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Schistosoma mansoni
cluster # 6741 cluster # 6741       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6741#0 length = 1048 sequences # 4  

consensusID : consensus_6741#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1048
fasta sequence
                              [TAATTTCTATATTATAATTATTAATAAAAAAATTACTAAAGT-GCGTTTACAAAATCACTTTTAAAAAAAAAACAATCCGCCATTATTATTCTTTTTACTGGTAATGCCAAAAAAACTAAAACAGTGAAAACTACTGGTATCGGATAGTACCAATTAAAAAACATAAATATTAATATAAACTAGTCGCCGCAAAAAAAAGGAACACGAAACCGAAAACAGAGAGAACAAAGTGTGAGAAAATGACTAAGTTCATGATATTCAATTATAATAAAAAAATAAGAAAATAGTAAAGTAAGAAAAGTTGACAACAGCCGTGTTTGATAATAATAAATACTAAAATAAAATGCTATTGATGTTATGTAATTAAATAAGACAAACAAGG-TGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACATTAGAATAAAGATATAAATGATAAAATTAGTGCCTTTTTTGAGAAAGAACATTATGTAGTTTGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGATGTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAACTCGACTAGGTATATATTGATACAGTAATAAATAGATACAAATTAAATCAAATAAAAGAGAATATCAAAAAAAAGTAAAATTATTAGATAAAGTAAGCAGAAAAATTATTGGAAGACAACTTTAAGAGTAAATCATAATGAAGTGACTGCAGTTTATGAACGCGGTAACTGTAAATAAGAATTTAGCATGAATCGTAATAAAGAATACACAACAATAGAGGGGATCAATGATATGTATTTCATTTGCGTTGATTTATTTAACACTTGATAAAAATGTCTTGATTATTTTGTACACATTTAAAAATAACTATATATGTATTGTTGATCATCAATCAAATCCCTGGATAATTAGGCATTAGTGAAGGATCTAAAGCTCGATACTGATGATGCATATCACGAGCACCGTTATTTATATCGACCTGTCTAGCGACATCTTCCAAATCATGAC]

[+] EMBL CD075138             [TAATTTCTATATTATAATTATTAATAAAAAAATTACTAAAGT GCGTTTACAAAATCACTTTTAAAAAAAAAACAATCCGCCATTATTATTCTTTTTACTGGTAATGCCAAAAAAACTAAAACAGTGAAAACTACTGGTATCGGATAGTACCAATTAAAAAACATAAATATTAATATAAACTAGTCGCCGCAAAAAAAAGGAACACGAAACCGAAAACAGAGAGAACAAAGTGTGAGAAAATGACTAAGTTCATGATATTCAATTATAATAAAAAAATAAGAAAATAGTAAAGTAAGAAAAGTTGACAACAGCCGTGTTTGATAATAATAAATACTAAAATAAAATGCTATTGATGTTATGTAATTAAATAAGACAAACAAGG TGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACATTAGAATAAAGATATAAATGATAAAATTAGTGCCTTTTTTGAGAAAGAACATTATGTAGTTTGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGATGTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAACTCGACTAGGTATATATTGATACAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD075017             [ aatcctTATATTATAAGAATTAATAAAAAAATTACTAAAGTGGCGTTTTCCAAATCACTTTTAAAAAAAAAACAATCCGCCATTATTATTCTTTTTACTGGTAATGCCAAAAAAACTAAAACAGTGAAAACTACTGGTATCGGATAGTACCAATTAAAAAACATAAATATTAATATAAACTAGTCGCCGCAAAAAAAAGGAACACGAAACCGAAAACAGAGAGAACAAAGTGTGAGAAAATGACTAAGTTCATGATATTCAATTATAATAAAAAAATAAGAAAATAGTAAAGTAAGAAAAGTTGACAACAGCCGTGTTTGATAATAATAAATACTAAAATAAAATGCTATTGATGTTATGTAATTAAATAAGACAAACAAGG TGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACATTAGAATAAAGATATAAATGATAAAATTAGTGCCTTTTTTGAGAAAGAACATTATGTAGTTTGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGATGTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAACTCGACTAGGTATATATTGATACAGTAATAAATAGATACAAATTAAATCAAATAAAAGAGAATATCAAAAAAAAGTAAAATTATTAGATAAAGTAAGCAGAAAAATTATTGGAAGACAACTTTAAGAGTAAATCATAATGAAGTGACTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD081306             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAAATAAGAC AACAAGGNTGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACATTAGAATAAAGATATAAATGATANAATTAGTGCCTTTTNTGAGAAAGAACATTATGTAGTTTGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGATGTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAACTCGACTAGGTATATATTGATACAGTAATAAATAGATACAAATTAAATCAAATAAAAGAGAATATCAAAAAAAAGTAAAATTATTAGATAAAGTAAGCAGAAAAATTATTGGAAGACAACTTTAAGAGTAAATCATAATGAAGTGACTGCAGTTTATGAACGCGGTAACTGTAAATAAGAATTTAGCATGAATCGTAATAAAGAATACACAACAATAGAGGGGATCAATGATATGTATTTCATTTGCGTTGATTTATTTAACACTTGATAAAAATGTCTTGATTATTTTGTACACATTTAAAAATAACTATATATGTATTGTTGATCATCAATCAAATCCCTGGATAATTAGGCATTAGTGAAGGATCTAAAGCTCGATACTGATGATGCATATCACGAGCACCGTTATTTATATCGACCTGTCTAGCGACATCTTCCAAATCATGAC]
[+] EMBL CD141477             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATATGTATTTCATTTGCGTTGATTTATTTAACACTTGATAAAAATGTCTTGATTATTTTGTACACATTTAAAAATAACTATATATGTATTGTTGATCATCAATCAAATCCCTGGATAATTAGGCATTAGTGAAGGATCTAAAGCTCGATACTGATGATGCATATCACGAGCACCGTTATTTA                                    ]


