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Schistosoma mansoni
cluster # 6344 cluster # 6344       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6344#0 length = 639 sequences # 4  

consensusID : consensus_6344#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 639
fasta sequence
                              [CAGAACAAACCAGAGTACTGTATAGTATAAACATAGTATGAGACTCAGCAGGCTACTTGCAGGTGCTCTATGATGCTAGAGTTCTGTGAATATCAGTACATCCGGTTTCACGAACTGTTTTTTGTTAACAAAGTAGCCATCAAACTGGCGGAATTTTGTTTTCTTTTAAACTAGGTTGTAGTGGATCTCTACACTAATTGGTTGGAGTTTTCCCGTTGTCGATATTAACACTACATTTGCTCAGTCTCTACTGACATATATGCTTTTTTTGGCGGATTAGCTTGATAGTTCATTTAGTTACAAGTTTTAATACATTTGCATCATGGCTATCAAGGTAATTCAAGACGCGCGTTTCATCCTATATGTGGCCACAGTGTCGATGCTCACGCTGAGATTCGAACCTAATGTGTTTATTATCGGCAAGCATTATTAGTCTAAAAAACCTAGTGTTGTCGTCAGATCAAGTATCTTCGGAAAGTGGAAGGTAGATATTCATATCTGTAAAAAAGTTAAACAGNCATAATGACATTGGCAGATTCCTCAGATAATAACTTTTATATCGGCCTTTACATGTTACTTAAACTCTTGTCTATCTGATACCTTTATTAGATTCAGATTATTTCAGTCCACCCCTCTGTT]

[+] EMBL CD119773             [CAGAACAAACCAGAGTACTGTATAGTATAAACATAGTATGAGACTCAGCAGGCTACTTGCAGGTGCTCTATGATGCTAGAGTTCTGTGAATATCAGTACATCCGGTTTCACGAACTGTTTTTTGTTAACAAAGTAGCCATCAAACTGGCGGAATTTTGTTTTCTTTTAAACTAGGTTGTAGTGGATCTCTACACTAATTGGTTGGAGTTTTCCCGTTGTCGATATTAACACTACATTTGCTCAGTCTCTACAGACATATATGC TTTTTTGGCGGATTAGCTTGATAGTTCATTTAGTTACAAGTTTTAATACATTTGCATCATGGCTATCAAGGTAATTCAAGACGCGCGTTTCATCCTATATGTGGCCACAGTGTCGATGCTCACGCTGAGATTCGAACCTAATGTGTTTATTATCGGCAAGCATTATTAGTCTAAAAAACCTAGTGTTGTCGTCAGATCAAGTATCTTCGGAAAGTGGAAGGTAGATATTCATATCTGTAAAAAAGTTAAACAGNCATAATGACATTGGCAGATTCCTCAGATAATAACTTTTATATCGGCCTTTACATGTTACTTAAACTCTTGTCTATCTGATACCTTTATTAGATTCAGATTATTTCAGTCCACCCCTCTGTT]
[-] EMBL CD149950             [                                                                                                                                                                                                                     CGTTGTCGATATTAACACTACATTTGCTCAGTCTCTACTGACATATATGCTTTTTTTGGCGGATTAGCTTGATAGTTCATTTAGTTACAAGTTTTAATACATTTGCATCATGGCTATCAAGGTAATTCAAGACGCGCGTTTCATCCTATATGTGGCCACAGTGTCGATGCTCACGCTGAGATTCGAACCTAATGTGTTTATTATCGGCAAGCATTATTAGTCTAAAAAACCTAGTGTTGTCGTCAGATCAAGTATCTTCGGAAAGTGGAAGGTAGATATTCATATCTGTAAAAAAGTTAAACA                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD149976             [                                                                                                                                                                                                                                             TGCTCAGTCTCTAATGACATATATGCTTTTTTTGGCGGATTAGCTTGATAGTTCATTTAGTTACAAGTTTTAATACATTTGCATCATGGCTATCAAGGTAATTCAAGACGCGCGTTTCATCATATATGTGGCCACAGTGTCGATGCTCACGCTGAGATTAGAACATAATGTGTTTATTATCGGCAAGCATTATTAGT                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD149977             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACGCTGAGATTCGAACCTAATGTGTTTATTATCGGCAAGCATTATTAGTCTAAAAAACCTAGTGTTGTCGTCAGATCAAGTATCTTCGGAAAGTGGAAGGTAGATATTCATATCTGTAAAAAAGTTAAACA                                                                                                                           ]


>consensus_6344#0 CAGAACAAACCAGAGTACTGTATAGTATAAACATAGTATGAGACTCAGCAGGCTACTTGC AGGTGCTCTATGATGCTAGAGTTCTGTGAATATCAGTACATCCGGTTTCACGAACTGTTT TTTGTTAACAAAGTAGCCATCAAACTGGCGGAATTTTGTTTTCTTTTAAACTAGGTTGTA GTGGATCTCTACACTAATTGGTTGGAGTTTTCCCGTTGTCGATATTAACACTACATTTGC TCAGTCTCTACTGACATATATGCTTTTTTTGGCGGATTAGCTTGATAGTTCATTTAGTTA CAAGTTTTAATACATTTGCATCATGGCTATCAAGGTAATTCAAGACGCGCGTTTCATCCT ATATGTGGCCACAGTGTCGATGCTCACGCTGAGATTCGAACCTAATGTGTTTATTATCGG CAAGCATTATTAGTCTAAAAAACCTAGTGTTGTCGTCAGATCAAGTATCTTCGGAAAGTG GAAGGTAGATATTCATATCTGTAAAAAAGTTAAACAGNCATAATGACATTGGCAGATTCC TCAGATAATAACTTTTATATCGGCCTTTACATGTTACTTAAACTCTTGTCTATCTGATAC CTTTATTAGATTCAGATTATTTCAGTCCACCCCTCTGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)