Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6496 cluster # 6496       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6496#0 length = 1072 sequences # 4  
consensusID : consensus_6496#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1072
fasta sequence 
                              [TTGCTGACTAAGACTCTGTCTACTTTGTGCACGTGAAAATAATGGTGATGATGGCATAATTGTGAAATCCGGTTCAATACATTCTTCTTCAGTATCTGTAATTGGATTATCTCTCATCATATCTGGATGTTCAAGACCAAGTCGATTAGCAGAGATATGCTGTTGTCTACTCAAAGAAGAATTATGATACTCTGGACCAGATGATATAGATGATGCCAATTCTGCATTCATTGGCAATTCATCAGTATTTTCATGCTCCCATGATTCTACACATGTAGTCACCTGACGTAATGCTTCAAATATATTTAAATAATGTTGATGACGAGCAACATGCGCTGGTGTCCAACCATACTTGTTACGCATATTTGGATTAGCGCCACTTTCTAATAAAATGTAAATGACTGTCGAATGACCTTGTTGTGCAGCTAAATGTAAAGCATTTGATCCCATACATGTTATAGCATTCACATCAGCACCTTTGCCAAGTAAAAATCGAACCATATTTACTTGACCAAAATGGCAAGCTGTATGTAAAGGAGTATATCCTGCTTTCGTTTTCAAATCTAACTCAGAACCAGCGTTAAATAATAATTCTGCAGCTTTAACACTATCCTCTTGTGCTGCTAAATGCATTGCTGTAAGGCCATTTTTTGCTAAAGCGTTTACTTTAGATCCAGAATCAATCAGTAATTTAGTCATTTTCTCATTTCCATCTTGACAAGCTAAATGTAACGGAGTGAAACCGTTACGTGATTGTATACTACAACAACCACCATCGACACCGTAACCGCCATTAGCATTAGTATTTTTCTTATTCTTATTATTACTGTCAACAGTAGCTTCAATTAATAATTTACCAATATCTACTAAATGTTTTTCTGCGGCAATATGTAATGGAATAAAACCATTTTTAGCTTGTGAAACTGGAGATGCTTTATGTTCAAGTAATAATTGAACCATAGGTAAACATCCATAATGTGTAGCCAAATGTAATGGTGTTAAACCATTACGTCCAACTGCATTCATATCAGCACCGGATAAAAGTAAATATTTAGCTGTTTCTAAATGCGAA]

[+] EMBL CD161245             [TTGCTGACTAAGACTCTGTCTACTTTGTGCACGTGAAAATAATGGTGATGATGGCATAATTGTGAAATCCGGTTCAATACATTCTTCTTCAGTATCTGTAATTGGATTATCTCTCATCATATCTGGATGTTCAAGACCAAGTCGATTAGCAGAGATATGCTGTTGTCTACTCAAAGAAGAATTATGATACTCTGGACCAGATGATATAGATGATGCCAATTCTGCATTCATTGGCAATTCATCAGTATTTTCATGCTCCCATGATTCTACACATGTAGTCACCTGACGTAATGCTTCAAATATATTTAAATAATGTTGATGACGAGCAACATGCGCTGGTGTCCAACCATACTTGTTACGCATATTTGGATTAGCGCCACTTTCTAATAAAATGTAAATGACTGTCGAATGACCTTGTTGTGCAGCTAAATGTAAAGCATTTGATCCCATACATGTTATAGCATTCACATCAGCACCTTTGCCAAGTAAAAATCGAACCATATTTACTTGACCAAAATGGCAAGCTGTATGTAAAGGAGTATATCCTGCTTTCGTTTTCAAATCTAACTCAGAACCAGCGTTAAATAATAATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD118079             [                                                                                                                                                                                    