These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6787#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 872 fasta sequence [GACTAATCCTTTGTTTTTCGTATAAACCAGCATCTAATAACACTAATATTAACCATAATAGTATTAGTATATATCAGTAAACCAGATAAGATTAAATAAGTACATTACTCTTTGTACAAATATTGTATTACGCTCTCACTTCTTCTTATTGAACCATGTTTAATTTGCCCAAACTCTCGAGGTACCTCATGGTCCTATTTATTTCTATATTCTGTGTCTGATTAATGTATTTGTGTATCTGCATAGAAACCTCCCATTATTATTATTATTATTATTACTCAATATGTGTATAAACAAATAAGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTTTGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAAACCATATTTAATAACAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTATTAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTNTAA-TT-TTTTTCTTCACTAGTTC-A-CATTATTTATGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCATG] [+] EMBL CD082131 [GACTAATCCTTTGTTTTTCGTATAAACCAGCATCTAATAACACTAATATTAACCATAATAGTATTAGTATATATCAGTAAACCAGATAAGATTAAATAAGTACATTACTCTTTGTACAAATATTGTATTACGCTCTCACTTCTTCTTATTGAACCATGTTTAATTTGCCCAAACTCTCGAGGTACCTCATGGTCCTATTTATTTCTATATTCTGTGTCTGATTAATGTATTTGTGTATCTGCATAGAAACCTCCCATTATTATTATTATTATTATTACTCAATATGTGTATAAACAAATAAGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTTTGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAAACCATATTTAATAACAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAAT ATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTG GGTTAGAAGTAGCNTTGNTC ACTTA TAATCTCA A TGACTG ATATAGG TNTAA TT TTTNTCT ACTAG TC A CA TA TTATG ATCAC TGT CATGG TAAT GAT ] [+] EMBL CD082228 [ aaacTATTTCTAT TTCTGTGTCTGATTAATGTTTTTGTGTATCTGCATAAACACCTCCCATTATTATTATTATTATTATTACTCAATATGTGTATAAACAAATAAGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTTTGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAAACCATATTTAATAACAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTATTAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTNTAA TTNTTTTTCTTCACTAGTTCAA CATTATTTATGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCAT ] [-] EMBL CD075746 [ TAAACAAATAAGTGTATTGTGCATAAACTTTGTACTGGTGAGTGTTCGCTTCCTCTCTGTGTCTGTCCTTTGGCTTGTGTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTACCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAACCCATATTTAATACCAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGACAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTATTAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTTTAATTT TTTTTCTTCACTAGTTCAA CATTATTTATGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCATG] [-] EMBL CD075839 [ GTGTTTCTTTTTGATACTCTTTGCTGTTTCAATGTATCTAACTGCTAATACAGTCAGTGTAATTTTTCATGTCACCACTTTCTCTTGGTCTCTTCTTATAGTTCTGTTTTGTTTCATCATTCCCTTTTCTGAATTTTTATCTATCGTATTGTCCTTCTCTGTTTCTCGCGCATATTCATGTTTTATTAAGAAACCCATATTTAATACCAAAAAATAGATGTATTTTTTAAATTTTATTTAGTTGAAAAGATATTCTACAATTTTTGGTACTTTTGACTCAACTGTGCCAGTAATATCGGGAAGTTGTTAATCTATTCGAAAATAATCTGAATAACCTACGTTGAACTAATCGATCATCTGACATTCTTATTTCAGTTGTTATTGTGTTTAGAGGTAGCTTTGTTCAACTTATTAATCTCATATTGACTGTATATAGGTTTTAATTT TTTTTCTTCACTAGTTC ACCATTATTTATGTATCACTTGTTACATGGTTAATAGATCATG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||