cluster # 6746

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Schistosoma mansoni
cluster # 6746 cluster # 6746 Sequences # 4 consensus # 3

see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6746#0 length = 729 sequences # 2

consensus_6746#1 length = 728 sequences # 1
consensus_6746#2 length = 691 sequences # 1

consensusID : consensus_6746#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 729
fasta sequence

                              [CAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCGCACTGAATGAAGGAAAATTGGTCCCTTGGCTAAGAATGATCTTTCGAAATCATGTCTTTGTTCAATCTATATATGAACCATGGAGTTATACTTTGAGTACAGGATTCAACGATACTCTACAGTCATTAGTTAAACTAAAGGATTTTGAATTCGCTCTGCCTTATGATTACAGTATTCGTCATTTAAAAGAAATGCATGATGCCTTCTAAATTGCGAAATGTATTTGTAATGTGATGTCCTTTTTTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATCCAGTGATCAGTATATAAACTAACAAAGATCAACATTTTGTTGTTTATCATTTGTCTGAACGTGTAGGTATTTCTTATATATATCTACCTATAATATCTTATATATATCGTATTTGTAATATGTTTGTTTATTTCTTTTGTTGATGTATTATCTCACCTGTATTTTTTGTCGTCCAACATAAGCATTACAATTCATTTAACTCATGTATTAGCATTTGTTTATACGTATATTTATAGCGTGTACTTTGATCTAATCAACCATATTATTGTCTACTTTTGATCGAAAAATGATGATTGTTGTATAATAAACAGGCTTACTGCAGATATATTTTGAATTCTTTGTATTATGTTTACAAAAAATTTCATGTTTATTTATTTCCATATTTTGGAGATTTAATCTGTATCTTGGTTTGT-ATTATGAAATTATNNTCGA]

[+] EMBL CD081143             [CAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCGCACTGAATGAAGGAAAATTGGTCCCTTGGCTAAGAATGATCTTTCGAAATCATGTCTTTGTTCAATCTATATATGAACCATGGAGTTATACTTTGAGTACAGGATTCAACGATACTCTACAGTCATTAGTTAAACTAAAGGATTTTGAATTCGCTCTGCCTTATGATTACAGTATTCGTCATTTAAAAGAAATGCATGATGCCTTCTAAATTGCGAAATGTATTTGTAATGTGATGTCCTTTTTTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATCCAGTGATCAGTATATAAACTAACAAAGATCAACATTTTGTTGTTTATCATTTGTCTGAACGTGTAGGTATTTCTTATATATATCTACCTATAATATCTTATATATATCGTATTTGTAATATGTTTGTTTATTTCTTTTGTTGATGTATTATCTCACCTGTATTTTTTGTCGTCCAACATAAGCATTACAATTCATTTAACTCATGTATTAGCATTTGTTTATACGTATATTTATAGCGTGTACTTTGATCTAATCAACCATATTATTGTCTACTTTTGATCGAAAAATGATGATTGTTGTATAATAAACAGGCTTACTGCAGATATATTTTGAATTCTTTGTATTATGTTTACAAAAAATTTCATGTTTATTTATTTCCATATTTTGGAGATTTAATCTGTATCTTGGTTTGT ATTATGAAATTATNNTCGA]
[-] EMBL CD075091             [                                                                                                                                                            TTAAACTAAAGGA TTTGAATTCGCTCTGCCTTATGATTACAGTATTCGTCATTTAAAAGAAATGCATGATGCCTTCTAAATTGCGAAATGTATTTGTAATGTGATGTCCTTTTTTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATCCAGTGATCAGTATATAAACTAACAAAGATCAACATTTTGTTGTTTATCATTTGTCTGAACGTGTAGGTATTTCTTATATATATCTACCTATAATATCTTATATATATCGTATTTGTAATATGTTTGTTTATTTCTTTTGTTGATGTATTATCTCACCTGTATTTTTTGTCGTCCAACATAAGCATTACAATTCATTTAACTCATGTATTAGCATTTGTTTATACGTATATTTATAGCGTGTACTTTGATCTAATCAACCATATTATTGTCTACTTTTGATCGAAAAATGATGATTGTTGTATAATAAACAGGCTTACTGCAGATATATTTTGAATTCTTTGTATTATGTTTACAAAAAATTTCATGTTTATTTATTTCCATATTTTGGAGATTTAATCTGTATCTTGTTTTGTAATTATGAAAat        ]




