These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6634#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 806 fasta sequence [GAGGGTCTCAAGGGAACAATTCTCTGTTGCTAACACATGTTATGTCCCAGACAGATACGGGGAGTCGTGGTCGTACAATGGATTTAAATTACGCTCAGTTAGATTTAAACAAGTCAGATTCTGATGATGAATTGGAGGTTAGTTTAGCCTATAATGAAAAAGACGGAATACGAGACCAGCAAGATGATATCAGGGCATCTGCACAACAGAACATAAGTACAAACCTAGATCTCATTTGTGAATCGTTATCGAATGCTAAGAACCATATGAACTGTTTTTCAGATAATTTGTCTAACAAGAATACGATCCCCTCCAGTATGTTACACTGTGATCTCACCGAATGCCAAACAAGATCTGTGAATGAAAATATGAGAGAATTAATTGGTTTGCACCCTGAAATGACTGAAGCAACAGCCACGCTTTTACTCACTTTAACGGAGAACCGTCTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCACTTTATGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTTTGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTATACTTTATTATTTTCGATTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGATCACCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACAACAATGTCTACCTAATCTTTTTGTATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTAACAACGAATAAATGTATGATATTTTACTGATAGTTTGAAATATATTCGAT] [-] EMBL BG930740 [GAGGGTCTCAAGGGAACAATTCTCTGTTGCTAACACATGTTATGTCCCAGACAGATACGGGGAGTCGTGGTCGTACAATGGATTTAAATTACGCTCAGTTAGATTTAAACAAGTCAGATTCTGATGATGAATTGGAGGTTAGTTTAGCCTATAATGAAAAAGACGGAATACGAGACCAGCAAGATGATATCAGGGCATCTGCACAACAGAACATAAGTACAAACCTAGATCTCATTTGTGAATCGTTATCGAATGCTAAGAACCATATGAACTGTTTTTCAGATAATTTGTCTAACAAGAATACGACCCCCc ] [+] EMBL CD078595 [ GGCATCTGCACAACAGAACATAAGTACAAACCTAGATCTCATTTGTGAATCGTTATCGAATGCTAAGAACCATATGAACTGTTTTTCAGATAATTTGTCTAACAAGAATACGATCCCCTCCAGTATGTTACACTGTGATCTCACCGAATGCCAAACAAGATCTGTGAATGAAAATATGAGAGAATTAATTGGTTTGCACCCTGAAATGACTGAAGCAACAGCCACGCTTTTACTCACTTTAACGGAGAACCGTCTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCACTTTATGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTTTGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTATACTTTATTATTTTCGATTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGATCACCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACAACAATGTCTACCTAATCTTTTTGTATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTAACAACGAATAAATGTATGATATTTTACTGATAGTTTGAAATATATTCGA ] [-] EMBL CD073058 [ AGATAATTTGTCTAACAAGAATACGATCCCCTCCAGTATGTTACACTGTGATCTCACCGAATGCCAAACAAGATCTGTGAATGAAAATATGAGAGAATTAATTGGTTTGCACCCTGAAATGACTGAAGCAACAGCCACGCTTTTACTCACTTTAACGGAGAACCGTCTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCACTTTATGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTTTGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTATACTTTATTATTTTCGATTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGATCACCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACAACAATGTCTACCTAATCTTTTTGTATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTAACAACGAATAAATGTATGATATTTTACTGATAGTTTGAAATATATTCGAT] [-] EMBL CD073325 [ acCCGTTTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCCCTTTATGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTTTGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTAAACTTTATTATTTTCGATTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGATCCCCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACACCAATGTCTCCCTAATCTTTTTGTATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTACCAACGAATAAATGTATGATATTTTACTGATAGTTTGAAAAATATTCGAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||