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Schistosoma mansoni
cluster # 6636 cluster # 6636       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6636#0 length = 672 sequences # 4  

consensusID : consensus_6636#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 672
fasta sequence
                              [GTTACGGAAGTGGGTTTATCGTAATATCGGTCACTTTGCTTCCTTCTGAGTGTTATGTATATAACAACAACTAATATTAGATGTTGTCTTTGA-AACCAATTTTATGCTGAATATTCGATCTGCTATCAATAATTCCGAGTGATTATATAACTCTTCTATTGTAGGCTATATGGTGTGAGCACTAGTATAAATCTTCCTCTTAAACTCCTTAATGATTTTTTTGCTTAACTGGTTTATATTATGCTGAAATTTTATCCTGCATTTTGCACAGCTGATGATTTCTATTTAGATGAAACTAATAACTCGACTCTGTGATGAACCATCCGCTTGATTTCATTTCAGTTTGTTGGTTTCTAAATACCATACTACTATGACTGCGAAGAAAAATAGACATGTACTAAATTGGACTCCCGAAGATGTCGTCAAATGGTTACATAAATATGCCAGTCCAGTCGGTGCAAAATATTCTGAACTGTTTGAAACAAACAGGATTAGTGGGATGTGTTTACGCCTGATGACGGATGAGTGGCTTCTTCGGTTAGGAGTAGTCAATCAAAACGATAGGTCAGCTCTTATGAGTCATATATATCGAATGCGTCTGAAGTATGATTCTTCAGATTTGTCGGATATGCTTAAAAACAACTAACATTTGTACTTTGTGTAAATAAACAT]

