATATTCTCATACGCAGCTGCTGTTTTAATCCCTCGACTAGATCTATTATTATCATTGATTGGATCATTGGCTGGATCAACACTTGCTTTCATATTACCTGCAACTTTAGAAATAATTTTCTTATGGTCTGATCGTCAACAAATCTCATGGTTTTGGTTAACAGTATTTACTAAACATATAATCTTTATATCAATTGGTCTGTTGAGTTGTTTCGGTGGTTTGATTGCTACAATTATACAAATTATTAAAGCATTCCACTCTAAATAATCCTAATTAAAGTTGATTATATATATATATATATATGTATTATTACCTCAATTGAAATGTTCATATTGTATTGTAAATCACCAATATCTTACACAACAATCGTTGCTTCTGTCGCTGTCAAACCAGTTAGGACAAAGCATAATAGTATTCATTCTTCAATGCTCAATGAATATAAATGAGATTATTTTTATGCCTCTACAATATCAGCTGATTATATCAGTCAATCAATCATCCAAATTACTTTCTTAATTTCTAATTCATCAAACTATTGATCATTTCAATCATATTTTGTATTTACTCTTTTTTTTTGCATAATGTAAATTTGCTTAGTTTTCTTTTCGATCTTTTTTTTAATGGAACAATCCTAAACCCATTCACAATCAAAATACCTTTGA]




>consensus_623#0
CACCAGAGTTAACCGTTGTTTATTATAGCAATGTTTGTCAGTTATTTATTACAATATTAT
GTACCAGCGCAAATATTCAGTCGATTAATGGAGAAATTAACATGTCATCGTGATGCATCG
GATCGTCGACGATATATTAATTTGAAATTAATGCGAATTGGTATGGTTATATTCTCATAC
GCAGCTGCTGTTTTAATCCCTCGACTAGATCTATTATTATCATTGATTGGATCATTGGCT
GGATCAACACTTGCTTTCATATTACCTGCAACTTTAGAAATAATTTTCTTATGGTCTGAT
CGTCAACAAATCTCATGGTTTTGGTTAACAGTATTTACTAAACATATAATCTTTATATCA
ATTGGTCTGTTGAGTTGTTTCGGTGGTTTGATTGCTACAATTATACAAATTATTAAAGCA
TTCCACTCTAAATAATCCTAATTAAAGTTGATTATATATATATATATATATGTATTATTA
CCTCAATTGAAATGTTCATATTGTATTGTAAATCACCAATATCTTACACAACAATCGTTG
CTTCTGTCGCTGTCAAACCAGTTAGGACAAAGCATAATAGTATTCATTCTTCAATGCTCA
ATGAATATAAATGAGATTATTTTTATGCCTCTACAATATCAGCTGATTATATCAGTCAAT
CAATCATCCAAATTACTTTCTTAATTTCTAATTCATCAAACTATTGATCATTTCAATCAT
ATTTTGTATTTACTCTTTTTTTTTGCATAATGTAAATTTGCTTAGTTNTCTTTTCTTTCT
TTTTTTTAATGGAACAATCCTAAACCCATTCACAATCAATATACCTTTGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case