These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6294#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 299 fasta sequence [GGCTCACGGAACTTTGTGTCGTTATCGGCGCGTTCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAA-TATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAG-TGCTTCAAAACTTGCTTGT-TAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAAT-GTAGTCCAGCGCTAA-AACTATCTG-CTGGGTTAACATTCCGGGTTACT-TTCATA-TCGCTATACTAAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTAAAGATAAAACTAAAAGTTCGTT] [+] EMBL CD167484 [GGCTCACGGAACTTTGTGTCGTTATCGGCGCG TCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAA TATAT ACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAG TGCTTCAAAACTTGCTTGT TAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAAT GTAGTCCAGCGCTAA AACTATCTG CTGGGTTAACATTCCGGGTTACT TTCATA TCGCTATACTGAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTAA ] [-] EMBL CD167360 [ CGGCGCGTTCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAA TATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAG TGCTTCAAAACTTGCTTGT TAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAAT GTAGTCCAGCGCTAA AACTATCTG CTGGGTTAACATTCCGGGTTACT TTCATA TCGCTATACTAAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTATAGATAAAACTAAAAGTTCGTT] [-] EMBL CD167407 [ CGGCGCGTTCTAGTTTTCGAGTTTGTTTTTCACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAA TATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAG TGCTTCAAAACTTGCTTGT TAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAATCGTAGTCCAGCGCTAACAACTATCTGCCTGGGTTAACATTCCGGGTTACTGTTCATAGTCGCTATACTAAAACTAAAATCTAGCTATTATGTGAGTGTCTT TAAg ] [+] EMBL CD167382 [ GAGTTTGTTTTACACTATTATTAGGTATGATCTCAGCCCTTAAAGTATATAACCATCTATGTCCACTTCTGCTTGTGGTCAAAAGATGCTTCAAAACTTGCTTGTGTAGGATAAGTAACATTATTGCAATTTCTTAAT GTAGTCCAGCGCTAA AACTATCTG CTGGGTTAACATTCCGGGTTACT TTCATA TCGCTATACTAAAACTAAAATCTAGCTATTATTTGAGTGTCTTCTAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||