Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6328 cluster # 6328       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6328#0 length = 552 sequences # 4  

consensusID : consensus_6328#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 552
fasta sequence
                              [ACTTCTAGATACTCCACTGTCCGAGCGCGGCGCTCTACAATCTAATAGATCCCCCATGCTGCAGGAATGGAAAGGGGACTTTTATCGGCTGCTAAATCTGTCGGTGCTAGTGCTAATGTCATGGTGTAAGTTGCTCTATTATACTGTATAATTCTTTTTTTCTCACTCATAATCAGACTAAACGAAATCTCGTTATTTATGCCTCTAATCTATATTCACTTTGATTATTATCTAATGAAATTGTGCGAATAAATTTTGCTGATTAGTTGACATTTTTTAAATAGATCCAAAATCTGTTTATCCAGTAAGAAGTGTATTATATTTAAGACATTTGGGATAGATCTAAATAGTCTCTAGTTTTCTGACGATAGCCCGTTGGCAACCTACAGTAGTCACTGAAATTATTGTCCAACTCCAACTCGATTAACTAAGCTTTGAAATCATAACTTTCCAATACAGCATTTGAAAATAAACCTTTTCAAAATCCGTCATAGATTAGCTGTGTATTATACGTTATATTGAAAACGTAGTGACTGGTTTTTCTCTAGTCCA]

[+] EMBL BG932043             [ACTTCTAGATACTCCACTGTCCGAGCGCGGCGCTCTACAATCTAATAGATCCCCCATGCTGCAGGAATGGAAAGGGGACTTTNATCGTCTGCTAAATCTGTCGGTGCTAGTGCTAATGTCATGGTGTAAGTTGCTCTATTATACTGTATAATTCTTTTCTTCTCACTCATAATCAGACTAAACGAAATCTCGTGATTTATGCCTCTAATCTATATTCACTTTGATTATTATCTAATGAAATTGTGCGAATAAATTATGCTGATTACTTGACATTTTTTAAATAGATCCAAAATCTGTTTATCCAATAAGAAGTGTATTATATTTAAGACATTTGGGATAGATCTAAATAGTCTCTACTTTCCTGACGATAGCCCGTTGGCAACC                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BG932045             [                                                                             ACTTTTATCGGCTGCTAAGTCTGTCGGTGCTAGTGCTAATGTCATGGTGTAAGTTGCTCTATTATACTGTATAATTCTTTTTTTCTCACTCATAATCAGACTAAACGAAATCTCGTTATTTATGCCTCTAATCTATATTCACTTTGATTATTATCTAATGAAATTGTGCGAATAAATTTTGCTGATTAGTTGACATTTTTTAAATAGATCCAAAATCTGTTTATCCAGTAAGAAGTGTATTATATTTAAGACATTTGGGATAGATCTAAATAGTCTCTAGTTTTCTGACGATAGCCCGTTGGCAACCTACAGTAGTCACTGAAATTATTGTCCAACTCCAACTCGATTAACTAAGCTTTGAAATCATAACTTTCCAATACAGCATTTGAAAATAAACCTTTTCAAAATCCGTCATAGATTAGCTGTGTATTATACGTTATATTGAAAACGTAGTGACTGGTTTTTCTCTAGTCCA]
[+] EMBL BG932046             [                                                                             ACTTTTATCGGCTGCTAAATTTGTCGGTGCTAATGCTAATGTCATGGTGTAAGTTGCTCTATTATACTGTATAATTCTTTTTTTCTCACTCATAATCAGACTAAACGAAATCTCGTTATTTATGCCTCTAATCTATATTCACTTTGATTATTATCTAATGAAATTGTGCGAATAAATTTTGCTGATTAGTTGACATTTTTTAAATAGATCCAAAATCTGTTTATCCAGTAAGAAGTGTATTATATTTAAGACATTTGGGATAGATCTAAATAGTCTCTAGTTTTCTGACGATAGCCCGTTGGCAACCTAGAGTAGTCACTGAAATTATTGTCCAACTCCAACTCGATTAACTAAGCT                                                                                                                      ]
[+] EMBL BG932044             [                                                                             ACTTTTATCGGCTGCTAAATCTGTCGGTGCTAGTGCTAATGTCATGGTGTAAGTTGCTCTATTATACTGTATAATTCTTTTTTTCTCACTCATAATCAGACTAAACGAAATCTCGTTATTTATGCCTCTAATCTATATTCACTTTGATTATTATCTAATGAAATTGTGCGAATAAATTTTGCTGATTAGTTGACATTTTTTAAATAGATCCAAAATCTGTTTATCCAGTAAGAAGTGTATTATATTTAAGACATATGGGATAGATCTAAATAGTCTCTAGTTTTCTGACGATAGCCCGTTGGCAACCTACAGTAGTCACTGAAATTATTGTCCAACTCCAACTCGATTAACTAA                                                                                                                         ]


>consensus_6328#0 ACTTCTAGATACTCCACTGTCCGAGCGCGGCGCTCTACAATCTAATAGATCCCCCATGCT GCAGGAATGGAAAGGGGACTTTTATCGGCTGCTAAATCTGTCGGTGCTAGTGCTAATGTC ATGGTGTAAGTTGCTCTATTATACTGTATAATTCTTTTTTTCTCACTCATAATCAGACTA AACGAAATCTCGTTATTTATGCCTCTAATCTATATTCACTTTGATTATTATCTAATGAAA TTGTGCGAATAAATTTTGCTGATTAGTTGACATTTTTTAAATAGATCCAAAATCTGTTTA TCCAGTAAGAAGTGTATTATATTTAAGACATTTGGGATAGATCTAAATAGTCTCTAGTTT TCTGACGATAGCCCGTTGGCAACCTACAGTAGTCACTGAAATTATTGTCCAACTCCAACT CGATTAACTAAGCTTTGAAATCATAACTTTCCAATACAGCATTTGAAAATAAACCTTTTC AAAATCCGTCATAGATTAGCTGTGTATTATACGTTATATTGAAAACGTAGTGACTGGTTT TTCTCTAGTCCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)