cluster # 6786

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Schistosoma mansoni
cluster # 6786 cluster # 6786 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6786#0 length = 897 sequences # 4
consensusID : consensus_6786#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 897
fasta sequence
                              [GAGGACCAATATGCTTCCCGATGTTGAAAATAAACGTTTGTTTTCATGTATAGTATCTTTTACTGCTTTCGGATTTTGCTCAAACTTCATTTCTTTTGTCTCACCTTATTGGATCCAGTCAGTTCCAGAAGCTAACAGCCAATTCCAGAGAATAGGTCTTTGGACTGTTTGTTTTGATGGATATATGCGACCTGGGTTATATGATAAGGCATATTTCGGCTGCTACTACATTTATTATGTGATCTATGACCGTATAAGAGATTGGCTAAATCCAATATGGTTATATACAATACAAGTTACTTCATCTTGTGGAGTTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGCCGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCGTTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAGTTTTATTTGTACATTTATCGGTTTCATAATAAGTTTTATTACATATATTAAATTGAGTGATTTAATGAATCAACAGAATACAAATGANAATCTACTAAATGATGAAGAGAAAATGGGTATTAGTTCACCACCACNCACCACCACCACCAATATCACATACTTCTATATTAAATGAACCAAATTATTATACAGAACCACGTTATATACCTGATCTACCACAATCAGCATTAAGTTATATTGATAGTTCAAATAAAAATTGGCATATAAAAGATTCTGAAATTACACATAATTTAAATAAACAAAATGATCATTTTAATAATTCAACAAATTCATATTTGAATACTTGATCTTATTGAA]

[+] EMBL CD082085             [GAGGACCAATATGCTTCCCGATGTTGAAAATAAACGTTTGTTTTCATGTATAGTATCTTTTACTGCTTTCGGATTTTGCTCAAACTTCATTTCTTTTGTCTCACCTTATTGGATCCAGTCAGTTCCAGAAGCTAACAGCCAATTCCAGAGAATAGGTCTTTGGACTGTTTGTTTTGATGGATATATGCGACCTGGGTTATATGATAAGGCATATTTCGGCTGCTACTACATTTATTATGTGATCTATGACCGTATAAGAGATTGGCTAAATCCAATATGGTTATATACAATACAAGTTACTTCATCTTGTGGAGTTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGCCGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCGTTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAGTTTTATTTGTACATTTATCGGTTTCATAATAAGTTTTATTACATATATTAAATTGAGTGATTTAATGAATCAACAGAATACAAATGANAATCTACTAAATGATGAAGAGAAAATGGGTATT                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD083866             [        acgaggcTCCCGATGTTGAAAATAAACG TTGTTTTCATGTATAGTATTTTTTACTGCTTTCGGATTTTGCTCAAACTTCATTTCTTTTGTCTCACCTTATTGGATCCAGTCAGTTCCAGAAGCTAACAGCCAATTCCAGAGAATAGGTCTTTGGACTGTTTGTTTTGATGGATATATGCGACCTGGGTTATATGATAAGGCATATTTCGGCTGCTACTACATTTATTATGTGATCTATGACCGTATAAGAGATTGGCTAAATCCAATATGGTTATATACAATACAAGTTACTTCATCTTGTGGAGTTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGCCGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD075700             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGCCGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCGTTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAGTTTTATTTGTACATTTATCGGTTTCATAATAAGTTTTATTACATATATTAAATTGAGTGATTTAATGAATCAACAGAATACAAATGAAAATCTACTAAATGATGAAGAGAAAATGGGTATTAGTTCACCACCACNCACCACCACCACCAATATCACATACTTCTATATTAAATGAACCAAATTATTATACAGAACCACGTTATATACCTGATCTACCACAATCAGCATTAAGTTATATTGATAGTTCAAATAAAAATTGGCATATAAAAGATTCTGAAATTACACATAATTTAAATAAACAAAATGATCATTTTAATAATTCAACAAATTCATATTTGAATACTTGATCTTATTGAA]
[-] EMBL CD168397             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAAGTGTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCGTTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAGTTTTATTTGTACATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_6786#0
GAGGACCAATATGCTTCCCGATGTTGAAAATAAACGTTTGTTTTCATGTATAGTATCTTT
TACTGCTTTCGGATTTTGCTCAAACTTCATTTCTTTTGTCTCACCTTATTGGATCCAGTC
AGTTCCAGAAGCTAACAGCCAATTCCAGAGAATAGGTCTTTGGACTGTTTGTTTTGATGG
ATATATGCGACCTGGGTTATATGATAAGGCATATTTCGGCTGCTACTACATTTATTATGT
GATCTATGACCGTATAAGAGATTGGCTAAATCCAATATGGTTATATACAATACAAGTTAC
TTCATCTTGTGGAGTTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGC
CGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTT
CACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCG
TTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAG
TTTTATTTGTACATTTATCGGTTTCATAATAAGTTTTATTACATATATTAAATTGAGTGA
TTTAATGAATCAACAGAATACAAATGANAATCTACTAAATGATGAAGAGAAAATGGGTAT
TAGTTCACCACCACNCACCACCACCACCAATATCACATACTTCTATATTAAATGAACCAA
ATTATTATACAGAACCACGTTATATACCTGATCTACCACAATCAGCATTAAGTTATATTG
ATAGTTCAAATAAAAATTGGCATATAAAAGATTCTGAAATTACACATAATTTAAATAAAC
AAAATGATCATTTTAATAATTCAACAAATTCATATTTGAATACTTGATCTTATTGAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case