ATTATGATACTCTGGACCAGATGATATAGATGATGCCAATTCTGCATTCATTGGCAATTCATCAGTATTTTCATGCTCCCATGATTCTACACATGTAGTCACCTGACGTAATGCTTCAAATATATTTAAATAATGTTGATGACGAGCAACATGCGCTGGTGTCCAACCATACTTGTTACGCATATTTGGATTAGCGCCACTTTCTAATAAAATGTAAATGACTGTCGAATGACCTTGTTGTGCAGCTAAATGTAAAGCATTTGATCCCATACATGTTATAGCATTCACATCAGCACCTTTGCCAAGTAAAAATCGAACCATATTTACTTGACCAAAATGGCAAGCTGTATGTAAAGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD118234             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACTTTCTAATAAAATGTAAATGACTGTCGAATGACCTTGTTGTGCAGCTAAATGTAAAGCATTTGATCCCATACATGTTATAGCATTCACATCAGCACCTTTGCCAAGTAAAAATCGAACCATATTTACTTGACCAAAATGGCAAGCTGTATGTAAAGGAGTATATCCTGCTTTCGTTTTCAAATCTAACTCAGAACCAGCGTTAAATAATAATTCTGCAGCTTTAACACTATCCTCTTGTGCTGCTAAATGCATTGCTGTAAGGCCATTTTTTGCTAAAGCGTTTACTTTAGATCCAGAATCAATCAGTAATTTAGTCATTTTCTCATTTCCATCTTGACAAGCTAAATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD150747             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atctACCAGCGTTAAATAATAATTCTGCAGCTTTAACACTATCCTCTTGTGCTGCTAAATGCATTGCTGTAAGGCCATTTTTTGCTAAAGCGTTTACTATAGATCCAGAATCAATCAGTAATTTAGTCATTTTCTCATTTCTANCTTGTCAAGCTAAATGTAACGGAGTGAAACCGTTACGTGATTGTATACTACAACAACCACCATCGACACCGTAACCGCCATTAGCATTAGTATTTTTCTTATTCTTATTATTACTGTCAACAGTAGCTTCAATTAATAATTTACCAATATCTACTAAATGTTTTTCTGCGGCAATATGTAATGGAATAAAACCATTTTTAGCTTGTGAAACTGGAGATGCTTTATGTTCAAGTAATAATTGAACCATAGGTAAACATCCATAATGTGTAGCCAAATGTAATGGTGTTAAACCATTACGTCCAACTGCATTCATATCAGCACCGGATAAAAGTAAATATTTAGCTGTTTCTAAATGCGAA]




>consensus_6496#0
TTGCTGACTAAGACTCTGTCTACTTTGTGCACGTGAAAATAATGGTGATGATGGCATAAT
TGTGAAATCCGGTTCAATACATTCTTCTTCAGTATCTGTAATTGGATTATCTCTCATCAT
ATCTGGATGTTCAAGACCAAGTCGATTAGCAGAGATATGCTGTTGTCTACTCAAAGAAGA
ATTATGATACTCTGGACCAGATGATATAGATGATGCCAATTCTGCATTCATTGGCAATTC
ATCAGTATTTTCATGCTCCCATGATTCTACACATGTAGTCACCTGACGTAATGCTTCAAA
TATATTTAAATAATGTTGATGACGAGCAACATGCGCTGGTGTCCAACCATACTTGTTACG
CATATTTGGATTAGCGCCACTTTCTAATAAAATGTAAATGACTGTCGAATGACCTTGTTG
TGCAGCTAAATGTAAAGCATTTGATCCCATACATGTTATAGCATTCACATCAGCACCTTT
GCCAAGTAAAAATCGAACCATATTTACTTGACCAAAATGGCAAGCTGTATGTAAAGGAGT
ATATCCTGCTTTCGTTTTCAAATCTAACTCAGAACCAGCGTTAAATAATAATTCTGCAGC
TTTAACACTATCCTCTTGTGCTGCTAAATGCATTGCTGTAAGGCCATTTTTTGCTAAAGC
GTTTACTTTAGATCCAGAATCAATCAGTAATTTAGTCATTTTCTCATTTCCATCTTGACA
AGCTAAATGTAACGGAGTGAAACCGTTACGTGATTGTATACTACAACAACCACCATCGAC
ACCGTAACCGCCATTAGCATTAGTATTTTTCTTATTCTTATTATTACTGTCAACAGTAGC
TTCAATTAATAATTTACCAATATCTACTAAATGTTTTTCTGCGGCAATATGTAATGGAAT
AAAACCATTTTTAGCTTGTGAAACTGGAGATGCTTTATGTTCAAGTAATAATTGAACCAT
AGGTAAACATCCATAATGTGTAGCCAAATGTAATGGTGTTAAACCATTACGTCCAACTGC
ATTCATATCAGCACCGGATAAAAGTAAATATTTAGCTGTTTCTAAATGCGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)