These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6441#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 532 fasta sequence [TTTCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGTAGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACATGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAATGTATTTGTTATTAAGACAAGACTGTCAGAAATAGCTAAAGTGATCACATAA] [+] EMBL CD122347 [TTCCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAAAGTAGTAGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACATGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAATGTATTTGTTATTAAGACAAGACTGTCAGAAATAGCTAAAGTGATCACATAA] [+] EMBL CD122406 [TTTCATTATTTCTTCTTCGTCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGTAGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACATGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAATGTATTTGTTATTAAGACAAGACTGTCAGAAATAGCTAAAGTGATCACAT ] [+] EMBL CD122389 [TTTCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGTAGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACATGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAATGTATTTGT ] [+] EMBL CD122379 [TTTCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGTGGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACACGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGGAATCATCC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||