These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6372#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 757 fasta sequence [ATTGTTTGGTCTTTGATAAGAATTATTCTGTTGCAGAAATTCAGTATTCGAGTCGTTTGAGTTGGCACCAGCTGGTTCAAAATTATTAGGATTTCTACTGTTACATGGAATAGGTTTCAAAGGCAGCTCGACAAGAGACAATGGATTCGGATGTAACACAGGTAACGGTGCTTGACGTGCATTGAATGGAGGAAAGTCCAGCGGATCTATAGCTGCACTGGGTGTAATAAAAATTTTCTCAGAAGTTATTGGGTAGCGAATAACTCCTTTAATATCCTTAGATTTACGAGACTGTCTTTGTGAAGAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGGATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGTTGATCGACAGAACCAGAGGGAATATGACTGGAGGTTAAAAAGGGAGTCAGGTTTGGCATAGTACGATTCACATTATTTAGACGAACAGGTGGAGTATTAAAGGCACAGATTTTAACGAAAGTAATTGCACCTATAATAACGGCTAAGGCTATAAGTATAACTGCCCACCAATGAATCGTTATCCATGTCGTAACTTTCTGCAACATTTGTGGACTGAATACCAAGTTTCTTAATCGAGAAAGTGGTCCCTCTGCATCAACTAAGAGACAACGCATGGAAACATCACAATAACCCCGATAGTTATCACAGGGAGCTCCAGGAGGTAATTTAATGCCGCGCCCATTACGTAAAATTTCAACAGCCAACTGA] [+] EMBL CD160760 [ATTGTTTGGTCTTTGATAAGAATTATTCTGTTGCAGAAATTCAGTATTCGAGTCGTTTGAGTTGGCACCAGCTGGTTCAAAATTATTAGGATTTCTACTGTTACATGGAATAGGTTTCAAAGGCAGCTCGACAAGAGACAATGGATTCGGATGTAACACAGGTAACGGTGCTTGACGTGCATTGAATGGAGGAAAGTCCAGCGGATCTATAGCTGCACTGGGTGTAATAAAAATTTTCTCAGAAGTTATTGGGTAGCGAATAACTCCTTTAATATCCTTAGATTTACGAGACTGTCTTTGTGAAAAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGGATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGCTGATCGACAGAACCAGAGG ] [-] EMBL CD188722 [ TTGGTCTTTGATAAGAATTATTCTGTTGCAGAAATTCAGTATTTGAGTCGTTTGAGTTGGCACCAGCTGGTTCAAAATTATTAGGATTTCTACTGTTACATGGAATAGGTTTCAAAGGCAGCTCGACAAGAGACAATGGATTCGGATGTAACACAGGTAACGGTGTTTGACGTGCATTGAATGGAGGAAAGTCCAGCGGATCTATAGCTGCACTGGGTGTAATAAAAATTTTCTCAGAAGTTATTGGGTAGCGAATAACTCCTTTAATATCCTTAGATTTACGAGACTGTCTTTGTGAAGAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGGATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGTTGATCGACAGAACCAGAGGGAATATGACTGGAGGTTAAAAAGGGAGTCAGGTTTGGCATAGTACG ] [+] EMBL CD092794 [ GAAGAGCGTGTGAGACGACTAGTACGTAGTGGATTAGACGAACCAGTCCATTTTACAGGATGACTTGTAACAGTCCAAACAACAGGTTGATCGACAGAACCAGAGGGAATATGACTGGAGGTTAAAAAGGGAGTCAGGTTTGGCATAGTACGATTCACATTATTTAGACGAACAGGTGGAGTATTAAAGGCACAGATTTTAACGAAAGTAATTGCACCTATAATAACGGCTAAGGCTATAAGTATAACTGCCCACCAATGAATCGTTATCCATGTCGTAACTTTCTGCAACATTTGTGGACTGAATACCAAGTTTCTTAATCGAGAAAGTGGTCCCTCTGCATCAACTAAGAGACAACGCATGGAAACATCACAATAACCCCGATAGTTATCACAGGGAGCTCCAGGAGGTAATTTAATGCCGCGCCCATTACGTAAAATTTCAACAGCCAACTG ] [+] EMBL CD155827 [ GGAGTCAGGTTTGGCATAGTACGATTCACGTTATTTAGACGAACAGGTGGAGTATTAAAGGCACAGATTTTAACGAAAGTAATTGCACCTATAATAACGGCTAAGGCTATAAGTATAACTGCCCACCAATGAATCGTTATCCATGTCGTAACTTTCTGCAACATTTGTGGACTGAATACCAAGTTTCTTAATCGAGAAAGTGGTCCCTCTGCATCAACTAAGAGACAACGCATGGAAACATCACAATAACCCCGATAGTTATCACAGGGAGCTCCAGGAGGTAATTTAATGCCGCGCCCATTACGTAAAATTTCAACAGCCAACTGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||