>consensus_6746#0
CAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCGCACTGAATGAAGGAAAATTGGTCCCTTGGCTAA
GAATGATCTTTCGAAATCATGTCTTTGTTCAATCTATATATGAACCATGGAGTTATACTT
TGAGTACAGGATTCAACGATACTCTACAGTCATTAGTTAAACTAAAGGATTTTGAATTCG
CTCTGCCTTATGATTACAGTATTCGTCATTTAAAAGAAATGCATGATGCCTTCTAAATTG
CGAAATGTATTTGTAATGTGATGTCCTTTTTTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATCCAG
TGATCAGTATATAAACTAACAAAGATCAACATTTTGTTGTTTATCATTTGTCTGAACGTG
TAGGTATTTCTTATATATATCTACCTATAATATCTTATATATATCGTATTTGTAATATGT
TTGTTTATTTCTTTTGTTGATGTATTATCTCACCTGTATTTTTTGTCGTCCAACATAAGC
ATTACAATTCATTTAACTCATGTATTAGCATTTGTTTATACGTATATTTATAGCGTGTAC
TTTGATCTAATCAACCATATTATTGTCTACTTTTGATCGAAAAATGATGATTGTTGTATA
ATAAACAGGCTTACTGCAGATATATTTTGAATTCTTTGTATTATGTTTACAAAAAATTTC
ATGTTTATTTATTTCCATATTTTGGAGATTTAATCTGTATCTTGGTTTGTATTATGAAAT
TATNNTCGA

consensusID : consensus_6746#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 728
fasta sequence

                              [ATAAAAATGAACTCACTTCATGCACAGGAGATATGGATGACACAGAAAGCGGCTCATGTGAAACATCGGAGTTTCTGTATCCTGAAGCGGAACGCGCTGTGGTACATGTTGTACGTCGATATCTCTGTCCTGCTTTACGTGATCTTATTGAACATGGTCTTATAAAGAAAGCTTTACAGAAAGTTGATGAAAATCCACCTTTGGGTTTAACAAATAAACGAAGCATTTTACTACTTCGTCCTATCCTGAACTGTTTAGACTCAAGATCGAGAAATCACTCAGAAGATAAATTTGAATGCTTAGATTTGAACGATCTATCAAGTGATTACATTGATACAAACTCTTTTTCGGGGTCCCGTTCTAATTGTATAGGAATCCATGCGTGGGATGTATTAATGCGTTTTTATCAGATTAAGAATGGTCCACGTTATAATGAGTCTCCGGTGAAAAAACTTTGTGAAAGCTTCGATTTAGATACAGTTGATGGTAAAACAATCACGAATCGTCAGAAATTTTTCAGTGCAATGGGTAATGTTCTTCAGGGTCACGTGGCATACAAACGCAGTAAAGATGCCAAGTTCAAAGCATTCATTAGTATTGCACTGAATGAAGGAAAATTGGTCCCTTGGCTAAGAATGATCTTTCGAAATCATGTCTTTGTTCAATCTATATATGAACCATGGAGTTATACTTTGAGTACAGGATTCAACGATACTCTACAGTCATTA]

[+] EMBL CD080161             [ATAAAAATGAACTCACTTCATGCACAGGAGATATGGATGACACAGAAAGCGGCTCATGTGAAACATCGGAGTTTCTGTATCCTGAAGCGGAACGCGCTGTGGTACATGTTGTACGTCGATATCTCTGTCCTGCTTTACGTGATCTTATTGAACATGGTCTTATAAAGAAAGCTTTACAGAAAGTTGATGAAAATCCACCTTTGGGTTTAACAAATAAACGAAGCATTTTACTACTTCGTCCTATCCTGAACTGTTTAGACTCAAGATCGAGAAATCACTCAGAAGATAAATTTGAATGCTTAGATTTGAACGATCTATCAAGTGATTACATTGATACAAACTCTTTTTCGGGGTCCCGTTCTAATTGTATAGGAATCCATGCGTGGGATGTATTAATGCGTTTTTATCAGATTAAGAATGGTCCACGTTATAATGAGTCTCCGGTGAAAAAACTTTGTGAAAGCTTCGATTTAGATACAGTTGATGGTAAAACAATCACGAATCGTCAGAAATTTTTCAGTGCAATGGGTAATGTTCTTCAGGGTCACGTGGCATACAAACGCAGTAAAGATGCCAAGTTCAAAGCATTCATTAGTATTGCACTGAATGAAGGAAAATTGGTCCCTTGGCTAAGAATGATCTTTCGAAATCATGTCTTTGTTCAATCTATATATGAACCATGGAGTTATACTTTGAGTACAGGATTCAACGATACTCTACAGTCATTA]




