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Schistosoma mansoni
cluster # 6749 cluster # 6749       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6749#0 length = 828 sequences # 4  

consensusID : consensus_6749#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 828
fasta sequence
                              [GAGGACTGCTTTGGGTTTCGATACATTTCTCGTTATGCTTCATGGTGTACGGGGTCCTTTTAAATCCCCAAGCTTAAGTGTCGATAGCCTTACTCCAGATATTTCTTCTCTCAGTTTTGACGAAGCGATTCCCAACAAAGAAGATTCTTTCAAAAAAGCTAGAGCCATAAGTGGCTCACTTTTGGGTTGCTATTTCTGCAATGATGTGATCGGACCTATGAATTCAACGCGCAACCGCAGTCTCGATCAACAATGTACCGTTACTCGACCGGGAGTATCTATGGTCGCAGCTGCTCTCGCTGTTGAGTTGATGGTAAGTGTACTTCAACATCCACTCCTCTATGAGGCTCCAGCAGATACACTATCTCAAGACTTTTCCAGCTTGGATTCTGCTAAACTGTCTCTTGGTGTTGTTCCCCATCAAATAAGGGGCTTTCTTTCTCATTACACCCAGGTTTTGCCTGCAACATTGGCATTCACCAAGTGCTCTGCATGTTCCCAGTCTGTACTGAACGCTTACAAGGCCAATGGGTATACCTTTTTACGACAGGTCTTTGATGATGCTTCTTATCTTGAAAGGATATGCGGTTTACAGGATCTTCATGATGAAATTAACACTGAGTCAATTTTGATGTTAAGTGACACTGATGACTGACATTTATCTGTTTGTCTTTTTTATTTTATGAAGTGTTCAAATCATGTTAATTAAGATTACGTCTTATTAATTTTTATCTCAATGAACACTTTACTTCTCTATAACTTAGTAGTTCTTTGTGATCATATTGAGGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD081334             [GAGGACTGCTTTGGGTTTCGATACATTTCTCGTTATGCTTCATGGTGTACGGGGTCCTTTTAAATCCCCAAGCTTAAGTGTCGATAGCCTTACTCCAGATATTTCTTCTCTCAGTTTTGACGAAGCGATTCCCAACAAAGAAGATTCTTTCAAAAAAGCTAGAGCCATAAGTGGCTCACTTTTGGGTTGCTATTTCTGCAATGATGTGATCGGACCTATGAATTCAACGCGCAACCGCAGTCTCGATCAACAATGTACCGTTACTCGACCGGGAGTATCTATGGTCGCAGCTGCTCTCGCTGTTGAGTTGATGGTAAGTGTACTTCAACATCCACTCCTCTATGAGGCTCCAGCAGATACACTATCTCAAGACTTTTCCAGCTTGGATTCTGCTAAACTGTCTCTTGGTGTTGTTCCCCATCAAATAAGGGGCTTTCTTTCTCATTACACCCAGGTTTTGCCTGCAACATTGGCATTCACCAAGTGCTCTGCATGTTCCCAGTCTGTACTGAACGCTTACAAGGCCAATGGGTATACCTTTTTACGACAGGTCTTTGATGATGCTTCTTATCTTGAAAGGATATGCGGTTTACAGGATCTTCATGATG AATTAACACTGAGTCAATTTTGATGTTAAGCGACACTGATGACTGACATTCATCTGTTTGCCTTTTTTATTTTATGAAGCGTTCAAATCATGTTAATTAACATACCGCCTTATT ATTTTTAT TCAATGAAC CTTTACTCCTCTAT ACCTAGCAGTTCTTTGCGATCAT                                               ]
[+] EMBL CD084231             [   ggCTGCTTTGGGTTTCGATACATTTCTCGTTATGCGTCATGGTGTACGGGGTCCTTTTAAATCCCCAAGCTTAAGTGTCGATAGCCTTACTCCAGATATTTCTTCTCTCAGTTTTGACGAAGCGATTCCCAACAAAGAAGATTCTTTCAAAAAAGCTAGAGCCATAAGTGGCTCACTTTTGGGTTGCTATTTCTGCAATGATGTGATCGGACCTATGAATTCAACGCGCAACCGCAGTCTCGATCAACAATGTACCGTTACTCGACCGGGAGTATCTATGGTCGCAGCTGCTCTCGCTGTTGAGTTGATGGTAAGTGTACTTCAACATCCACTCCTCTATGAGGCTCCAGCAGATACACTATCTCAAGACTTTTCCAGCTTGGATTCTGCTAAACTGTCTCTTGGTGTTGTTCCCCATCAAATAAGGGGCTTTCTTTCTCATTACACCCAGGTTTTGCCTGCAACATTGGCATTCACCAAGTGCTCTGCATGTTCCCAGTCTGTACTGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD075167             [                                                                                                                                                                              CTCACTTTTGGGTTGCTATTTCTGCAATGATGTGATCGGACCTATGAATTCAACGCGCAACCGCAGTCTCGATCAACAATGTACCGTTACTCGACCGGGAGTATCTATGGTCGCAGCTGCTCTCGCTGTTGAGTTGATGGTAAGTGTACTTCAACATCCACTCCTCTATGAGGCTCCAGCAGATACACTATCTCAAGACTTTTCCAGCTTGGATTCTGCTAAACTGTCTCTTGGTGTTGTTCCCCATCAAATAAGGGGCTTTCTTTCTCATTACACCCAGGTTTTGCCTGCAACATTGGCATTCACCAAGTGCTCTGCATGTTCCCAGTCTGTACTGAACGCTTACAAGGCCAATGGGTATACCTTTTTACGACAGGTCTTTGATGATGCTTCTTATCTTGAAAGGATATGCGGTTTACAGGATCTTCATGATGAAATTAACACTGAGTCAATTTTGATGTTAAGTGACACTGATGACTGACATTTATCTGTTTGTCTTTTTTATTTTATGAAGTGTTCAAATCATGTTAATTAAGATTACGTCTTATTAATTTTTATCTCAATGAACACTTTACTTCTCTATAACTTAGTAGTTCTTTGTAAT ATATT                                            ]
[-] EMBL AI395174             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTATTCCCCATCAAATAAGGGGCTTTCTTTCTCATTACACCCAGGTTTTGCCTGCAACATTGGCATTCACCAAGTGCTCTGCATGTTCCCAGTCTGTACTGAACGCTTACAAGGCCAATGGGTATACCTTTTTACGACAGGTCTTTGATGATGCTTCTTATCTTGAAAGGATATGCGGTTTACAGGATCTTCATGATGAAATTAACACTGAGTCAATTTTGATGTTAAGTGACACTGATGACTGACATTTATCTGTTTGTCTTTTTTATTTTATGAAGTGTTCAAATCATGTTAATTAAGATTACGTCTTATTAATTTTTATCTCAATGAACACTTTACTTCTCTATAACTTAGTAGTTCTTTGTGAATATATTGAGGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_6749#0 GAGGACTGCTTTGGGTTTCGATACATTTCTCGTTATGCTTCATGGTGTACGGGGTCCTTT TAAATCCCCAAGCTTAAGTGTCGATAGCCTTACTCCAGATATTTCTTCTCTCAGTTTTGA CGAAGCGATTCCCAACAAAGAAGATTCTTTCAAAAAAGCTAGAGCCATAAGTGGCTCACT TTTGGGTTGCTATTTCTGCAATGATGTGATCGGACCTATGAATTCAACGCGCAACCGCAG TCTCGATCAACAATGTACCGTTACTCGACCGGGAGTATCTATGGTCGCAGCTGCTCTCGC TGTTGAGTTGATGGTAAGTGTACTTCAACATCCACTCCTCTATGAGGCTCCAGCAGATAC ACTATCTCAAGACTTTTCCAGCTTGGATTCTGCTAAACTGTCTCTTGGTGTTGTTCCCCA TCAAATAAGGGGCTTTCTTTCTCATTACACCCAGGTTTTGCCTGCAACATTGGCATTCAC CAAGTGCTCTGCATGTTCCCAGTCTGTACTGAACGCTTACAAGGCCAATGGGTATACCTT TTTACGACAGGTCTTTGATGATGCTTCTTATCTTGAAAGGATATGCGGTTTACAGGATCT TCATGATGAAATTAACACTGAGTCAATTTTGATGTTAAGTGACACTGATGACTGACATTT ATCTGTTTGTCTTTTTTATTTTATGAAGTGTTCAAATCATGTTAATTAAGATTACGTCTT ATTAATTTTTATCTCAATGAACACTTTACTTCTCTATAACTTAGTAGTTCTTTGTGATCA TATTGAGGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)