These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6416#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 420 fasta sequence [TCAGGATTATGAGTATAATACT-AGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTTCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA] [+] EMBL CD164741 [TCAGGATTATGAGTATAATACT AGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACATGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTATGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATACTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTCCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATGAGACATATAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTT ] [-] EMBL CD164720 [ CAGGATTATGAGTAT ATACTNAGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTTCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA] [-] EMBL CD164732 [ CAGGATTATGAGTATAATACT AGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTTCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA] [-] EMBL CD164710 [ CAGGATTATGAGTATAATACT AGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTTCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||