>consensus_6746#1
ATAAAAATGAACTCACTTCATGCACAGGAGATATGGATGACACAGAAAGCGGCTCATGTG
AAACATCGGAGTTTCTGTATCCTGAAGCGGAACGCGCTGTGGTACATGTTGTACGTCGAT
ATCTCTGTCCTGCTTTACGTGATCTTATTGAACATGGTCTTATAAAGAAAGCTTTACAGA
AAGTTGATGAAAATCCACCTTTGGGTTTAACAAATAAACGAAGCATTTTACTACTTCGTC
CTATCCTGAACTGTTTAGACTCAAGATCGAGAAATCACTCAGAAGATAAATTTGAATGCT
TAGATTTGAACGATCTATCAAGTGATTACATTGATACAAACTCTTTTTCGGGGTCCCGTT
CTAATTGTATAGGAATCCATGCGTGGGATGTATTAATGCGTTTTTATCAGATTAAGAATG
GTCCACGTTATAATGAGTCTCCGGTGAAAAAACTTTGTGAAAGCTTCGATTTAGATACAG
TTGATGGTAAAACAATCACGAATCGTCAGAAATTTTTCAGTGCAATGGGTAATGTTCTTC
AGGGTCACGTGGCATACAAACGCAGTAAAGATGCCAAGTTCAAAGCATTCATTAGTATTG
CACTGAATGAAGGAAAATTGGTCCCTTGGCTAAGAATGATCTTTCGAAATCATGTCTTTG
TTCAATCTATATATGAACCATGGAGTTATACTTTGAGTACAGGATTCAACGATACTCTAC
AGTCATTA

consensusID : consensus_6746#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 691
fasta sequence

                              [GTTTTTTAGGATAACCAGTAAGACACGGGACATGACAAAGATGACAGAGTCATAACACAAATATTTGCGATATTGAGCAAGTCAGTAAACTGTTTATGGCAGTTTTTACTTAAAACTGTACTCATTCAAAGATATTGTTAATTGTTTTGTCAAGTATTGGATTCAACCTAAATAATAACAACCTATGAGTAGCTGGCTGAGCTTCAATAACATTTTTAGAATGAAAAACATTTGAACTACTTTTTGAAACAAAATTTAGCTGTTTGAGAAACGTATGGAATTAAATGGTGTTTTGTCAAACATATTAGATTTAACTAACACTGTAAACCAACATTATTCAATGAAACCAGCTATTACGAAGTGAATTATTCTTGCTGTAAATAAACCAGAATAAAATATTCAATAATCAAACAATTTTCCTTTATTGTCCTTTATCTAATATCCTGTTTTATTTCTCATACAAATAGGATTCAACGATACTCTACAGTCATTAGTTAAACTAAAGGATTTTGAATTCGCTCTGCCTTATGATTACAGTATTCGTCATTTAAAAGAAATGCATGATGCCTTCTAAATTGCGAAATGTATTTGTAATGTGATGTCCTTTTTTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATCCAGTGATCAGTATATAAACTAACANAGATCAACATTTTGTTGTTTATCATTTGTCT]

[+] EMBL CD081261             [GTTTTTTAGGATAACCAGTAAGACACGGGACATGACAAAGATGACAGAGTCATAACACAAATATTTGCGATATTGAGCAAGTCAGTAAACTGTTTATGGCAGTTTTTACTTAAAACTGTACTCATTCAAAGATATTGTTAATTGTTTTGTCAAGTATTGGATTCAACCTAAATAATAACAACCTATGAGTAGCTGGCTGAGCTTCAATAACATTTTTAGAATGAAAAACATTTGAACTACTTTTTGAAACAAAATTTAGCTGTTTGAGAAACGTATGGAATTAAATGGTGTTTTGTCAAACATATTAGATTTAACTAACACTGTAAACCAACATTATTCAATGAAACCAGCTATTACGAAGTGAATTATTCTTGCTGTAAATAAACCAGAATAAAATATTCAATAATCAAACAATTTTCCTTTATTGTCCTTTATCTAATATCCTGTTTTATTTCTCATACAAATAGGATTCAACGATACTCTACAGTCATTAGTTAAACTAAAGGATTTTGAATTCGCTCTGCCTTATGATTACAGTATTCGTCATTTAAAAGAAATGCATGATGCCTTCTAAATTGCGAAATGTATTTGTAATGTGATGTCCTTTTTTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATCCAGTGATCAGTATATAAACTAACANAGATCAACATTTTGTTGTTTATCATTTGTCT]




