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Schistosoma mansoni
cluster # 6467 cluster # 6467       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6467#0 length = 702 sequences # 4  

consensusID : consensus_6467#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 702
fasta sequence
                              [AAATTTTTTTTATTTTGTTCAATAATATAATAATTAATTACAGGCATAGATGAAAGAACATTAAGGTATAATTGATATGTATCTTGTTTCATGTCTATTGACATTACATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAGGATGAGGATGCTGAGGATGATGATGGTGGTAGTGGTGGTATTAGGAAGAAAAGTATTACTTATATTACAGTAACTATCATAGTTACTAATTATAAACATGATAAAAATGACAAGAATAATGTTCATAAGTATAAGTACAAGATATTGTTGGTTGTCATGTATTAAATTAAAATGTAAATAATTTAAACAAATGACTAGAAATTTCATTGTAGCCATTGAATTGATTATTGAATATATAAGCAAACAATGTGAAATGACTAAAAAAAACTTTTTTTGGATTCCTTTTGGTTACAATTAAGTACAAGATGAATAACAAATTTTTGAACAACCGGGACGACAAAGTAAATGACACATTAAACCACACTTTGAATCTGCACTAGTTAAATCCTTTTTTATAGATAAACGTGAATCAGTTGATTTAGAATGACGTTTACGTTTTAAAAATGCAGCAAATGGATTACGATATGTTGTACTTAATTGTTGATTATCTGATAAACGTTTAGAACGATGTGTTCCTTGTTCTTGTTCTTCTTGTTGTTGTTCTTCTCCTGCTACT]

[+] EMBL AI977141             [AAATTTTTTTTATTTTGTTCAATAATATAATAATTAATTACAGGCATAGATGAAAGAACATTAAGGTATAATTGATATGTATCTTGTTTCATGTCTATTGACATTACATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAGGATGAGGATGCTGAGGATGATGATGGTGGTAGTGGTGGTATTAGGAAAAAAAGTATTACTTATATTACAGTAACTATCATAGTTACTAATTATAAACATGATAAAAATGACAAGAATAATGTTCATAAGTATAAGTACAAGATATTGTTGGTTGTCATGTATTAAATTAAAATGTAAATAATTTAAACAAATGACTAGAAATTTCATTGTAGCCATTGAATTGATTATTGAATATATAAGCAAACAATGTGAAATGACTAAAAAAAACTTTTTTTGGATTCCTTTGGGTTACAATTAAGTACAAGATGAATAACAAATTTTTGAACAAACCGGACGACAAAGTAAATGACACATTAAACCACACTTTGAATCTGCAC                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI977711             [AAATTTTTTTTATTTTGTTCAATAATATAATAATTAATTACTGGCATAGATGAAAGAACATTAAGGTATAATTGATATGTATCTTGTTTAATGTCTATTGACATTACATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAGGATGAGGATGCTGAGGATGATGATGGTGGTATCGGCGGTATTAGGAAGAAAAGTATTACTTATATTACAGTAACTATCATAGTTACTAATTATAAACATGATAAAAATGACACGAATAATGTTCATAAGTATAAGTACAAGATATTGATGGTTGTCATGTATTAAATTAAAATGTAAATAATTGAAACAAATGACTAGAAATTTCATTGTAGCCATTGAATTGATTATTGAATATATAAGCAAACAATGTGAAATGACTAAAAAAAACTTTTTTTGGATTCCTTTTGGATACAATTAAGTGCAAGATGAATAACAATTTTTTGAACAACCGGGACGACAATGTAAATGA                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD065367             [                                                                                                                                                                                  TGGTGGTATTAGGAAGAAAAGTATTACTTATATTACAGTAACTATCATAGTTACTAATTATAAACATGATAAAAATGACAAGAATAATGTTCATAAGTATAAGTACAAGATATTGTTGGTTGTCATGTATTAAATTAAAATGTAAATAATTTAAACAAATGACTAGAAATTTCATTGTAGCCATTGAATTGATTATTGAATATATAAGCAAACAATGTGAAATGACTAAAGAAAACTTTTTTTGGATTCCTTTTGGTTACAATT                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD069739             [                                                                                                                                                                                                                                            TATAAACATGATAAAAATGACAAGAATAATGTTCATAAGTATAAGTACAAGATATTGTTGGTTGTCATGTATTAAATTAAAATGTAAATAATTTAAACAAATGACTAGAAATTTCATTGTAGCCATTGAATTGATTATTGAATATATAAGCAAACAATGTGAAATGACT AAAAAAACTTTTTTTGGATTCCTTTTGGTTACAATTAAGTACAAGATGAATAACAAATTTTTGAACAACCGGGACGACAAAGTAAATGACACATTAAACCACACTTTGAATCTGCACTAGTTAAATCCTTTTTTATAGATAAACGTGAATCAGTTGATTTAGAATGACGTTTACGTTTTAAAAATGCAGCAAATGGATTACGATATGTTGTACTTAATTGTTGATTATCTGATAAACGTTTAGAACGATGTGTTCCTTGTTCTTGTTCTTCTTGTTGTTGTTCTTCTCCTGCTACT]


>consensus_6467#0 AAATTTTTTTTATTTTGTTCAATAATATAATAATTAATTACAGGCATAGATGAAAGAACA TTAAGGTATAATTGATATGTATCTTGTTTCATGTCTATTGACATTACATTAATAATAATA ATAATAATAATAATAATAATAATGAGGATGAGGATGCTGAGGATGATGATGGTGGTAGTG GTGGTATTAGGAAGAAAAGTATTACTTATATTACAGTAACTATCATAGTTACTAATTATA AACATGATAAAAATGACAAGAATAATGTTCATAAGTATAAGTACAAGATATTGTTGGTTG TCATGTATTAAATTAAAATGTAAATAATTTAAACAAATGACTAGAAATTTCATTGTAGCC ATTGAATTGATTATTGAATATATAAGCAAACAATGTGAAATGACTAAAAAAAACTTTTTT TGGATTCCTTTTGGTTACAATTAAGTACAAGATGAATAACAAATTTTTGAACAACCGGGA CGACAAAGTAAATGACACATTAAACCACACTTTGAATCTGCACTAGTTAAATCCTTTTTT ATAGATAAACGTGAATCAGTTGATTTAGAATGACGTTTACGTTTTAAAAATGCAGCAAAT GGATTACGATATGTTGTACTTAATTGTTGATTATCTGATAAACGTTTAGAACGATGTGTT CCTTGTTCTTGTTCTTCTTGTTGTTGTTCTTCTCCTGCTACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)