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Schistosoma mansoni
cluster # 6703 cluster # 6703       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6703#0 length = 671 sequences # 4  

consensusID : consensus_6703#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 671
fasta sequence
                              [TATGCTCAAAAACTTGGAAAACTACGTCTAAATTCGTCCTATGTTATATGGAGGTTTAATACTGACGAGACTCAACCAGCAAAGAGTCTAGTTGAAAAACCTTTACTTCGCGGCCTTTTAAAACATGGAGATTTCGGAACTATTGCACTGGCTGATAACAGAGTTATTGGCTGTGACAAAAGCGTAATCAGTTTGTCTAAAAGTCTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTACAATCGTAGCATGCATCCAGCAACAGCTGCGTATAGACTTTACCTTGACAGAGGACATAAAACGACTGAGTTCAATGTACCCACTTGATTGGGATCTCTCTGCACGCAATTTTCATCTGCTAGCAGGTCAAGGGGTTATGGCAACAGCCACTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTCTTGTGAAAATCAGAAAACCGTCTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTTGTTCCACCGATTTCGTGGTCTTTAGACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTTTTGTAATTCGGTCATTCCAACAAGCTAACTGATTAATTTTAATGTACTTAACAAATTCCATCTCAATCAGTAACTGTCTTACACATATTTTTTTTCAACTGTGAGATGGTTTGTTATTTTTATACTTTCAATAAATGT]

[+] EMBL CD080332             [TATGCTCAAAAACTTGGAAAACTACGTCTAAATTCGTCCTATGTTATATGGAGGTTTAATACTGACGAGACTCAACCAGCAAAGAGTCTAGTTGAAAAACCTTTACTTCGCGGCCTTTTAAAACATGGAGATTTCGGAACTATTGCACTGGCTGATAACAGAGTTATTGGCTGTGACAAAAGCGTAATCAGTTTGTCTAAAAGTCTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTACAATCGTAGCATGCATCCAGCAACAGCTGCGTATAGACTTTACCTTGACAGAGGACATAAAACGACTGAGTTCAATGTACCCACTTGATTGGGATCTCTCTGCACGCAATTTTCATCTGCTAGCAGGTCAAGGGGTTATGGCAACAGCCACTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTCTTGTGAAAATCAGAAAACCGTCTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTTGTTCCACCGATTTCGTGGTCTTTAGACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTNTTGTAATTCGGTCATTCCAAACAGCTAACTGATTAATTNTAATGTACTTAACANATTCCATCTCAATCAGTAACTGTCTTACACATATTNTTTTTCAACTGTGAGATGGTTTGNTATTTTTATACTTTC ATAANTG ]
[+] EMBL CD095553             [                                 TCGTCCTATGTTATATGGAGGTTTAATACTGACGAGACTCAACCAGCAAAGAGTCTAGTTGAAAAACCTTTACTTCGCGGCCTTTTAAAACATGGAGATTTCGGAACTATTGCACTGGCTGATAACAGAGTTATTGGCTGTGACAAAAGCGTAATCAGTTTGTCTAAAAGTCTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD074252             [                                                                                                                                                                             TGACAAAAGCGTAATCAGTTTGTTTAAAAGTTTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTACAATTGTAGCATGCATCCAGCAACAGCTGGGTATAGACTTTACCTTGACAGAGGACATAAAACGACTGAGTTCAATGTACCCACTTGATTGGGATCTCTTTGCACGCAATTTTCATTTGCTAGCAGGTCAAGGGGTTATGGCAACAGCCCCTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTTTTGTGAAAATCAGAAAACCGTTTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTTGTTCCCCCGATTTCGTGGTTTTTAAACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTTTTGTAATTCGGTCATTCCAACAAGGTAACTGATTAATTTTAATGTACTTAACAAATTCCATTTCAATCAGTAACTGTTTTACACATATTTTTTTTCAACTGTGAGATGGGTTGTTATTTTTAAACTTACAATAAATGT]
[+] EMBL CD145727             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAACAGCCACTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTCTTGTGAAAATCAGAAAACCGTCTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTTGTTCCACCGATTTCGTGGTCTTTAGACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTTTTGTAATTCGGTCATTCCAACAAGCTAACTGATTAATTTTAATGTACTTAACAAATTCCATCTCAATCAGTAACTGTCTTACACATATTTTTTTTCAACTGTGAGATGGTTTGTTATTTTTATACTTTCAATAAATG ]


>consensus_6703#0 TATGCTCAAAAACTTGGAAAACTACGTCTAAATTCGTCCTATGTTATATGGAGGTTTAAT ACTGACGAGACTCAACCAGCAAAGAGTCTAGTTGAAAAACCTTTACTTCGCGGCCTTTTA AAACATGGAGATTTCGGAACTATTGCACTGGCTGATAACAGAGTTATTGGCTGTGACAAA AGCGTAATCAGTTTGTCTAAAAGTCTCACATCAGCCCTCGCTTCAAGTACAATCGTAGCA TGCATCCAGCAACAGCTGCGTATAGACTTTACCTTGACAGAGGACATAAAACGACTGAGT TCAATGTACCCACTTGATTGGGATCTCTCTGCACGCAATTTTCATCTGCTAGCAGGTCAA GGGGTTATGGCAACAGCCACTATACATGTAGCTCCGAACGGTCCAATCAGTCTTGTGAAA ATCAGAAAACCGTCTGATCCAGATCATCCCGAACCACATTTGGCAGAACCATGTAATTTT GTTCCACCGATTTCGTGGTCTTTAGACGAATGGTTGATGGAAATTAATGACTTTTGTAAT TCGGTCATTCCAACAAGCTAACTGATTAATTTTAATGTACTTAACAAATTCCATCTCAAT CAGTAACTGTCTTACACATATTTTTTTTCAACTGTGAGATGGTTTGTTATTTTTATACTT TCAATAAATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)