These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6551#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 677 fasta sequence [TGGTGAAACAGAAGTAGTTGCTTTATTAGAGACAGAAGGGGAATAAGAAACAGGATTATTATTTGCATGTTCAATTCTGATAGGTCTAGGTGAATTAGTTTGTTTTGATGAAATTGAAGAAACGGGACTACTTGTATTTTCACTTCTGATAGATCTAGGTGAATTAGTCTGCTTTGGTGTAGACAAAGAAGATGATGAAACAGGATTATTTTTCGGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGGTGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTGATTCACGTTGTCTTAACTGTACTTGTAGACGACCCCCTACTACTTTACGACCTTCTTTCAAATCCCCAACATGAGTTACTGTTGCCGATTGGACAAGTCCAGTAAGAGGGATTTCAGTTATACCTAGTACACCCCAGCTTCGAAATATACCACGATTGTAATATACTGTTGCTTTTAGACAACGATTATTCTGAACAAATCGTCTATATGAATGACTTTTTGTATTTACGCGAAATTCTTTAACTGATTGACTATATATTGGTTCACTATTTGATTTAACTACATTTGTAGATAACTTCATTGGTGGATTAGCATTATTTAAACTGAATTCAACTTCAACATAAGTATCAATATTTGAAT] [+] EMBL CD090067 [TGGTGAAACAGAAGTAGTTGCTTTATTAGAGACAGAAGGGGAATAAGAAACAGGATTATTATTTGCATGTTCAATTCTGATAGGTCTAGGTGAATTAGTTTGTTTTGATGAAATTGAAGAAACGGGACTACTTGTATTTTCACTTCTGATAGATCTAGGTGAATTAGTCTGCTTTGGTGTAGACAAAGAAGATGATGAAACAGGATTATTTTTCGGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGGTGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTG ] [+] EMBL CD090070 [TGGTGAAACAGAAGTAGTTGCTTTATTAGAGACAGAAGGGGAATAAGAAACAGGATTATTATTTGCATGTTCAATTCTGATAGGTCTAGGTGAATTAGTTTGTTTTGATGAAATTGAAGAAACAGGACTACTTGTATTTTCACTTCTGATAGATCTAGGTGAATTAGTCTGCTTTGGTGTAGACAAAGAAGATGATGAAACAGGATTATTTTTCGGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGGTGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTG ] [+] EMBL CD066733 [ GGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGGTGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTGATTCACGTTGTCTTAACTGTACTTGTAGACGACCCCCTACTACTTTACGACCTTCTTTCAAATCCCCAACATGAGTTACTGTTGCCGATTGGACAAGTCCAGTAAGAGGGATTTCAGTTATACCTAGTACACCCCAGCTTCGAAATATACCACGATTGTAATATACTGTTGCTTTTAGACAACGATTATTCTGAACAAATCGTCTATATGAATGACTTTTTGTATTTACGCGAAATTCTTTAACTGATTGACTATATATTGGTTCACTATTTGATTTAACTACATTTGTAGATAACTTCATTGGTGGATTAGCATTAT ] [-] EMBL CD148322 [ TTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTGATTCACGTTGTCTTAACTGTACTTGTAGACGACCCCCTACTACTTTACGACCTTCTTTCAAATTCCCAACATGAGTTACTGTTGCCGATTGGACAAGTCCAGTAAGAGGGATTTCAGTTATACCTAGTACACCCCAGCTTCGAAATATACCACGATTGTAATATACTGTTGCTTTTAGACAACGATTATTCTGAACAAATCGTCTATATGAATGACTTTTTGTATTTACACGAAATTCTTTAACTGATTGACTATATATTGGTTCACCATTTGATTTAACTACATTTGTAGATAACTTCATTGGTGGATTAGCATTATTTAAACTGAATTCAACTTCAACATAAGTATCAATATTTGAAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||