>consensus_6746#2
GTTTTTTAGGATAACCAGTAAGACACGGGACATGACAAAGATGACAGAGTCATAACACAA
ATATTTGCGATATTGAGCAAGTCAGTAAACTGTTTATGGCAGTTTTTACTTAAAACTGTA
CTCATTCAAAGATATTGTTAATTGTTTTGTCAAGTATTGGATTCAACCTAAATAATAACA
ACCTATGAGTAGCTGGCTGAGCTTCAATAACATTTTTAGAATGAAAAACATTTGAACTAC
TTTTTGAAACAAAATTTAGCTGTTTGAGAAACGTATGGAATTAAATGGTGTTTTGTCAAA
CATATTAGATTTAACTAACACTGTAAACCAACATTATTCAATGAAACCAGCTATTACGAA
GTGAATTATTCTTGCTGTAAATAAACCAGAATAAAATATTCAATAATCAAACAATTTTCC
TTTATTGTCCTTTATCTAATATCCTGTTTTATTTCTCATACAAATAGGATTCAACGATAC
TCTACAGTCATTAGTTAAACTAAAGGATTTTGAATTCGCTCTGCCTTATGATTACAGTAT
TCGTCATTTAAAAGAAATGCATGATGCCTTCTAAATTGCGAAATGTATTTGTAATGTGAT
GTCCTTTTTTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATCCAGTGATCAGTATATAAACTAACAN
AGATCAACATTTTGTTGTTTATCATTTGTCT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6746#0      CAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCGCACTGAATG-AAGGAAAATTGGTCCCTTGGCTA 59
consensus_6746#2      ----------GTTTTTTAGGATAAC--CAGTAAGAC-ACGGGACATGACAAAGATGACAG 47
consensus_6746#1      --------------ATAAAAATGAACTCACTTCATGCACAGGAGATATGGATGACACAGA 46
                                       *  *  *   ** *      *  * * **              

consensus_6746#0      AGAATGATCTTTCGAAATCATGTCTTTGTTCAA-TCTATATATGAACCATGGAGTTATAC 118
consensus_6746#2      AGTCATAACACAAATATTTGCGATATTGAGCAAGTCAGTAAACTGTTTATGGCAGTTTTT 107
consensus_6746#1      AAGCGGCTCATGTGAAACATCGGAGTTTCTGTA-TCCTGAAGCGGAACGCGCTGTGGTAC 105
                      *       *      *     *   **     * **   *          *      *  

consensus_6746#0      TTTGAGTACAGGATTCAACGATACTCTACAGTCATTAGTTAAACTAAAGGATTTTGAATT 178
consensus_6746#2      ACTTAAAACTGTACTCATTCAAA----GATATTGTTAATTGTTTTGTCAAGTATTGGATT 163
consensus_6746#1      ATGTTGTACG----TCGATATCTCTGTCCTGCT-TTACGTGATCT------TATTGAACA 154
                             **     **                  ***  *    *      * *** *  

consensus_6746#0      CGCTCTGCCTTATGATTACAGTATTCGTCATTTAAAAGAAATGCATGATGCCTTCTA-AA 237
consensus_6746#2      CAACCTAAATAATAACAACC-TATGAGTAGCTGGCTGAGCTTCAATAACATTTTTAG-AA 221
consensus_6746#1      TGGTCT-TATAAAGAAAGCTTTACAGAAAGTTGATGAAAATCCACCTTTGGGTTTAACAA 213
                          **   * *  *   *  **        *                    **    **