>consensus_6741#0 TAATTTCTATATTATAATTATTAATAAAAAAATTACTAAAGTGCGTTTACAAAATCACTT TTAAAAAAAAAACAATCCGCCATTATTATTCTTTTTACTGGTAATGCCAAAAAAACTAAA ACAGTGAAAACTACTGGTATCGGATAGTACCAATTAAAAAACATAAATATTAATATAAAC TAGTCGCCGCAAAAAAAAGGAACACGAAACCGAAAACAGAGAGAACAAAGTGTGAGAAAA TGACTAAGTTCATGATATTCAATTATAATAAAAAAATAAGAAAATAGTAAAGTAAGAAAA GTTGACAACAGCCGTGTTTGATAATAATAAATACTAAAATAAAATGCTATTGATGTTATG TAATTAAATAAGACAAACAAGGTGCAGCTTAGTTTACATAGACTTATGTATAAGCAACAT TAGAATAAAGATATAAATGATAAAATTAGTGCCTTTTTTGAGAAAGAACATTATGTAGTT TGTTGATATGAATTCTGTGTAAATCGGTTTGATTACACATACTAAAAATATTTTTTCGAT GTTAATTACAGCCATTCTATGCTACATCATAATAAGAGATAGTTTTAATGATGAATAAAA CTCGACTAGGTATATATTGATACAGTAATAAATAGATACAAATTAAATCAAATAAAAGAG AATATCAAAAAAAAGTAAAATTATTAGATAAAGTAAGCAGAAAAATTATTGGAAGACAAC TTTAAGAGTAAATCATAATGAAGTGACTGCAGTTTATGAACGCGGTAACTGTAAATAAGA ATTTAGCATGAATCGTAATAAAGAATACACAACAATAGAGGGGATCAATGATATGTATTT CATTTGCGTTGATTTATTTAACACTTGATAAAAATGTCTTGATTATTTTGTACACATTTA AAAATAACTATATATGTATTGTTGATCATCAATCAAATCCCTGGATAATTAGGCATTAGT GAAGGATCTAAAGCTCGATACTGATGATGCATATCACGAGCACCGTTATTTATATCGACC TGTCTAGCGACATCTTCCAAATCATGAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)