These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6582#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 808 fasta sequence [TACAATACACTATCCTACCTTATCGTTAATTATTGCAACTGAAAGAAAAATAGGCATAAACATCTTTTTAAAAATCGTACACATGGCATAATAAACTCTAACAGTATTAATAATAGTAATAATGAAAATAAAATGTAAAAATAGTATAAGCACAAGAGTGAATCATTGTTGGTCAACTGAATCGCCCATCTACTCGCACACACACACAAATAAAAGCACATTTGATGAAAGGCTCTGGATAATACCACAAACAAGAACAATCATAACAACAATAATGATGACTAAAAGAGAATAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAG-TTACATGTTCTGTTG-TTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCTTTTTTCTTTAAGTAAAAAGAGTGATACATATTAATGGGAAACAATAATTATTATTCAAAGAGGGTAAAGATCTACGAGATGTGAATATAAATTAATTTGTTAATACACTATGATAAATATGATAGAATTATTTTGATGTAAAAGTTTAAGGAGAATGAAAATTAAAACTGGTGATAGGTGATGAAGTAGTGAATCGTACGAAGGAAACAAAGAAAGAGATGAACCTGAGTAATAAAAGACAAGTGAACACATAACAACATGACACAATCATTAAATTATAATACACNCGACATCTTGAGAAAATAATATGAATA] [-] EMBL AI977209 [TACAATACACTATCCTACCTTATCGTTAATTATTGCAACTGAAAGAAAAATAGGCATAAACATCTTTTTAAAAATCGTACACATGGCATAATAAACTCTAACAGTATTAATAATAGTAATAATGAAAATAAAATGTAAAAATAGTATAAGCACAAGAGTGAATCATTGTTGGTCAACTGAATCGCCCATCTACTCGCACACACACACAAATAAAAGCACATTTGATGAAAGGCTCTGGATAATACCACAAACAAGAACAATCATAACAACAATAATGATGACTAAAAGAGAATAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAG TTACATGTTCTGTTG TTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCTTTTT ] [-] EMBL CD168650 [ TTATTGCAACTGAAAGAAAAATAGGCATAAACATCTTTTTAAAAATCGTACACATGGCATAATAAACTCTAACAGTATTAATAATAGTAATAATGAAAATAAAATGTAAAAATAGTATAAGCACAAGACTGAATCATTGTTGGTCAACTGAATCGCCCATCTACTCGCACACACACACAAATAAAAGCACATTTGATGAAAGGCTCTGGATAATACCACAAACAAGAACAATCATAACAACAATAATGATGA TTAAAGAGAATAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAG TTACATGTTCTGTTG TTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCT ] [+] EMBL CD160512 [ AACAATCATATCAACAATAATGATGACTAAAAGAGAATAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAG TTACATGTTCTGTTG TTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCTTTTTTCTTTAAGTAAAAAGAGTGATACATATTAATGGGAAACAATAATTATTATTCAAAGAGGGTAAAGATCTACGAGATGTGAATATAAATTAATTTGTTAATACACTATGATAAATATGATAGAATTATTTTGATGTAAAAGTTTAAGGAGAATGAAAATTAAAACTGGTGATAGGTGATGAAGTAGTGAATCGTACGAAGGAAACAAAGAAAGAGATGAACCTGAGTAATAAAAGACAAGTGAACACATAACAACATGACACAATCATTAAATTATAATACACNCGACATCTTGAGAAAATAATATGAATA] [-] EMBL CD068330 [ TAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTGTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAGTTTACATGTTCTGTTGTTTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAGAAGTGTTACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCTTGTTTCTTTAAGTAAAAAGAGTGATACATATTAATGGGAAACAATAATTATTATTCAAAGAGGGTAAAGATCTACGAGATGTGAATATAAATTAATTTGTTAATACACTATGATTAATATGATAGAATTATTTTGATGTAAAAGTTTAAGGAGAATGAAAATTAAAACTGGTGATAGGTGATGAAGTAGTGAct ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||