[+] EMBL CD082480             [GTTACGGAAGTGGGTTTATCGTAATATCGGTCACTTTGCTTCCTTCTGAGTGTTATGTATATAACAACAACTAATATTAGATGTTGTCTTTGA AACCAATTTTATGCTGAATATTCGATCTGCTATCAATAATTCCGAGTGATTATATAACTCTTCTATTGTAGGCTATATGGTGTGAGCACTAGTATAAATCTTCCTCTTAAACTCCTTAATGATTTTTTTGCTTAACTGGTTTATATTATGCTGAAATTTTATCCTGCATTTTGCACAGCTGATGATTTCTATTTAGATGAAACTAATAACTCGACTCTGTGATGAACCATCCGCTTGATTTCATTTCAGTTTGTTGGTTTCTAAATACCATACTACTATGACTGCGAAGAAAAATAGACATGTACTAAATTGGACTCCCGAAGATGTCGTCAAATGGTTACATAAATATGCCAGTCCAGTCGGTGCAAAATATTCTGAACTGTTTGAAACAAACAGGATTAGTGGGATGTGTTTACGCCTGATGACGGATGAGTGGCTTCTTCGGTTAGGAGTAGTCAATCAAAACGATAGGTCAGCTCTTATGAGTCATATATATCGAATGCGTCTGAAGTATGATTCTTCAGATTTGTCGGATATGCTTAANAAC ACTAACATTTGTACTTTGTGT AATAAca  ]
[+] EMBL CD078677             [    CGGAAGTGGGTTTATCGTAATATCGGTCACTTTGCTTCCTTCTGAGTGTTATGTATATAACAACAACTAATATTAGATGTTGTCTTTGAGAACCAATTTTATGCTGAATATTCGATCTGCTATCAATAATTCCGAGTGATTATATAACTCTTCTATTGTAGGCTATATGGTGTGAGCACTAGTATAAATCTTCCTCTTAAACTCCTTAATGATTTTTTTGCTTAACTGGTTTATATTATGCTGAAATTTTATCCTGCATTTTGCACAGCTGATGATTTCTATTTAGATGAAACTAATAACTCGACTCTGTGATGAACCATCCGCTTGATTTCATTTCAGTTTGTTGGTTTCTAAATACCATACTACTATGACTGCGAAGAAAAATAGACATGTACTAAATTGGACTCCCGAAGATGTCGTCAAATGGTTACATAAATATGCCAGTCCAGTCGGTGCAAAATATTCTGAACTGTTTGAAACAAACAGGATTAGTGGGATGTGTTTACGCCTGATGACGGATGAGTGGCTTCTTCGGTTAGGAGTAGTCAATCAAAACGATAGGTCAGCTCTTATGAGTCATATATATCGAATGCGTCTGAAGTATGATTCTTCAGATTTGT                                                 ]
[-] EMBL CD076078             [                                                  TGTTATGTATATAACAACAACTAATATTAGATGTTGTCTTTGA AACCAATTTTATGCTGAATATTCGATCTGCTATCAATAATTCCGAGTGATTATATAACTCTTCTATTGTAGGCTATATGGTGTGAGCACTAGTATAAATCTTCCTCTTAAACTCCTTAATGATTTTTTTGCTTAACTGGTTTATATTATGCTGAAATTTTATCCTGCATTTTGCACAGCTGATGATTTCTATTTAGATGAAACTAATAACTCGACTCTGTGATGAACCATCCGCTTGATTTCATTTCAGTTTGTTGGTTTCTAAATACCATACTACTATGACTGCGAAGAAAAATAGACATGTACTAAATTGGACTCCCGAAGATGTCGTCAAATGGTTACATAAATATGCCAGTCCAGTCGGTGCAAAATATTCTGAACTGTTTGAAACAAACAGGATTAGTGGGATGTGTTTACGCCTGATGACGGATGAGTGGCTTCTTCGGTTAGGAGTAGTCAATCAAAACGATAGGTCAGCTCTTATGAGTCATATATATCGAATGCGTCTGAAGTATGATTCTTCAGATTTGTCGGATATGCTTAAAAACAACTAACATTTGTACTTTGTGTAAATAAACAT]
[-] EMBL CD073140             [                                                                               GATGTTGTCTTTGAGAACCAATTTTATGCTGAATATTCGATCTGCTATCAATAATTCCGAGTGATTATATAACTCTTCTATTGTAGGCTATATGGTGTGAGCACTAGTATAAATCTTCCTCTTAAACTCCTTAATGATTTTTTTGCTTAACTGGTTTATATTATGCTGAAATTTTATCCTGCATTTTGCACAGCTGATGATTTCTATTTAGATGAAACTAATAACTCGACTCTGTGATGAACCATCCGCTTGATTTCATTTCAGTTTGTTGGTTTCTAAATACCATACTACTATGACTGCGAAGAAAAATAGACATGTACTAAATTGGACTCCCGAAGATGTCGTCAAATGGTTACATAAATATGCCAGTCCAGTCGGTGCAAAATATTCTGAACTGTTTGAAACAAACAGGATTAGTGGGATGTGTTTACGCCTGATGACGGATGAGTGGCTTCTTCGGTTAGGAGTAGTCAATCAAAACGATAGGTCAGCTCTTATGAGTCATATATATCGAATGCGTCTGAAGTATGATTCTTCAGATTTGTCGGATATGCTTAAAAACAACTAACATTTGTACTTTGTGTAAATAAACAT]


>consensus_6636#0 GTTACGGAAGTGGGTTTATCGTAATATCGGTCACTTTGCTTCCTTCTGAGTGTTATGTAT ATAACAACAACTAATATTAGATGTTGTCTTTGAAACCAATTTTATGCTGAATATTCGATC TGCTATCAATAATTCCGAGTGATTATATAACTCTTCTATTGTAGGCTATATGGTGTGAGC ACTAGTATAAATCTTCCTCTTAAACTCCTTAATGATTTTTTTGCTTAACTGGTTTATATT ATGCTGAAATTTTATCCTGCATTTTGCACAGCTGATGATTTCTATTTAGATGAAACTAAT AACTCGACTCTGTGATGAACCATCCGCTTGATTTCATTTCAGTTTGTTGGTTTCTAAATA CCATACTACTATGACTGCGAAGAAAAATAGACATGTACTAAATTGGACTCCCGAAGATGT CGTCAAATGGTTACATAAATATGCCAGTCCAGTCGGTGCAAAATATTCTGAACTGTTTGA AACAAACAGGATTAGTGGGATGTGTTTACGCCTGATGACGGATGAGTGGCTTCTTCGGTT AGGAGTAGTCAATCAAAACGATAGGTCAGCTCTTATGAGTCATATATATCGAATGCGTCT GAAGTATGATTCTTCAGATTTGTCGGATATGCTTAAAAACAACTAACATTTGTACTTTGT GTAAATAAACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)