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Schistosoma mansoni
cluster # 6297 cluster # 6297       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6297#0 length = 855 sequences # 4  

consensusID : consensus_6297#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 855
fasta sequence
                              [TTGTTGTCAACATACCCAACAATAATTCTTTTACTTCCCCGTCGAATTATACGAACCTCTCCATCTTCCTGTTCATAATTCTTTGTTTCGCGTTGACCAGCTAACTGCTTTCTTGTGTTATTCAACCTGTTTTTCCATAATGTGAGGAAATAAATGTCATTGATATGGTCAAAGGGAAGTTCCAGGCTTACTTTCCGTTTGAAAAGAATTCTTTGACGTACAGCTGCCTTCATTGTCGTGCACATTTAGCTCGTCATGACGACCTCATAAGTAAATCTTTCCAAGGAAGTCAAGGTCGAGCTTATCTATTTAATCAGGCTGTAAATGTTCGTTGCGCTGAAGCTAAACAACGTGTTCTTCTGACCGGGTTGCATTTTGTAGCTGACATATTTTGTGCATGCTGTGATACAGCATTAGGTTGGAAGTATGAACGTGCTTTTGAACCTAGTCAACGATACAAAGAAGGCAAAGTGATAATTGAACTGGTACATTTATTTAAGGATAACAGTTGGGATGCTGAATGGTTATATCCTTTGTATCCGACAAGCTCTGTTGCTAATGGTAATAATTCAGACACAACTTTAAATTATTCAAAGCCGCATCCAATTAGTGTAAGTGACTACCATCACAGTGAAACTGGAAGATCTAAATCTTCATTAAAATTCCCACTGATTGATGCGTCTAATTCTTTATCATCCACTGATGGAGGTGTTTTTGAATCTTCGACAACTGATTTAATTGATCCTAATGAAGAAACGTGTACGGATTTCGAGCATAGTCATCATCATTCACACCCTCCTCCTCCTCTACACCGCCACCATCACCAACTTCATCATCATTTGAATACATCTCCTT]

