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Schistosoma mansoni
cluster # 6372 cluster # 6372       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6372#0 length = 757 sequences # 4  

consensusID : consensus_6372#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 757
fasta sequence
                              [ATTGTTTGGTCTTTGATAAGAATTATTCTGTTGCAGAAATTCAGTATTCGAGTCGTTTGAGTTGGCACCAGCTGGTTCAAAATTATTAGGATTTCTACTGTTACATGGAATAGGTTTCAAAGGCAGCTCGACAAGAGACAATGGATTCGGATGTAACACAGGTAACGGTGCTTGACGTGCATTGAATGGAGGAAAGTCCAGCGGATCTATAGCTGCACTGGGTGTAATAAAAATTTTCTCAGAAGTTATTGGGTAGCGAATAACTCCTTTAATATCCTTAGATTTACGAGACTGTCTTTGTGAAGAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGGATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGTTGATCGACAGAACCAGAGGGAATATGACTGGAGGTTAAAAAGGGAGTCAGGTTTGGCATAGTACGATTCACATTATTTAGACGAACAGGTGGAGTATTAAAGGCACAGATTTTAACGAAAGTAATTGCACCTATAATAACGGCTAAGGCTATAAGTATAACTGCCCACCAATGAATCGTTATCCATGTCGTAACTTTCTGCAACATTTGTGGACTGAATACCAAGTTTCTTAATCGAGAAAGTGGTCCCTCTGCATCAACTAAGAGACAACGCATGGAAACATCACAATAACCCCGATAGTTATCACAGGGAGCTCCAGGAGGTAATTTAATGCCGCGCCCATTACGTAAAATTTCAACAGCCAACTGA]

[+] EMBL CD160760             [ATTGTTTGGTCTTTGATAAGAATTATTCTGTTGCAGAAATTCAGTATTCGAGTCGTTTGAGTTGGCACCAGCTGGTTCAAAATTATTAGGATTTCTACTGTTACATGGAATAGGTTTCAAAGGCAGCTCGACAAGAGACAATGGATTCGGATGTAACACAGGTAACGGTGCTTGACGTGCATTGAATGGAGGAAAGTCCAGCGGATCTATAGCTGCACTGGGTGTAATAAAAATTTTCTCAGAAGTTATTGGGTAGCGAATAACTCCTTTAATATCCTTAGATTTACGAGACTGTCTTTGTGAAAAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGGATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGCTGATCGACAGAACCAGAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD188722             [     TTGGTCTTTGATAAGAATTATTCTGTTGCAGAAATTCAGTATTTGAGTCGTTTGAGTTGGCACCAGCTGGTTCAAAATTATTAGGATTTCTACTGTTACATGGAATAGGTTTCAAAGGCAGCTCGACAAGAGACAATGGATTCGGATGTAACACAGGTAACGGTGTTTGACGTGCATTGAATGGAGGAAAGTCCAGCGGATCTATAGCTGCACTGGGTGTAATAAAAATTTTCTCAGAAGTTATTGGGTAGCGAATAACTCCTTTAATATCCTTAGATTTACGAGACTGTCTTTGTGAAGAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGGATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGTTGATCGACAGAACCAGAGGGAATATGACTGGAGGTTAAAAAGGGAGTCAGGTTTGGCATAGTACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD092794             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAAGAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGGATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGTTGATCGACAGAACCAGAGGGAATATGACTGGAGGTTAAAAAGGGAGTCAGGTTTGGCATAGTACGATTCACATTATTTAGACGAACAGGTGGAGTATTAAAGGCACAGATTTTAACGAAAGTAATTGCACCTATAATAACGGCTAAGGCTATAAGTATAACTGCCCACCAATGAATCGTTATCCATGTCGTAACTTTCTGCAACATTTGTGGACTGAATACCAAGTTTCTTAATCGAGAAAGTGGTCCCTCTGCATCAACTAAGAGACAACGCATGGAAACATCACAATAACCCCGATAGTTATCACAGGGAGCTCCAGGAGGTAATTTAATGCCGCGCCCATTACGTAAAATTTCAACAGCCAACTG ]
[+] EMBL CD155827             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGAGTCAGGTTTGGCATAGTACGATTCACGTTATTTAGACGAACAGGTGGAGTATTAAAGGCACAGATTTTAACGAAAGTAATTGCACCTATAATAACGGCTAAGGCTATAAGTATAACTGCCCACCAATGAATCGTTATCCATGTCGTAACTTTCTGCAACATTTGTGGACTGAATACCAAGTTTCTTAATCGAGAAAGTGGTCCCTCTGCATCAACTAAGAGACAACGCATGGAAACATCACAATAACCCCGATAGTTATCACAGGGAGCTCCAGGAGGTAATTTAATGCCGCGCCCATTACGTAAAATTTCAACAGCCAACTGA]


>consensus_6372#0 ATTGTTTGGTCTTTGATAAGAATTATTCTGTTGCAGAAATTCAGTATTCGAGTCGTTTGA GTTGGCACCAGCTGGTTCAAAATTATTAGGATTTCTACTGTTACATGGAATAGGTTTCAA AGGCAGCTCGACAAGAGACAATGGATTCGGATGTAACACAGGTAACGGTGCTTGACGTGC ATTGAATGGAGGAAAGTCCAGCGGATCTATAGCTGCACTGGGTGTAATAAAAATTTTCTC AGAAGTTATTGGGTAGCGAATAACTCCTTTAATATCCTTAGATTTACGAGACTGTCTTTG TGAAGAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGG ATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGTTGATCGACAGAACCAGAGGGAATATGACTGGA GGTTAAAAAGGGAGTCAGGTTTGGCATAGTACGATTCACATTATTTAGACGAACAGGTGG AGTATTAAAGGCACAGATTTTAACGAAAGTAATTGCACCTATAATAACGGCTAAGGCTAT AAGTATAACTGCCCACCAATGAATCGTTATCCATGTCGTAACTTTCTGCAACATTTGTGG ACTGAATACCAAGTTTCTTAATCGAGAAAGTGGTCCCTCTGCATCAACTAAGAGACAACG CATGGAAACATCACAATAACCCCGATAGTTATCACAGGGAGCTCCAGGAGGTAATTTAAT GCCGCGCCCATTACGTAAAATTTCAACAGCCAACTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)