consensus_6746#0      TTGCGAAATGTATTTGTAATGTGATGTCCTTTTTTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATC 297
consensus_6746#2      T---GAAAAACATTTGAACTA-------CTTTTTGAAACAAAATTTAGCTGTTTGAGA-- 269
consensus_6746#1      ATAAACGAAGCATTT-TACTACTTCGTCCTATCCTGAACTGTTTAGACTCAAGATCGAGA 272
                             *   ****  * *        ** *                         *  

consensus_6746#0      CAGTGATCAGTATATAAACTAACAAAGATCAACATTTTGTTGTTTATCATTTGTCTGAAC 357
consensus_6746#2      -AACGTATGGAATTAAATGGTGTTTTGTCAAACATATTAGATTTAACTAACACTGTAAAC 328
consensus_6746#1      AATCACTCAGAAGATAAATTTG-AATGCTTAGATTTGAACGATCTATCAAGTGATTACAT 331
                       *       * *   **         *   *   *       *  *  *      *  * 

consensus_6746#0      GTGTAGGTATTTCTTATATATATCTACCTATAATATCTTATATATATCGTATTTGTAATA 417
consensus_6746#2      CAACA-----TTATTCAATGAAACCAGCTATTACGAAGTGAATTATTCTTGCTGTAAATA 383
consensus_6746#1      TGATACAAACTCTTTTTCGGGGTCCCGTTCTAATTGTATAGGAAT-CCATGCGTGGGATG 390
                          *     *  **        *    * * *     *        * *       ** 

consensus_6746#0      TGTTTGTTTATTTCTTTTGTTGATGTATTATCTCACCTGTATTTTTTGTCGTCCAACATA 477
consensus_6746#2      AACCAGAATAAAATATTCAATAATCAAACAATTTTCCTTTATTGTCCTTTATCTAATATC 443
consensus_6746#1      TATTAATGCGTTTTTATCAGATTAAGAATGGTCCACGT-TATAATGAGTCTCCGGTGAAA 449
                                      *         *        * * ***  *   *   *    *  

consensus_6746#0      A-GCATTACAATTCATTTAACTCATGTATTAGCATTTGTTTA-TACGTAT-ATTTATAGC 534
consensus_6746#2      CTGTTTTATTTCTCATACAAAT-AGGATTCAACGATACTCTA-CAGTCATTAGTTAAACT 501
consensus_6746#1      AAACTTTGTGAAAGCTTCGATTTAGATACAGTTGATGGTAAAACAATCACGAATCGT--C 507
                           **        *   * * *           *  *  *  *   *  * *      

consensus_6746#0      GT-GTACTTTGA-TCTAATCAACCATATTATT--GTC-TACTTTTGATCGAAA------A 583
consensus_6746#2      AAAGGATTTTGAATTCGCTCTGCCTTATGATT--ACAGTATTCGTCATTTAAA------A 553
consensus_6746#1      AGAAATTTTTCAGTGCAATGGGTAATGTTCTTCAGGGTCACGTGGCATACAAACGCAGTA 567
                             *** * *    *      * *  **       *      **  ***      *

consensus_6746#0      ATGATGATTGTTGTATAATAAACAGGCTTACTGCA-------GATATATTTTGAATTCTT 636
consensus_6746#2      GAAATGCATGATGCCTTCTAAATTG-CGAAATGTA-------TTTGTAATGTGATGTCCT 605
consensus_6746#1      AAGATGCCAAGTTCAAAGCATTCATTAGTATTGCACTGAATGAAGGAAAATTGGTCCCTT 627
                         ***     *       *         * ** *            *   **    * *

consensus_6746#0      TGT-----ATTATGTTTACAAAAAAT-TTCATGTTTA-TTTATTTCCATATTTTGGAGAT 689
consensus_6746#2      TTT-----TTCGTTTCATCTTTTTTTCTTCATATCCA-GTGATCAGTATATAAACTAACA 659
consensus_6746#1      GGCTAAGAATGATCTTTCGAAATCATGTCTTTGTTCAATCTATATATGAACCATGGAGTT 687
                               *  * *          * *   * *  *    **      *      *   

consensus_6746#0      TTAATCTGTATCTTGGTTTGTATTATGAAATTATNNTCGA-- 729
consensus_6746#2      NAGATCAACATTTTGTTGTTTATCAT----TTGTCT------ 691
consensus_6746#1      ATACTTTGAGTACAGGATTCAACGAT-ACTCTACAGTCATTA 728
                          *     *   *   *  *  **     *