[+] EMBL CD092030             [TTGTTGTCAACATACCCAACAATAATTCTTTTACTTCCCCGTCGAATTATACGAACCTCTCCATCTTCCTGTTCATAATTCTTTGTTTCGCGTTGACCAGCTAACTGCTTTCTTGTGTTATTCAACCTGTTTTTCCATAATGTGAGGAAATAAATGTCATTGATATGGTCAAAGGGAAGTTCCAGGCTTACTTTCCGTTTGAAAAGAATTCTTTGACGTACAGCTGCCTTCATTGTCGTGCACATTTAGCTCGTCATGACGACCTCATAAGTAAATCTTTCCAAGGAAGTCAAGGTCGAGCTTATCTATTTAATCAGGCTGTAAATGTTCGTTGCGCTGAAGCTAAACAACGTGTTCTTCTGACCGGGTTGCATTTTGTAGCTGACATATTTTGTGCATGCTGTGATACAGCATTAGGTTGGAAGTATGAACGTGCTTTTGAACCTAGTCAACGATACAAAGAAGGCAAAGTGATAATTGAACTGGTACATTTATTTAAGGATAACAGTTGGGATGCTGAATGGTTATATCCTTTGTATCCGACAAGCTCTGTTGCTAATGGTAATAATTCAGACACAACTTTAAATTATTCANAGCCGCATCCAATTAGTG                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD091928             [TTGTTGTCAACATACCCAACAATAATTCTTTTACTTCCCCGTCGAATTATACGAACCTCTCCATCTTCCTGTTCATAATTCTTTGTTTCGCGTTGACCAGCTAACTGCTTTCTTGTGTTATTCAACCTGTTTTTCCATAATGTGAGGAAATAAATGTCATTGATATGGTCAAAGGGAAGTTCCAGGCTTACTTTCCGTTTGAAAAGAATTCTTTGACGTACAGCTGCCTTCATTGTCGTGCACATTTAGCTCGTCATGACGACCTCATAAGTAAATCTTTCCAAGGAAGTCAAGGTCGAGCTTATCTATTTAATCAGGCTGTAAATGTTCGTTGCGCTGAAGCTAAACAACGTGTTCTTCTGACCGGGTTGCATTTTGTAGCTGACATATTTTGTGCATGCTGTGATACAGCATTAGGTTGGAAGTATGAACGTGCTTTTGAACCTAGTCAACGATACAAAGAAGGCAAAGTGATAATTGAACTGGTACATTTATTTAAGGATAACAGTTGGGATGCTGAATGGTTATATCCTTTGTATCCGACAAGCTCTGTTGCTAATGGTAATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI975838             [                                                                                                                                                                                                    GTTTGAAAAGAATTCTTTGACGTACAGCTGCCTTCATTGTCGTGCACATTTAGCTCGTCATGACGACCTCATAAGTAAATCTTTCCAAGGAAGTCAAGGTCGAGCTTATCTATTTAATCAGGCTGTAAATGTTCGTTGCGCTGAAGCTAAACAACGTGTTCTTCTGACCGGGTTGCATTTTGTAGCTGACATATTTTGTGCATGCTGTGATACAGCATTAGGTTGGAAGTATGAACGTGCTTTTGAACCTAGTCAACGATACAAAGAAGGCAAAGTGATAATTGAACTGGTACATTTATTTAAGGATAACAGTTGGGATGCTGAATGGTTATATCCTTTGTATCCGACAAGCTCTGTTGCTAATGGTAATAATTCAGACACAACTTTAAATTATTCAAAGCCGCATCCAATTAGTGTAAGTGACTACCATCACAGTGAAACTGGAAGATCTAAATCT                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD092008             [                                                                                                                                                                                                                                                                 GACGACNTCATAAGTAAATCTTTCCAAGGAAGTCAAGGTCGAGCTTATCTATTTAATCAGGCTGTAAATGTTCGTTGCGCTGAAGCTAAACAACGTGTTCTTCTGACCGGGTTGCATTTTGTAGCTGACATATTTTGTGCATGCTGTGATACAGCATTAGGTTGGAAGTATGAACGTGCTTTTGAACCTAGTCAACGATACAAAGAAGGCAAAGTGATAATTGAACTGGTACATTTATTTAAGGATAACAGTTGGGATGCTGAATGGTTATATCCTTTGTATCCGACAAGCTCTGTTGCTAATGGTAATAATTCAGACACAACTTTAAATTATTCAAAGCCGCATCCAATTAGTGTAAGTGACTACCATCACAGTGAAACTGGAAGATCTAAATCTTCATTAAAATTCCCACTGATTGATGCGTCTAATTCTTTATCATCCACTGATGGAGGTGTTTTTGAATCTTCGACAACTGATTTAATTGATCCTAATGAAGAAACGTGTACGGATTTCGAGCATAGTCATCATCATTCACACCCTCCTCCTCCTCTACACCGCCACCATCACCAACTTCATCATCATTTGAATACATCTCCTT]


>consensus_6297#0 TTGTTGTCAACATACCCAACAATAATTCTTTTACTTCCCCGTCGAATTATACGAACCTCT CCATCTTCCTGTTCATAATTCTTTGTTTCGCGTTGACCAGCTAACTGCTTTCTTGTGTTA TTCAACCTGTTTTTCCATAATGTGAGGAAATAAATGTCATTGATATGGTCAAAGGGAAGT TCCAGGCTTACTTTCCGTTTGAAAAGAATTCTTTGACGTACAGCTGCCTTCATTGTCGTG CACATTTAGCTCGTCATGACGACCTCATAAGTAAATCTTTCCAAGGAAGTCAAGGTCGAG CTTATCTATTTAATCAGGCTGTAAATGTTCGTTGCGCTGAAGCTAAACAACGTGTTCTTC TGACCGGGTTGCATTTTGTAGCTGACATATTTTGTGCATGCTGTGATACAGCATTAGGTT GGAAGTATGAACGTGCTTTTGAACCTAGTCAACGATACAAAGAAGGCAAAGTGATAATTG AACTGGTACATTTATTTAAGGATAACAGTTGGGATGCTGAATGGTTATATCCTTTGTATC CGACAAGCTCTGTTGCTAATGGTAATAATTCAGACACAACTTTAAATTATTCAAAGCCGC ATCCAATTAGTGTAAGTGACTACCATCACAGTGAAACTGGAAGATCTAAATCTTCATTAA AATTCCCACTGATTGATGCGTCTAATTCTTTATCATCCACTGATGGAGGTGTTTTTGAAT CTTCGACAACTGATTTAATTGATCCTAATGAAGAAACGTGTACGGATTTCGAGCATAGTC ATCATCATTCACACCCTCCTCCTCCTCTACACCGCCACCATCACCAACTTCATCATCATT TGAATACATCTCCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)